RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 SEC61A2Q9H9S3 476 aa6.67□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa6.67□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 NANSQ9NR45 359 aa6.67□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa6.67□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 RIMS3Q9UJD0 308 aa6.67□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF229Q9UJW7 825 aa6.67□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM5Q9Y2B1 443 aa6.67□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 MED31Q9Y3C7 131 aa6.67□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 ENPP4Q9Y6X5 453 aa6.67□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 A0A1W2PRQ8 180 aa6.66□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa6.66□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 AQP12BA6NM10 295 aa6.66□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF726A6NNF4 738 aa6.66□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 H7C417 338 aa6.66□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 RNF13O43567 381 aa6.66□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 SSX4O60224 188 aa6.66□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 CIB2O75838 187 aa6.66□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 KRT36O76013 467 aa6.66□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 IGKV3-15P01624 115 aa6.66□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 IGLV1-44P01699 117 aa6.66□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 FABP3P05413 133 aa6.66□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 CELA3BP08861 270 aa6.66□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 UMPSP11172 480 aa6.66□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 BMP4P12644 408 aa6.66□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 NR2C1P13056 603 aa6.66□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 IFNGR1P15260 489 aa6.66□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 B4GALT1P15291 398 aa6.66□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 NCK1P16333 377 aa6.66□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 OR1E2P47887 323 aa6.66□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 CSNK1A1P48729 337 aa6.66□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 BIDP55957 195 aa6.66□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 NAAAQ02083 359 aa6.66□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 CHRNB3Q05901 458 aa6.66□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 NPRL3Q12980 569 aa6.66□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 DGCR6Q14129 220 aa6.66□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 FLOT2Q14254 428 aa6.66□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 NHLRC1Q6VVB1 395 aa6.66□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 DNM1P46Q6ZS02 220 aa6.66□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 RINLQ6ZS11 566 aa6.66□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 SLC35D2Q76EJ3 337 aa6.66□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 VTCN1Q7Z7D3 282 aa6.66□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 MDP1Q86V88 176 aa6.66□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 AQP12AQ8IXF9 295 aa6.66□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 LRRC17Q8N6Y2 441 aa6.66□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 FAM169BQ8N8A8 192 aa6.66□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa6.66□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM255BQ8WV15 326 aa6.66□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM239Q8WW34 195 aa6.66□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 HTRA1Q92743 480 aa6.66□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 FBXO17Q96EF6 278 aa6.66□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 TXNDC15Q96J42 360 aa6.66□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 LRR1Q96L50 414 aa6.66□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 PRSS27Q9BQR3 290 aa6.66□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 LRMDAQ9H2I8 198 aa6.66□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 IL1RAPQ9NPH3 570 aa6.66□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 CA10Q9NS85 328 aa6.66□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa6.65□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 ICMTO60725 284 aa6.65□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 ENTPD5O75356 428 aa6.65□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 HLA-HP01893 362 aa6.65□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 MT-ND1P03886 318 aa6.65□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 H1F0P07305 194 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 ASAH2BP0C7U1 165 aa6.65□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 CBR1P16152 277 aa6.65□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 PCSK6P29122 969 aa6.65□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 CALCRP30988 508 aa6.65□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 ARR3P36575 388 aa6.65□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 SLC9A3P48764 834 aa6.65□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 UGT2B15P54855 530 aa6.65□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 KRTAP1-1Q07627 177 aa6.65□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 ZP4Q12836 540 aa6.65□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 MELKQ14680 651 aa6.65□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 RAB35Q15286 201 aa6.65□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 VHLLQ6RSH7 139 aa6.65□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 CLEC2AQ6UVW9 174 aa6.65□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF730Q6ZMV8 503 aa6.65□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF813Q6ZN06 617 aa6.65□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF627Q7L945 461 aa6.65□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa6.65□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 NKAIN4Q8IVV8 208 aa6.65□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 CCDC36Q8IYA8 594 aa6.65□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF525Q8N782 197 aa6.65□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 FAM156AQ8NDB6 213 aa6.65□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 NUP37Q8NFH4 326 aa6.65□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 OR4F15Q8NGB8 312 aa6.65□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 OR6X1Q8NH79 312 aa6.65□□□□□ -1.34
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