RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590061.1

SMAD4-210, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD4, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-210ENST00000590061 FADS2O95864 444 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 F10P00742 488 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 IGHG1P01857 330 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 NAT2P11245 290 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF708P17019 499 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 SFTPDP35247 375 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 ATP6V1E1P36543 226 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 SLC25A1P53007 311 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 SLC16A1P53985 500 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 GABARAPL2P60520 117 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 CTXN1P60606 82 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 H3F3AP84243 136 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 HSF1Q00613 529 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 PON3Q15166 354 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 KCTD21Q4G0X4 260 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 TMEM201Q5SNT2 666 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 THEM4Q5T1C6 240 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 SFRP5Q5T4F7 317 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 C6orf52Q5T4I8 152 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 NXNL2Q5VZ03 156 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 SSX8Q7RTT4 187 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 OR13C2Q8NGS9 318 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 OR6X1Q8NH79 312 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 TMEM163Q8TC26 289 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 EXTL1Q92935 676 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF566Q969W8 418 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 RHOVQ96L33 236 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 LRR1Q96L50 414 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 SAMD8Q96LT4 415 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 CNBD2Q96M20 576 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 MUS81Q96NY9 551 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 MBOAT4Q96T53 435 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 WACQ9BTA9 647 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 PTDSS2Q9BVG9 487 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 RACGAP1Q9H0H5 632 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 INPP5EQ9NRR6 644 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 ASB6Q9NWX5 421 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 TVP23BQ9NYZ1 205 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 PKD1L2Q7Z442 2459 aa6.54□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 DSPP15924 2871 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa6.54□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 TRAV27A0A087WT01 109 aa6.54□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 A0A087WXM4 84 aa6.54□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 A0A0G2JMM0 328 aa6.54□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 A0A1W2PPB8 328 aa6.54□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 A0A1W2PRS3 328 aa6.54□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 KIR3DP1A8MWS1 328 aa6.54□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 E9PQ18 207 aa6.54□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 DLGAP1O14490 977 aa6.54□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 BHLHE40O14503 412 aa6.54□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 CDC42EP2O14613 210 aa6.54□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 PRRG2O14669 202 aa6.54□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 PHYHO14832 338 aa6.54□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 SURF4O15260 269 aa6.54□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 CYTIPO60759 359 aa6.54□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 SOX14O95416 240 aa6.54□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 PLGP00747 810 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 RFPL3SP0C7P2 107 aa6.54□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 PIPP12273 146 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 PTGS2P35354 604 aa6.54□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 AQP2P41181 271 aa6.54□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 LHX2P50458 406 aa6.54□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 CLDN15P56746 228 aa6.54□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 ISL1P61371 349 aa6.54□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 ACTC1P68032 377 aa6.54□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 ACTA1P68133 377 aa6.54□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 TUBA4AP68366 448 aa6.54□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 MVKQ03426 396 aa6.54□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 GLO1Q04760 184 aa6.54□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 GTF3C1Q12789 2109 aa6.54□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 RAB40BQ12829 278 aa6.54□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 IKZF1Q13422 519 aa6.54□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 C6orf141Q5SZD1 244 aa6.54□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa6.54□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 SLC35D2Q76EJ3 337 aa6.54□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 BTN2A1Q7KYR7 527 aa6.54□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 P4HA3Q7Z4N8 544 aa6.54□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 DPPA2Q7Z7J5 298 aa6.54□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 POMGNT2Q8NAT1 580 aa6.54□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 OR10D3Q8NH80 312 aa6.54□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 MOSPD2Q8NHP6 518 aa6.54□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 FAR1Q8WVX9 515 aa6.54□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 SMPDL3BQ92485 455 aa6.54□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 FCGR1BQ92637 280 aa6.54□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.2 ms