RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602319.1

HCG18-242, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

BASIC

Gene HCG18, Length 3,342 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-242ENST00000602319 PMELP40967 661 aa9□□□□□ -0.97
HCG18-242ENST00000602319 EIF1P41567 113 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
HCG18-242ENST00000602319 KCNJ3P48549 501 aa9□□□□□ -0.97
HCG18-242ENST00000602319 FLT3LGP49771 235 aa9□□□□□ -0.97
HCG18-242ENST00000602319 C4orf46Q504U0 113 aa9□□□□□ -0.97
HCG18-242ENST00000602319 PARGQ86W56 976 aa9□□□□□ -0.97
HCG18-242ENST00000602319 MISPQ8IVT2 679 aa9□□□□□ -0.97
HCG18-242ENST00000602319 OR1J2Q8NGS2 313 aa9□□□□□ -0.97
HCG18-242ENST00000602319 OR5AK2Q8NH90 309 aa9□□□□□ -0.97
HCG18-242ENST00000602319 Q96M85 177 aa9□□□□□ -0.97
HCG18-242ENST00000602319 MACROD1Q9BQ69 325 aa9□□□□□ -0.97
HCG18-242ENST00000602319 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
HCG18-242ENST00000602319 TLNRD1Q9H1K6 362 aa9□□□□□ -0.97
HCG18-242ENST00000602319 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
HCG18-242ENST00000602319 CYTL1Q9NRR1 136 aa9□□□□□ -0.97
HCG18-242ENST00000602319 TM7SF3Q9NS93 570 aa9□□□□□ -0.97
HCG18-242ENST00000602319 FBXO34Q9NWN3 711 aa9□□□□□ -0.97
HCG18-242ENST00000602319 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
HCG18-242ENST00000602319 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa9□□□□□ -0.97
HCG18-242ENST00000602319 PRKAB1Q9Y478 270 aa9□□□□□ -0.97
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HCG18-242ENST00000602319 DBX1A6NMT0 343 aa8.99□□□□□ -0.97
HCG18-242ENST00000602319 GPR89AB7ZAQ6 455 aa8.99□□□□□ -0.97
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HCG18-242ENST00000602319 GPR89BP0CG08 455 aa8.99□□□□□ -0.97
HCG18-242ENST00000602319 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
HCG18-242ENST00000602319 ADRB3P13945 408 aa8.99□□□□□ -0.97
HCG18-242ENST00000602319 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP8.99□□□□□ -0.97
HCG18-242ENST00000602319 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
HCG18-242ENST00000602319 SREBF2Q12772 1141 aa8.99□□□□□ -0.97
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HCG18-242ENST00000602319 POM121L1PQ3SYA9 428 aa8.99□□□□□ -0.97
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HCG18-242ENST00000602319 RAB42Q8N4Z0 105 aa8.99□□□□□ -0.97
HCG18-242ENST00000602319 OR2L3Q8NG85 312 aa8.99□□□□□ -0.97
HCG18-242ENST00000602319 OR13C8Q8NGS7 320 aa8.99□□□□□ -0.97
HCG18-242ENST00000602319 HSPA12BQ96MM6 686 aa8.99□□□□□ -0.97
HCG18-242ENST00000602319 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa8.99□□□□□ -0.97
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HCG18-242ENST00000602319 TMEM138Q9NPI0 162 aa8.99□□□□□ -0.97
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HCG18-242ENST00000602319 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
HCG18-242ENST00000602319 ZNF600Q6ZNG1 722 aa8.98□□□□□ -0.97
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HCG18-242ENST00000602319 LIPHQ8WWY8 451 aa8.98□□□□□ -0.97
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HCG18-242ENST00000602319 TM4SF19Q96DZ7 209 aa8.98□□□□□ -0.97
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HCG18-242ENST00000602319 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa8.98□□□□□ -0.97
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HCG18-242ENST00000602319 GATCO43716 136 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
HCG18-242ENST00000602319 H3F3CQ6NXT2 135 aa8.98□□□□□ -0.97
HCG18-242ENST00000602319 LILRA6Q6PI73 481 aa8.98□□□□□ -0.97
HCG18-242ENST00000602319 VN1R4Q7Z5H5 301 aa8.98□□□□□ -0.97
HCG18-242ENST00000602319 C15orf54Q8N8G6 183 aa8.98□□□□□ -0.97
HCG18-242ENST00000602319 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa8.98□□□□□ -0.97
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