RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550996.1

CS-222, Transcript of citrate synthase, human

TSL 2

Gene CS, Length 718 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-222	ENST00000550996	HLA-H	P01893	362 aa		18.14	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	CBR1	P16152	277 aa		18.14	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	FABP6	P51161	128 aa		18.14	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	IDH3G	P51553	393 aa	Predicted RBP	18.14	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	FHL1	Q13642	323 aa		18.14	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	LAPTM4A	Q15012	233 aa		18.14	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	FXN	Q16595	210 aa		18.14	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	C3orf36	Q3SXR2	165 aa		18.14	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	AGAP6	Q5VW22	663 aa		18.14	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	ZNF813	Q6ZN06	617 aa		18.14	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	FKBP9P1	Q75LS8	142 aa		18.14	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	NRM	Q8IXM6	262 aa		18.14	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	DEPDC4	Q8N2C3	294 aa		18.14	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	MUC15	Q8N387	334 aa		18.14	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	SEPHS2	Q99611	448 aa		18.14	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	KATNB1	Q9BVA0	655 aa		18.14	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	FNDC11	Q9BVV2	318 aa		18.14	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	CBLN4	Q9NTU7	201 aa		18.14	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	GLTP	Q9NZD2	209 aa		18.14	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	POFUT2	Q9Y2G5	429 aa		18.14	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	BCL10	O95999	233 aa		18.13	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	INHBB	P09529	407 aa		18.13	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	IFI30	P13284	250 aa		18.13	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	TRAM2	Q15035	370 aa		18.13	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	GLYAT	Q6IB77	296 aa		18.13	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	ZNF544	Q6NX49	715 aa		18.13	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	TBPL2	Q6SJ96	375 aa		18.13	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	PGAM4	Q8N0Y7	254 aa		18.13	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	FBXL14	Q8N1E6	418 aa		18.13	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	ASB10	Q8WXI3	467 aa		18.13	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	HTRA1	Q92743	480 aa		18.13	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	ZNF566	Q969W8	418 aa		18.13	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	BPIFA2	Q96DR5	249 aa		18.13	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	ZNF75A	Q96N20	296 aa		18.13	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	CCT8L2	Q96SF2	557 aa		18.13	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	FOXB1	Q99853	325 aa		18.13	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	CACNG6	Q9BXT2	260 aa		18.13	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	MRPL13	Q9BYD1	178 aa	Known RBP	18.13	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	DCAF13	Q9NV06	445 aa	Known RBP	18.13	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	CD300A	Q9UGN4	299 aa		18.13	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	ENPP4	Q9Y6X5	453 aa		18.13	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996		A0A087WUU8	490 aa		18.12	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	TCN1	P20061	433 aa	Predicted RBP	18.12	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	MSX2	P35548	267 aa	Predicted RBP	18.12	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	CAPZA2	P47755	286 aa		18.12	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	HGFAC	Q04756	655 aa		18.12	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	HIST3H3	Q16695	136 aa		18.12	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	MST1L	Q2TV78	715 aa		18.12	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	ARMC4	Q5T2S8	1044 aa		18.12	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	ANKS4B	Q8N8V4	417 aa		18.12	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	FGFBP3	Q8TAT2	258 aa		18.12	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	C7orf34	Q96L11	122 aa		18.12	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	ZNF347	Q96SE7	839 aa		18.12	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	INIP	Q9NRY2	104 aa		18.12	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	NDUFAF4	Q9P032	175 aa		18.12	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	HIF3A	Q9Y2N7	669 aa		18.12	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	FN1	P02751	2386 aa	Known RBP	18.11	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	IGHV2OR16-5	A0A0B4J2B6	119 aa		18.11	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996		A0A1W2PRG6	482 aa		18.11	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	DCTN3	O75935	186 aa		18.11	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	HSD17B1	P14061	328 aa		18.11	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	PAX7	P23759	505 aa		18.11	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	ACVR1B	P36896	505 aa		18.11	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	PRKCD	Q05655	676 aa		18.11	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	NPRL3	Q12980	569 aa		18.11	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	IQCC	Q4KMZ1	466 aa		18.11	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	CCDC36	Q8IYA8	594 aa		18.11	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	FITM2	Q8N6M3	262 aa		18.11	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	LRRC75A	Q8NAA5	344 aa		18.11	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	SYT14	Q8NB59	555 aa		18.11	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	NOXO1	Q8NFA2	376 aa		18.11	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	ACOT11	Q8WXI4	607 aa	Predicted RBP	18.11	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	NMD3	Q96D46	503 aa	Known RBP	18.11	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	TRMT61A	Q96FX7	289 aa	Known RBP	18.11	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	MS4A3	Q96HJ5	214 aa		18.11	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	CDRT15	Q96T59	188 aa		18.11	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	NMNAT1	Q9HAN9	279 aa	Predicted RBP	18.11	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	RPS6KA6	Q9UK32	745 aa		18.11	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	TRAV27	A0A087WT01	109 aa		18.1	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	SMAD7	O15105	426 aa	Known RBP	18.1	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	DHH	O43323	396 aa		18.1	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	TRMU	O75648	421 aa	Known RBP	18.1	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	IGHG1	P01857	330 aa		18.1	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	CRYAA	P02489	173 aa		18.1	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	QDPR	P09417	244 aa		18.1	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	PATE4	P0C8F1	98 aa		18.1	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	CD79A	P11912	226 aa		18.1	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	APOBEC3A	P31941	199 aa	Predicted RBP	18.1	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	IFNA8	P32881	189 aa		18.1	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	ARR3	P36575	388 aa		18.1	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	VLDLR	P98155	873 aa		18.1	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	MYBPC1	Q00872	1141 aa		18.1	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	PIGF	Q07326	219 aa		18.1	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	TNK1	Q13470	666 aa		18.1	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	CLEC12B	Q2HXU8	276 aa		18.1	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	DNM1P46	Q6ZS02	220 aa		18.1	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	BIVM	Q86UB2	503 aa		18.1	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	SKA3	Q8IX90	412 aa		18.1	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	OR13C2	Q8NGS9	318 aa		18.1	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	SLC7A13	Q8TCU3	470 aa		18.1	■□□□□ 0.49

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