RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627440.2

SNAP23-223, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5 BASIC

Gene SNAP23, Length 210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-223	ENST00000627440	IKZF1	Q13422	519 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC17A1	Q14916	467 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	LTB4R	Q15722	352 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	ABCA11P	Q4W5N1	156 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	LRRC8E	Q6NSJ5	796 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF767P	Q75MW2	155 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	CCDC50	Q8IVM0	306 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	DENND6A	Q8IWF6	608 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	C1orf87	Q8N0U7	546 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	COMMD1	Q8N668	190 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	OR11H1	Q8NG94	326 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF420	Q8TAQ5	688 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	CAPSL	Q8WWF8	208 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	CCDC140	Q96MF4	163 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF778	Q96MU6	729 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	CENPK	Q9BS16	269 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	KCNN2	Q9H2S1	579 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	RABEP2	Q9H5N1	569 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	ANKRA2	Q9H9E1	313 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	PLEKHA3	Q9HB20	300 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	SMURF1	Q9HCE7	757 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	ACTR3B	Q9P1U1	418 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	FBXO5	Q9UKT4	447 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	RIMKLB	Q9ULI2	386 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	LRP12	Q9Y561	859 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	SSPO	A2VEC9	5147 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440		H3BUI4	141 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	HDAC3	O15379	428 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	TMPRSS11D	O60235	418 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	MFN2	O95140	757 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	TGFB1	P01137	390 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	HPGD	P15428	266 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF37A	P17032	561 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	CBL	P22681	906 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	SDHA	P31040	664 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	GGT2	P36268	569 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	FDFT1	P37268	417 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	UCP2	P55851	309 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	OR2B6	P58173	313 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	NANOS2	P60321	138 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	POLR2F	P61218	127 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	SARNP	P82979	210 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	PSG6	Q00889	435 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	PLAUR	Q03405	335 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF718	Q3SXZ3	478 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM201A	Q5SY85	155 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	ZCCHC12	Q6PEW1	402 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	HAPLN4	Q86UW8	402 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	OR2Z1	Q8NG97	314 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	OR7A2P	Q8NGA2	310 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	OR1J1	Q8NGS3	322 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC25A43	Q8WUT9	341 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	RGP1	Q92546	391 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	TMEM106A	Q96A25	262 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	RGMA	Q96B86	450 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	AKR1E2	Q96JD6	320 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	QKI	Q96PU8	341 aa	Known RBP eCLIP	4.75	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	ALX4	Q9H161	411 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440		Q9N2J8	555 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	IL19	Q9UHD0	177 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	CAPN7	Q9Y6W3	813 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	LRRC30	A6NM36	301 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF487	B1APH4	448 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	ADAM20	O43506	726 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	GAS8	O95995	478 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	IFNA10	P01566	189 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	CSNK2A2	P19784	350 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	AZGP1	P25311	298 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	TYK2	P29597	1187 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	MPV17	P39210	176 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	GPX6	P59796	221 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	RAB1A	P62820	205 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC35B1	P78383	322 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	TRADD	Q15628	312 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	TOMM34	Q15785	309 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	GLE1	Q53GS7	698 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	C9orf152	Q5JTZ5	239 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	SPATA46	Q5T0L3	261 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	PVRIG	Q6DKI7	326 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM45BP	Q6NSW5	357 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	NIPAL3	Q6P499	406 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	MYO1H	Q8N1T3	1032 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	PAQR4	Q8N4S7	273 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	DRAM1	Q8N682	238 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440		Q8N7P7	452 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC30A7	Q8NEW0	376 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	OR9K2	Q8NGE7	335 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM45A	Q8TCE6	357 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	ST8SIA4	Q92187	359 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	OR2V2	Q96R30	315 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	OR4C12	Q96R67	309 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	SRSF8	Q9BRL6	282 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	NAA11	Q9BSU3	229 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	LINC00470	Q9BZP3	86 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	OR51B5	Q9H339	312 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	LRRC40	Q9H9A6	602 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	MBNL3	Q9NUK0	354 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	TAS2R9	Q9NYW1	312 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SNAP23-223	ENST00000627440	PCDHA9	Q9Y5H5	950 aa		4.74	□□□□□ -1.65

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.8 ms