RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362817.1

RNU1-38P-201, Transcript of RNA, U1 small nuclear 38, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU1-38P, Length 144 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU1-38P-201ENST00000362817 ZNF426Q9BUY5 554 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU1-38P-201ENST00000362817 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU1-38P-201ENST00000362817 ACTR6Q9GZN1 396 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU1-38P-201ENST00000362817 OR10A4Q9H209 315 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU1-38P-201ENST00000362817 ADA2Q9NZK5 511 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU1-38P-201ENST00000362817 FAM30AQ9NZY2 134 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU1-38P-201ENST00000362817 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
RNU1-38P-201ENST00000362817 B3GAT1Q9P2W7 334 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU1-38P-201ENST00000362817 CD300AQ9UGN4 299 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU1-38P-201ENST00000362817 RASD1Q9Y272 281 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU1-38P-201ENST00000362817 VPS13CQ709C8 3753 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU1-38P-201ENST00000362817 TEX15Q9BXT5 2789 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU1-38P-201ENST00000362817 MS4A18H0YCH9 400 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU1-38P-201ENST00000362817 PDLIM1O00151 329 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU1-38P-201ENST00000362817 LYZL6O75951 148 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU1-38P-201ENST00000362817 VAMP5O95183 116 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU1-38P-201ENST00000362817 OR5F1O95221 314 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU1-38P-201ENST00000362817 GOSR1O95249 250 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU1-38P-201ENST00000362817 ZNF682O95780 498 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU1-38P-201ENST00000362817 SERPINA1P01009 418 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU1-38P-201ENST00000362817 ITGA5P08648 1049 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU1-38P-201ENST00000362817 PPP3CBP16298 524 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU1-38P-201ENST00000362817 LOXP28300 417 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
RNU1-38P-201ENST00000362817 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
RNU1-38P-201ENST00000362817 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
RNU1-38P-201ENST00000362817 TAS2R41P59536 307 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU1-38P-201ENST00000362817 ITGADQ13349 1161 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU1-38P-201ENST00000362817 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
RNU1-38P-201ENST00000362817 MS4A18Q3C1V0 323 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU1-38P-201ENST00000362817 TSPO2Q5TGU0 170 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU1-38P-201ENST00000362817 TMEM225Q6GV28 225 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU1-38P-201ENST00000362817 GLYATQ6IB77 296 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU1-38P-201ENST00000362817 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
RNU1-38P-201ENST00000362817 CASP12Q6UXS9 341 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU1-38P-201ENST00000362817 DEF8Q6ZN54 512 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU1-38P-201ENST00000362817 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
RNU1-38P-201ENST00000362817 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
RNU1-38P-201ENST00000362817 CDC20BQ86Y33 519 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU1-38P-201ENST00000362817 NKAIN4Q8IVV8 208 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU1-38P-201ENST00000362817 UBE2J2Q8N2K1 259 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU1-38P-201ENST00000362817 RNF148Q8N7C7 305 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU1-38P-201ENST00000362817 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
RNU1-38P-201ENST00000362817 FAM156AQ8NDB6 213 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU1-38P-201ENST00000362817 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
RNU1-38P-201ENST00000362817 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU1-38P-201ENST00000362817 STEAP2Q8NFT2 490 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU1-38P-201ENST00000362817 TMEM255BQ8WV15 326 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU1-38P-201ENST00000362817 LZICQ8WZA0 190 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU1-38P-201ENST00000362817 MPP4Q96JB8 637 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU1-38P-201ENST00000362817 OXGR1Q96P68 337 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU1-38P-201ENST00000362817 EPYCQ99645 322 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU1-38P-201ENST00000362817 HDHD5Q9BXW7 423 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU1-38P-201ENST00000362817 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
RNU1-38P-201ENST00000362817 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
RNU1-38P-201ENST00000362817 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
RNU1-38P-201ENST00000362817 LIME1Q9H400 295 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU1-38P-201ENST00000362817 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU1-38P-201ENST00000362817 FANCFQ9NPI8 374 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU1-38P-201ENST00000362817 AKIP1Q9NQ31 210 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU1-38P-201ENST00000362817 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
RNU1-38P-201ENST00000362817 SLC7A10Q9NS82 523 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU1-38P-201ENST00000362817 ZNF226Q9NYT6 803 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU1-38P-201ENST00000362817 MALT1Q9UDY8 824 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU1-38P-201ENST00000362817 RIMS3Q9UJD0 308 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU1-38P-201ENST00000362817 A4GNTQ9UNA3 340 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU1-38P-201ENST00000362817 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU1-38P-201ENST00000362817 SNX13Q9Y5W8 968 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU1-38P-201ENST00000362817 FREM1Q5H8C1 2179 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU1-38P-201ENST00000362817 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU1-38P-201ENST00000362817 J3KTA2 159 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU1-38P-201ENST00000362817 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
RNU1-38P-201ENST00000362817 PLPP3O14495 311 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU1-38P-201ENST00000362817 FFAR1O14842 300 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU1-38P-201ENST00000362817 CASKO14936 926 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU1-38P-201ENST00000362817 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
RNU1-38P-201ENST00000362817 ZNF432O94892 652 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU1-38P-201ENST00000362817 HPRP00739 348 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU1-38P-201ENST00000362817 MT-ATP6P00846 226 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU1-38P-201ENST00000362817 T-ENOLP0DO92 83 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU1-38P-201ENST00000362817 THRBP10828 461 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU1-38P-201ENST00000362817 HLA-DOBP13765 273 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU1-38P-201ENST00000362817 HSD17B1P14061 328 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU1-38P-201ENST00000362817 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
RNU1-38P-201ENST00000362817 NR4A1P22736 598 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU1-38P-201ENST00000362817 IL32P24001 234 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU1-38P-201ENST00000362817 YAP1P46937 504 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
RNU1-38P-201ENST00000362817 UGT2B15P54855 530 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU1-38P-201ENST00000362817 LGALS3BPQ08380 585 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU1-38P-201ENST00000362817 MFSD13AQ14CX5 517 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU1-38P-201ENST00000362817 TAB1Q15750 504 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU1-38P-201ENST00000362817 ZNF74Q16587 644 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU1-38P-201ENST00000362817 IFI44LQ53G44 452 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU1-38P-201ENST00000362817 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
RNU1-38P-201ENST00000362817 NIPAL3Q6P499 406 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU1-38P-201ENST00000362817 C16orf89Q6UX73 402 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU1-38P-201ENST00000362817 NHLRC1Q6VVB1 395 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU1-38P-201ENST00000362817 RINLQ6ZS11 566 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU1-38P-201ENST00000362817 LINGO2Q7L985 606 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU1-38P-201ENST00000362817 AAED1Q7RTV5 226 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU1-38P-201ENST00000362817 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa6.53□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25 ms