RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 IL20RAQ9UHF4 553 aa29.13■■■□□ 2.25
CTDNEP1-209ENST00000574205 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa29.12■■■□□ 2.25
CTDNEP1-209ENST00000574205 EPXP11678 715 aa29.12■■■□□ 2.25
CTDNEP1-209ENST00000574205 GSTM3P21266 225 aa29.12■■■□□ 2.25
CTDNEP1-209ENST00000574205 RUNX1T1Q06455 604 aa29.12■■■□□ 2.25
CTDNEP1-209ENST00000574205 RFX4Q33E94 735 aa29.12■■■□□ 2.25
CTDNEP1-209ENST00000574205 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa29.12■■■□□ 2.25
CTDNEP1-209ENST00000574205 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa29.12■■■□□ 2.25
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM54Q969K7 222 aa29.12■■■□□ 2.25
CTDNEP1-209ENST00000574205 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP29.12■■■□□ 2.25
CTDNEP1-209ENST00000574205 ULBP2Q9BZM5 246 aa29.12■■■□□ 2.25
CTDNEP1-209ENST00000574205 GLTPQ9NZD2 209 aa29.12■■■□□ 2.25
CTDNEP1-209ENST00000574205 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa29.12■■■□□ 2.25
CTDNEP1-209ENST00000574205 CLRN1P58418 232 aa29.11■■■□□ 2.25
CTDNEP1-209ENST00000574205 ERVK-25P63136 954 aa29.11■■■□□ 2.25
CTDNEP1-209ENST00000574205 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP29.11■■■□□ 2.25
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM122BQ7Z309 247 aa29.11■■■□□ 2.25
CTDNEP1-209ENST00000574205 NOXO1Q8NFA2 376 aa29.11■■■□□ 2.25
CTDNEP1-209ENST00000574205 LRTOMTQ8WZ04 291 aa29.11■■■□□ 2.25
CTDNEP1-209ENST00000574205 MUS81Q96NY9 551 aa29.11■■■□□ 2.25
CTDNEP1-209ENST00000574205 GRHPRQ9UBQ7 328 aa29.11■■■□□ 2.25
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRMUO75648 421 aaKnown RBP29.1■■■□□ 2.25
CTDNEP1-209ENST00000574205 ACVR1BP36896 505 aa29.1■■■□□ 2.25
CTDNEP1-209ENST00000574205 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP29.1■■■□□ 2.25
CTDNEP1-209ENST00000574205 GABRA6Q16445 453 aa29.1■■■□□ 2.25
CTDNEP1-209ENST00000574205 CEACAM16Q2WEN9 425 aa29.1■■■□□ 2.25
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF787Q6DD87 383 aa29.1■■■□□ 2.25
CTDNEP1-209ENST00000574205 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa29.1■■■□□ 2.25
CTDNEP1-209ENST00000574205 C22orf34Q6ZV56 151 aa29.1■■■□□ 2.25
CTDNEP1-209ENST00000574205 P2RY8Q86VZ1 359 aa29.1■■■□□ 2.25
CTDNEP1-209ENST00000574205 HS3ST5Q8IZT8 346 aa29.1■■■□□ 2.25
CTDNEP1-209ENST00000574205 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa29.1■■■□□ 2.25
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF519Q8TB69 540 aa29.1■■■□□ 2.25
CTDNEP1-209ENST00000574205 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa29.1■■■□□ 2.25
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF226Q9NYT6 803 aa29.1■■■□□ 2.25
CTDNEP1-209ENST00000574205 CENPEQ02224 2701 aa29.1■■■□□ 2.25
CTDNEP1-209ENST00000574205 A6NIZ1 184 aa29.1■■■□□ 2.25
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC6A6P31641 620 aa29.1■■■□□ 2.25
CTDNEP1-209ENST00000574205 RAP1BP61224 184 aa29.1■■■□□ 2.25
CTDNEP1-209ENST00000574205 RAP1AP62834 184 aa29.1■■■□□ 2.25
CTDNEP1-209ENST00000574205 COX10Q12887 443 aa29.1■■■□□ 2.25
CTDNEP1-209ENST00000574205 HIST3H3Q16695 136 aa29.1■■■□□ 2.25
CTDNEP1-209ENST00000574205 CD300LDQ6UXZ3 194 aa29.1■■■□□ 2.25
CTDNEP1-209ENST00000574205 MARVELD3Q96A59 401 aa29.1■■■□□ 2.25
CTDNEP1-209ENST00000574205 IL20Q9NYY1 176 aa29.1■■■□□ 2.25
CTDNEP1-209ENST00000574205 CDH10Q9Y6N8 788 aa29.1■■■□□ 2.25
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR5H1A6NKK0 313 aa29.09■■■□□ 2.25
CTDNEP1-209ENST00000574205 ENTPD5O75356 428 aa29.09■■■□□ 2.25
CTDNEP1-209ENST00000574205 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP29.09■■■□□ 2.25
CTDNEP1-209ENST00000574205 RPS6KA3P51812 740 aa29.09■■■□□ 2.25
CTDNEP1-209ENST00000574205 TIMM23BQ5SRD1 257 aa29.09■■■□□ 2.25
CTDNEP1-209ENST00000574205 GPR139Q6DWJ6 353 aa29.09■■■□□ 2.25
CTDNEP1-209ENST00000574205 C17orf78Q8N4C9 275 aa29.09■■■□□ 2.25
CTDNEP1-209ENST00000574205 CLDN22Q8N7P3 220 aa29.09■■■□□ 2.25
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR5K1Q8NHB7 308 aa29.09■■■□□ 2.25
CTDNEP1-209ENST00000574205 HSD17B8Q92506 261 aa29.09■■■□□ 2.25
CTDNEP1-209ENST00000574205 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
CTDNEP1-209ENST00000574205 BOD1Q96IK1 185 aa29.09■■■□□ 2.25
CTDNEP1-209ENST00000574205 SAMD8Q96LT4 415 aa29.09■■■□□ 2.25
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF570Q96NI8 536 aa29.09■■■□□ 2.25
CTDNEP1-209ENST00000574205 KCNK17Q96T54 332 aa29.09■■■□□ 2.25
CTDNEP1-209ENST00000574205 NR2C1P13056 603 aa29.08■■■□□ 2.25
CTDNEP1-209ENST00000574205 APEHP13798 732 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
CTDNEP1-209ENST00000574205 ANXA8P13928 327 aa29.08■■■□□ 2.25
CTDNEP1-209ENST00000574205 SDHAP31040 664 aa29.08■■■□□ 2.25
CTDNEP1-209ENST00000574205 STK11Q15831 433 aa29.08■■■□□ 2.25
CTDNEP1-209ENST00000574205 AMIGO2Q86SJ2 522 aa29.08■■■□□ 2.25
CTDNEP1-209ENST00000574205 SYT14Q8NB59 555 aa29.08■■■□□ 2.25
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP29.08■■■□□ 2.25
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
CTDNEP1-209ENST00000574205 Q96M85 177 aa29.08■■■□□ 2.25
CTDNEP1-209ENST00000574205 EGLN3Q9H6Z9 239 aa29.08■■■□□ 2.25
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP29.07■■■□□ 2.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 H3BNX3 289 aa29.07■■■□□ 2.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 CASKO14936 926 aa29.07■■■□□ 2.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 TAB1Q15750 504 aa29.07■■■□□ 2.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 SSX8Q7RTT4 187 aa29.07■■■□□ 2.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR52L1Q8NGH7 329 aa29.07■■■□□ 2.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR1K1Q8NGR3 316 aa29.07■■■□□ 2.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP29.07■■■□□ 2.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 ALG12Q9BV10 488 aa29.07■■■□□ 2.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF556Q9HAH1 456 aa29.07■■■□□ 2.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa29.07■■■□□ 2.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 PRR14LQ5THK1 2151 aa29.06■■■□□ 2.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 THBDP07204 575 aa29.06■■■□□ 2.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 PRKACGP22612 351 aa29.06■■■□□ 2.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 LRFN4Q6PJG9 635 aa29.06■■■□□ 2.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 HIPK1Q86Z02 1210 aa29.06■■■□□ 2.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 FNDC8Q8TC99 324 aa29.06■■■□□ 2.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP29.06■■■□□ 2.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP29.06■■■□□ 2.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa29.06■■■□□ 2.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 ERICH4A6NGS2 130 aa29.05■■■□□ 2.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 XKRYO14609 159 aa29.05■■■□□ 2.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 ARPC3O15145 178 aa29.05■■■□□ 2.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 ARHGEF9O43307 516 aa29.05■■■□□ 2.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 QDPRP09417 244 aa29.05■■■□□ 2.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 CD47Q08722 323 aa29.05■■■□□ 2.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 ANKRD16Q6P6B7 361 aa29.05■■■□□ 2.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 MCHR2Q969V1 340 aa29.05■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.2 ms