RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366686.1

CCSAP-202, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CCSAP, Length 4,399 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-202ENST00000366686 PLP1P60201 277 aa2.21□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 UBE2G2P60604 165 aa2.21□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 SRPXP78539 464 aa2.21□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 ST3GAL1Q11201 340 aa2.21□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 ITGA9Q13797 1035 aa2.21□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 GPNMBQ14956 572 aa2.21□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa2.21□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 SLC35E4Q6ICL7 350 aa2.21□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 TMEM53Q6P2H8 277 aa2.21□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 PAQR6Q6TCH4 344 aa2.21□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa2.21□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 OLIG3Q7RTU3 272 aa2.21□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 COMMD7Q86VX2 200 aa2.21□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 SKA3Q8IX90 412 aa2.21□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 FBXL16Q8N461 479 aa2.21□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 FTMTQ8N4E7 242 aa2.21□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 MMGT1Q8N4V1 131 aa2.21□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 OR4M2Q8NGB6 313 aa2.21□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 OR4L1Q8NH43 312 aa2.21□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 SPATA22Q8NHS9 363 aa2.21□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 S100ZQ8WXG8 99 aa2.21□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 DCUN1D4Q92564 292 aa2.21□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 LGALS12Q96DT0 336 aa2.21□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 PELI1Q96FA3 418 aa2.21□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 RNF170Q96K19 258 aa2.21□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 C12orf42Q96LP6 360 aa2.21□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 AGAP4Q96P64 663 aa2.21□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 P2RY13Q9BPV8 354 aa2.21□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 TMEM246Q9BRR3 403 aa2.21□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 LRRC19Q9H756 370 aa2.21□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 TLE6Q9H808 572 aa2.21□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF302Q9NR11 478 aa2.21□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 RNF24Q9Y225 148 aa2.21□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa2.21□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 OR51B4Q9Y5P0 310 aa2.21□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 CACNA1CQ13936 2221 aa2.21□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 ABCC12Q96J65 1359 aa2.21□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 MED23Q9ULK4 1368 aa2.21□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 MICAL3Q7RTP6 2002 aa2.21□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 A0A1W2PPV4 95 aa2.21□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa2.21□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 OR6C70A6NIJ9 312 aa2.21□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa2.21□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 F5H6K3 240 aa2.21□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 CCL24O00175 119 aa2.21□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 PHYHO14832 338 aa2.21□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 TAPBPO15533 448 aa2.21□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 SERPINB7O75635 380 aa2.21□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 SULT1C4O75897 302 aa2.21□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 OR2B3O76000 313 aa2.21□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 PTHP01270 115 aa2.21□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 VTNP04004 478 aa2.21□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 IFNA6P05013 189 aa2.21□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 F7P08709 466 aaPredicted RBP2.21□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP2.21□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 ACKR3P25106 362 aa2.21□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 IMPA1P29218 277 aa2.21□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 OXTRP30559 389 aa2.21□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 NTSP30990 170 aa2.21□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 VHLP40337 213 aa2.21□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 RANP62826 216 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 PAX5Q02548 391 aa2.21□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 KLRC3Q07444 240 aa2.21□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 SIGLEC14Q08ET2 396 aa2.21□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP2.21□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 GNA13Q14344 377 aa2.21□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 HNF4GQ14541 408 aa2.21□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 HLFQ16534 295 aa2.21□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 ACKR1Q16570 336 aa2.21□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 Q1RN00 199 aa2.21□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 RGS21Q2M5E4 152 aa2.21□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa2.21□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 YIF1BQ5BJH7 314 aa2.21□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 PDZD11Q5EBL8 140 aa2.21□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 LRRC73Q5JTD7 316 aa2.21□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa2.21□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa2.21□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 SIGIRRQ6IA17 410 aa2.21□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 P4HA3Q7Z4N8 544 aa2.21□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 DHDDSQ86SQ9 333 aa2.21□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 MUC15Q8N387 334 aa2.21□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 FGFRL1Q8N441 504 aa2.21□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 SCCPDHQ8NBX0 429 aa2.21□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 M1APQ8TC57 530 aa2.21□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 C16orf78Q8WTQ4 265 aa2.21□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 RORBQ92753 470 aa2.21□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP2.21□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 CCDC126Q96EE4 140 aa2.21□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 PPP3R2Q96LZ3 170 aa2.21□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 FOPNLQ96NB1 174 aa2.21□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 IFT27Q9BW83 186 aa2.21□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP2.21□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.3 ms