RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585685.5

APOC4-APOC2-201, Transcript of APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 5

Gene APOC4-APOC2, Length 1,829 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DPAGT1Q9H3H5 408 aa14.9□□□□□ -0.02
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TXNIPQ9H3M7 391 aa14.9□□□□□ -0.02
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 IKZF2Q9UKS7 526 aa14.9□□□□□ -0.02
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 B9D1Q9UPM9 204 aa14.9□□□□□ -0.02
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 LAMA1P25391 3075 aa14.9□□□□□ -0.02
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 A0A087WV48 116 aa14.89□□□□□ -0.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa14.89□□□□□ -0.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PRSS37A4D1T9 235 aa14.89□□□□□ -0.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TMEM212A6NML5 194 aa14.89□□□□□ -0.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 OR4C45A6NMZ5 311 aa14.89□□□□□ -0.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 OR2T1O43869 369 aa14.89□□□□□ -0.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CALCBP10092 127 aa14.89□□□□□ -0.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RCVRNP35243 200 aa14.89□□□□□ -0.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 BLVRAP53004 296 aa14.89□□□□□ -0.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 UTS2BQ765I0 119 aa14.89□□□□□ -0.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa14.89□□□□□ -0.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 OR2G2Q8NGZ5 317 aa14.89□□□□□ -0.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NUBPLQ8TB37 319 aa14.89□□□□□ -0.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DUSP19Q8WTR2 217 aa14.89□□□□□ -0.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SMIM4Q8WVI0 70 aa14.89□□□□□ -0.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DUSP23Q9BVJ7 150 aa14.89□□□□□ -0.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SLITRK2Q9H156 845 aa14.89□□□□□ -0.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TCF7L1Q9HCS4 588 aa14.89□□□□□ -0.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 COPZ2Q9P299 210 aa14.89□□□□□ -0.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa14.89□□□□□ -0.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZNF254O75437 659 aa14.89□□□□□ -0.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RAF1P04049 648 aa14.89□□□□□ -0.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ERP29P30040 261 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RAB25P57735 213 aa14.89□□□□□ -0.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa14.89□□□□□ -0.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 COL28A1Q2UY09 1125 aa14.89□□□□□ -0.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FDX2Q6P4F2 183 aa14.89□□□□□ -0.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SIAH3Q8IW03 269 aa14.89□□□□□ -0.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SLC38A9Q8NBW4 561 aa14.89□□□□□ -0.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 OR6S1Q8NH40 331 aa14.89□□□□□ -0.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TMEM234Q8WY98 164 aa14.89□□□□□ -0.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NSMAFQ92636 917 aa14.89□□□□□ -0.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SLC25A38Q96DW6 304 aa14.89□□□□□ -0.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DNAJA3Q96EY1 480 aa14.89□□□□□ -0.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 COMMD4Q9H0A8 199 aa14.89□□□□□ -0.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 LIN7BQ9HAP6 207 aa14.89□□□□□ -0.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GALNT9Q9HCQ5 603 aa14.89□□□□□ -0.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ING3Q9NXR8 418 aa14.89□□□□□ -0.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa14.88□□□□□ -0.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ANKUB1A6NFN9 424 aa14.88□□□□□ -0.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PLPP3O14495 311 aa14.88□□□□□ -0.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 AHSA1O95433 338 aa14.88□□□□□ -0.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GPANK1O95872 356 aa14.88□□□□□ -0.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DHFRP00374 187 aa14.88□□□□□ -0.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PLGP00747 810 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DCNP07585 359 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RPS27P42677 84 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FOXL2P58012 376 aa14.88□□□□□ -0.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DYRK1AQ13627 763 aa14.88□□□□□ -0.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 THEM6Q8WUY1 208 aa14.88□□□□□ -0.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SCMH1Q96GD3 660 aa14.88□□□□□ -0.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DCBLD2Q96PD2 775 aa14.88□□□□□ -0.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 OR8B4Q96RC9 309 aa14.88□□□□□ -0.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NIPAL2Q9H841 368 aa14.88□□□□□ -0.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PLEKHA1Q9HB21 404 aa14.88□□□□□ -0.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MCUBQ9NWR8 336 aa14.88□□□□□ -0.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KCNG2Q9UJ96 466 aa14.88□□□□□ -0.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa14.87□□□□□ -0.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa14.87□□□□□ -0.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 C7orf66A4D0T2 115 aa14.87□□□□□ -0.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FTCDNL1E5RQL4 147 aa14.87□□□□□ -0.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ALOX12BO75342 701 aa14.87□□□□□ -0.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 OR6A2O95222 327 aa14.87□□□□□ -0.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 C1QBP02746 253 aa14.87□□□□□ -0.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TCRBP04435 133 aa14.87□□□□□ -0.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 HEXBP07686 556 aa14.87□□□□□ -0.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ADRB1P08588 477 aa14.87□□□□□ -0.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DLX5P56178 289 aa14.87□□□□□ -0.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 C17orf67Q0P5P2 114 aa14.87□□□□□ -0.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa14.87□□□□□ -0.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SLC22A10Q63ZE4 541 aa14.87□□□□□ -0.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FCRLAQ7L513 359 aa14.87□□□□□ -0.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 LRRTM1Q86UE6 522 aa14.87□□□□□ -0.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PRSS35Q8N3Z0 413 aa14.87□□□□□ -0.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ASB17Q8WXJ9 295 aa14.87□□□□□ -0.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ST8SIA1Q92185 356 aa14.87□□□□□ -0.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 AMELYQ99218 206 aa14.87□□□□□ -0.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa14.87□□□□□ -0.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MYO15AQ9UKN7 3530 aa14.87□□□□□ -0.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FREM3P0C091 2139 aa14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.2 ms