RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261169.10

LMO3-201, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 3,810 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-201ENST00000261169 Q499Y3 187 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 C1orf140Q5VVS0 124 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 TMEM81Q6P7N7 255 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 SLC16A14Q7RTX9 510 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 ESX1Q8N693 406 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 BCORP1Q8N888 145 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 CLEC1AQ8NC01 280 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 OR9K2Q8NGE7 335 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 C3orf49Q96BT1 292 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 ZNF285Q96NJ3 590 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 PHB2Q99623 299 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 NRIP3Q9NQ35 241 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 FSCN3Q9NQT6 498 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 ABRACLQ9P1F3 81 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 ASH2LQ9UBL3 628 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 FLVCR2Q9UPI3 526 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 ABCA4P78363 2273 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 NRXN2Q9P2S2 1712 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 A0A1W2PPC4 97 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 NXPH3O95157 252 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 HBQ1P09105 142 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 CISD3P0C7P0 127 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 HTR2CP28335 458 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 KIAA1024LP59773 190 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 RPS18P62269 152 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 GPLD1P80108 840 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 CTF1Q16619 201 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 FAM69AQ5T7M9 428 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 Q6ZTK2 550 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 CALHM3Q86XJ0 350 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 ANGPTL5Q86XS5 388 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 CLDN22Q8N7P3 220 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 OR1J4Q8NGS1 313 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 OR52I2Q8NH67 350 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 OR56B4Q8NH76 319 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 MAFIPQ8WZ33 124 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 ITPKCQ96DU7 683 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 ENKD1Q9H0I2 346 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 HRH4Q9H3N8 390 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 SMOC1Q9H4F8 434 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 CDH20Q9HBT6 801 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 KCNG2Q9UJ96 466 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 TMEM235A6NFC5 223 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 F8W036 122 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 TNFRSF10AO00220 468 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 ZNF254O75437 659 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 BPNT1O95861 308 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 SPI1P17947 270 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 SPINK2P20155 84 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 HSD17B7P56937 341 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 PSPHP78330 225 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 BLOC1S1P78537 153 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 MFAP5Q13361 173 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 KRBOX4Q5JUW0 171 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 GARNL3Q5VVW2 1013 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 PLCXD3Q63HM9 321 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 FAHD1Q6P587 224 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 C3P1Q6ZMU1 363 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 LANCL3Q6ZV70 420 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 OR14A16Q8NHC5 309 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 SCGB1C1Q8TD33 95 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 PAQR8Q8TEZ7 354 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 FAM3DQ96BQ1 224 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 DDOQ99489 341 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 PTDSS2Q9BVG9 487 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 DUSP23Q9BVJ7 150 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 TEX101Q9BY14 249 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 DNTTIP1Q9H147 329 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 C12orf49Q9H741 205 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 WASH6PQ9NQA3 447 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 WBP1LQ9NX94 342 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 CTSFQ9UBX1 484 aa5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms