RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3-205ENST00000563559 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
RRN3-205ENST00000563559 TVP23AA6NH52 213 aa16.7■□□□□ 0.26
RRN3-205ENST00000563559 CXCR1P25024 350 aa16.7■□□□□ 0.26
RRN3-205ENST00000563559 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
RRN3-205ENST00000563559 DNM1P46Q6ZS02 220 aa16.7■□□□□ 0.26
RRN3-205ENST00000563559 NLRC3Q7RTR2 1065 aa16.7■□□□□ 0.26
RRN3-205ENST00000563559 DPY19L4Q7Z388 723 aa16.7■□□□□ 0.26
RRN3-205ENST00000563559 CCDC28AQ8IWP9 274 aa16.7■□□□□ 0.26
RRN3-205ENST00000563559 TGM7Q96PF1 710 aa16.7■□□□□ 0.26
RRN3-205ENST00000563559 ADOQ96SZ5 270 aa16.7■□□□□ 0.26
RRN3-205ENST00000563559 OR8D2Q9GZM6 311 aa16.7■□□□□ 0.26
RRN3-205ENST00000563559 STEAP1Q9UHE8 339 aa16.7■□□□□ 0.26
RRN3-205ENST00000563559 FLVCR2Q9UPI3 526 aa16.7■□□□□ 0.26
RRN3-205ENST00000563559 XKRYO14609 159 aa16.69■□□□□ 0.26
RRN3-205ENST00000563559 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
RRN3-205ENST00000563559 IL5P05113 134 aa16.69■□□□□ 0.26
RRN3-205ENST00000563559 IFNGR1P15260 489 aa16.69■□□□□ 0.26
RRN3-205ENST00000563559 CFPP27918 469 aa16.69■□□□□ 0.26
RRN3-205ENST00000563559 CENPAP49450 140 aa16.69■□□□□ 0.26
RRN3-205ENST00000563559 TMEM255AQ5JRV8 349 aa16.69■□□□□ 0.26
RRN3-205ENST00000563559 THEM6Q8WUY1 208 aa16.69■□□□□ 0.26
RRN3-205ENST00000563559 TMEM106AQ96A25 262 aa16.69■□□□□ 0.26
RRN3-205ENST00000563559 MSANTD3Q96H12 275 aa16.69■□□□□ 0.26
RRN3-205ENST00000563559 DCBLD2Q96PD2 775 aa16.69■□□□□ 0.26
RRN3-205ENST00000563559 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa16.69■□□□□ 0.26
RRN3-205ENST00000563559 TAS2R8Q9NYW2 309 aa16.69■□□□□ 0.26
RRN3-205ENST00000563559 NUP210LQ5VU65 1888 aa16.69■□□□□ 0.26
RRN3-205ENST00000563559 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa16.69■□□□□ 0.26
RRN3-205ENST00000563559 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa16.69■□□□□ 0.26
RRN3-205ENST00000563559 SNRPGP15A8MWD9 76 aa16.69■□□□□ 0.26
RRN3-205ENST00000563559 H7C1C5 153 aa16.69■□□□□ 0.26
RRN3-205ENST00000563559 XRCC3O43542 346 aa16.69■□□□□ 0.26
RRN3-205ENST00000563559 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
RRN3-205ENST00000563559 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP16.69■□□□□ 0.26
RRN3-205ENST00000563559 GLSO94925 669 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
RRN3-205ENST00000563559 AKR7A3O95154 331 aa16.69■□□□□ 0.26
RRN3-205ENST00000563559 NME1P15531 152 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
RRN3-205ENST00000563559 MECP2P51608 486 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
RRN3-205ENST00000563559 BLVRAP53004 296 aa16.69■□□□□ 0.26
RRN3-205ENST00000563559 LCN6P62502 163 aa16.69■□□□□ 0.26
RRN3-205ENST00000563559 SLC25A25Q6KCM7 469 aa16.69■□□□□ 0.26
RRN3-205ENST00000563559 FDX2Q6P4F2 183 aa16.69■□□□□ 0.26
RRN3-205ENST00000563559 MEIOBQ8N635 442 aa16.69■□□□□ 0.26
RRN3-205ENST00000563559 OTOSQ8NHW6 89 aa16.69■□□□□ 0.26
RRN3-205ENST00000563559 ASB17Q8WXJ9 295 aa16.69■□□□□ 0.26
RRN3-205ENST00000563559 ADIPOR1Q96A54 375 aa16.69■□□□□ 0.26
RRN3-205ENST00000563559 MVB12AQ96EY5 273 aa16.69■□□□□ 0.26
RRN3-205ENST00000563559 ZDHHC12Q96GR4 267 aa16.69■□□□□ 0.26
RRN3-205ENST00000563559 SYT4Q9H2B2 425 aa16.69■□□□□ 0.26
RRN3-205ENST00000563559 AUP1Q9Y679 476 aa16.69■□□□□ 0.26
RRN3-205ENST00000563559 HCRTR2O43614 444 aa16.68■□□□□ 0.26
RRN3-205ENST00000563559 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
RRN3-205ENST00000563559 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
RRN3-205ENST00000563559 ICMTO60725 284 aa16.68■□□□□ 0.26
RRN3-205ENST00000563559 NDUFB6O95139 128 aa16.68■□□□□ 0.26
RRN3-205ENST00000563559 MT-ATP6P00846 226 aa16.68■□□□□ 0.26
RRN3-205ENST00000563559 IGKV3-11P04433 115 aa16.68■□□□□ 0.26
RRN3-205ENST00000563559 IL12BP29460 328 aa16.68■□□□□ 0.26
RRN3-205ENST00000563559 ARPC4P59998 168 aa16.68■□□□□ 0.26
RRN3-205ENST00000563559 CBFBQ13951 182 aa16.68■□□□□ 0.26
RRN3-205ENST00000563559 ELMOD2Q8IZ81 293 aa16.68■□□□□ 0.26
RRN3-205ENST00000563559 ZNF321PQ8N8H1 164 aa16.68■□□□□ 0.26
RRN3-205ENST00000563559 MCHR2Q969V1 340 aa16.68■□□□□ 0.26
RRN3-205ENST00000563559 CUTCQ9NTM9 273 aa16.68■□□□□ 0.26
RRN3-205ENST00000563559 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
RRN3-205ENST00000563559 GON4LQ3T8J9 2241 aa16.68■□□□□ 0.26
RRN3-205ENST00000563559 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
RRN3-205ENST00000563559 A0A1W2PQD3 144 aa16.67■□□□□ 0.26
RRN3-205ENST00000563559 ICOSLGO75144 302 aa16.67■□□□□ 0.26
RRN3-205ENST00000563559 RBBP9O75884 186 aa16.67■□□□□ 0.26
RRN3-205ENST00000563559 SELENOPP49908 381 aa16.67■□□□□ 0.26
RRN3-205ENST00000563559 ZNF117Q03924 483 aa16.67■□□□□ 0.26
RRN3-205ENST00000563559 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
RRN3-205ENST00000563559 Q6ZTK2 550 aa16.67■□□□□ 0.26
RRN3-205ENST00000563559 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
RRN3-205ENST00000563559 GLB1L2Q8IW92 636 aa16.67■□□□□ 0.26
RRN3-205ENST00000563559 LMX1AQ8TE12 382 aa16.67■□□□□ 0.26
RRN3-205ENST00000563559 C4orf45Q96LM5 186 aa16.67■□□□□ 0.26
RRN3-205ENST00000563559 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
RRN3-205ENST00000563559 UBQLN2Q9UHD9 624 aa16.67■□□□□ 0.26
RRN3-205ENST00000563559 A0A087WV48 116 aa16.67■□□□□ 0.26
RRN3-205ENST00000563559 SLC25A12O75746 678 aa16.67■□□□□ 0.26
RRN3-205ENST00000563559 CRYZL1O95825 349 aa16.67■□□□□ 0.26
RRN3-205ENST00000563559 BGLAPP02818 100 aa16.67■□□□□ 0.26
RRN3-205ENST00000563559 MAS1P04201 325 aa16.67■□□□□ 0.26
RRN3-205ENST00000563559 GIPP09681 153 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
RRN3-205ENST00000563559 PGCP20142 388 aa16.67■□□□□ 0.26
RRN3-205ENST00000563559 ITPKBP27987 946 aa16.67■□□□□ 0.26
RRN3-205ENST00000563559 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
RRN3-205ENST00000563559 GFERP55789 205 aa16.67■□□□□ 0.26
RRN3-205ENST00000563559 LINC00303Q3SY05 128 aa16.67■□□□□ 0.26
RRN3-205ENST00000563559 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa16.67■□□□□ 0.26
RRN3-205ENST00000563559 SIX5Q8N196 739 aa16.67■□□□□ 0.26
RRN3-205ENST00000563559 SMRP1Q8NCR6 262 aa16.67■□□□□ 0.26
RRN3-205ENST00000563559 METTL21AQ8WXB1 218 aa16.67■□□□□ 0.26
RRN3-205ENST00000563559 PIGKQ92643 395 aa16.67■□□□□ 0.26
RRN3-205ENST00000563559 GAL3ST4Q96RP7 486 aa16.67■□□□□ 0.26
RRN3-205ENST00000563559 RAB33BQ9H082 229 aa16.67■□□□□ 0.26
RRN3-205ENST00000563559 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa16.67■□□□□ 0.26
RRN3-205ENST00000563559 SZT2Q5T011 3432 aa16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.6 ms