RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229307.8

NANOG-201, Transcript of Nanog homeobox, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NANOG, Length 5,183 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOG-201ENST00000229307 EBPQ15125 230 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 ACKR1Q16570 336 aa7.26□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 IL17RDQ8NFM7 739 aa7.26□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 PFN4Q8NHR9 129 aa7.26□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 TBC1D15Q8TC07 691 aa7.26□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 ROBO4Q8WZ75 1007 aa7.26□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 RASL10BQ96S79 203 aa7.26□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 TMEM43Q9BTV4 400 aa7.26□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 ANKRD60Q9BZ19 345 aa7.26□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 OR11A1Q9GZK7 315 aa7.26□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 LANCL2Q9NS86 450 aa7.26□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 ALPK3Q96L96 1907 aa7.26□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 LILRB5O75023 590 aa7.26□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 PRR35P0CG20 571 aa7.26□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 GSTT2P0CG29 244 aa7.26□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 T-ENOLP0DO92 83 aa7.26□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 MTCP1P56278 107 aa7.26□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 CDNFQ49AH0 187 aa7.26□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 PGBD2Q6P3X8 592 aa7.26□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 UGT2A3Q6UWM9 527 aa7.26□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 PRSS41Q7RTY9 318 aa7.26□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 MINDY2Q8NBR6 621 aa7.26□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 SLC7A13Q8TCU3 470 aa7.26□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 A0A087WUU8 490 aa7.26□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 A0A1W2PPV9 198 aa7.26□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 A6NHS1 94 aa7.26□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 FAM183AA6NL82 134 aa7.26□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 DHHO43323 396 aa7.26□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 PIP5K1CO60331 668 aa7.26□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 ARSBP15848 533 aa7.26□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 PSMB10P40306 273 aa7.26□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 MAGEA2P43356 314 aa7.26□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 SRP9P49458 86 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 TMEM205Q6UW68 189 aa7.26□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 DOK3Q7L591 496 aa7.26□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 ZBTB46Q86UZ6 589 aa7.26□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 SLC37A3Q8NCC5 494 aa7.26□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 C17orf47Q8NEP4 570 aa7.26□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 LIPHQ8WWY8 451 aa7.26□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 RFT1Q96AA3 541 aa7.26□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 MIB2Q96AX9 1013 aa7.26□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 ZNF700Q9H0M5 742 aa7.26□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa7.26□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 UBQLN3Q9H347 655 aa7.26□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 OR14J1Q9UGF5 321 aa7.26□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 AMDHD2Q9Y303 409 aa7.26□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 TMEM72A0PK05 275 aa7.25□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 CDHR4A6H8M9 788 aa7.25□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 OR2W5A6NFC9 320 aa7.25□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 NXPH2O95156 264 aa7.25□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 SP1P08047 785 aa7.25□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 RAE1P78406 368 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 CRMP1Q14194 572 aa7.25□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa7.25□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 M0R129 80 aa7.25□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 TOR1AO14656 332 aa7.25□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 SNAPC5O75971 98 aa7.25□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 CDK1P06493 297 aa7.25□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 GNAO1P09471 354 aa7.25□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 MADCAM1Q13477 382 aa7.25□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 NADK2Q4G0N4 442 aa7.25□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 ACSM3Q53FZ2 586 aa7.25□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 ZNF691Q5VV52 312 aa7.25□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 SPINK14Q6IE38 97 aa7.25□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 TMEM108Q6UXF1 575 aa7.25□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 DCXRQ7Z4W1 244 aa7.25□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 ZFP41Q8N8Y5 198 aa7.25□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 MUL1Q969V5 352 aa7.25□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 Q96M85 177 aa7.25□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa7.25□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 GALNT9Q9HCQ5 603 aa7.25□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 STEAP1Q9UHE8 339 aa7.25□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 OSGIN1Q9UJX0 560 aa7.25□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa7.25□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 TRIM64CA6NLI5 447 aa7.25□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 MCRIP1C9JLW8 97 aa7.25□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 RGS11O94810 467 aa7.25□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 PET100P0DJ07 73 aa7.25□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 BDKRB2P30411 391 aa7.25□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 IL2RGP31785 369 aa7.25□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 DIO1P49895 249 aa7.25□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 C6orf183Q5T699 404 aa7.25□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 RAB12Q6IQ22 244 aa7.25□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 SH2D5Q6ZV89 423 aa7.25□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 NLRC3Q7RTR2 1065 aa7.25□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 DPY19L4Q7Z388 723 aa7.25□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 NKAIN4Q8IVV8 208 aa7.25□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 SPERTQ8NA61 448 aa7.25□□□□□ -1.25
NANOG-201ENST00000229307 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa7.25□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.7 ms