RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520276.5

TRPS1-211, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRPS1, Length 4,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-211ENST00000520276 NKAIN4Q8IVV8 208 aa9.22□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 PAQR8Q8TEZ7 354 aa9.22□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 OR51I1Q9H343 314 aa9.22□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 KLF15Q9UIH9 416 aa9.22□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 SERTAD3Q9UJW9 196 aa9.22□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 CHD9Q3L8U1 2897 aa9.22□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 A0A1B0GWJ7 208 aa9.22□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 SYT5O00445 386 aa9.22□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 PPIHO43447 177 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 FADS1O60427 444 aa9.22□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 NDUFB6O95139 128 aa9.22□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 GALP22466 123 aa9.22□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 IL10RAQ13651 578 aa9.22□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 ACSM3Q53FZ2 586 aa9.22□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 OR52W1Q6IF63 320 aa9.22□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 C1orf94Q6P1W5 598 aa9.22□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa9.22□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa9.22□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 OR52E1Q8NGJ3 308 aa9.22□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF671Q8TAW3 534 aa9.22□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 CHST6Q9GZX3 395 aa9.22□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 REEP4Q9H6H4 257 aa9.22□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa9.22□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 MYF5P13349 255 aa9.21□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 HCCSP53701 268 aa9.21□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 PNLIPRP1P54315 467 aa9.21□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 CLDN12P56749 244 aa9.21□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 OR1D5P58170 312 aa9.21□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 NDUFA9Q16795 377 aa9.21□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 PYY3Q5JQD4 70 aa9.21□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 OR5J2Q8NH18 312 aa9.21□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa9.21□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 HIST1H2BAQ96A08 127 aa9.21□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 TCEAL7Q9BRU2 100 aa9.21□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 FNDC11Q9BVV2 318 aa9.21□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 LAT2Q9GZY6 243 aa9.21□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 CXorf36Q9H7Y0 433 aa9.21□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 CAPN10Q9HC96 672 aa9.21□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 ACAD8Q9UKU7 415 aa9.21□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 PIEZO1Q92508 2521 aa9.21□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 SLC31A2O15432 143 aa9.21□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 SC5DO75845 299 aa9.21□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 FOLR2P14207 255 aa9.21□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 SDHAP31040 664 aa9.21□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 ASMTP46597 345 aa9.21□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 GPR18Q14330 331 aa9.21□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa9.21□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 SSX6Q7RTT6 188 aa9.21□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 SLC35F3Q8IY50 421 aa9.21□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF354BQ96LW1 612 aa9.21□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 AHSPQ9NZD4 102 aa9.21□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa9.21□□□□□ -0.94
TRPS1-211ENST00000520276 A0A1W2PRQ8 180 aa9.21□□□□□ -0.94
TRPS1-211ENST00000520276 STX11O75558 287 aa9.21□□□□□ -0.94
TRPS1-211ENST00000520276 IGHV2-5P01817 119 aa9.21□□□□□ -0.94
TRPS1-211ENST00000520276 IL5P05113 134 aa9.21□□□□□ -0.94
TRPS1-211ENST00000520276 F2RL1P55085 397 aa9.21□□□□□ -0.94
TRPS1-211ENST00000520276 FOXC1Q12948 553 aa9.21□□□□□ -0.94
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM44Q2T9K0 475 aa9.21□□□□□ -0.94
TRPS1-211ENST00000520276 ENTPD8Q5MY95 495 aa9.21□□□□□ -0.94
TRPS1-211ENST00000520276 C3orf33Q6P1S2 294 aa9.21□□□□□ -0.94
TRPS1-211ENST00000520276 CD300LDQ6UXZ3 194 aa9.21□□□□□ -0.94
TRPS1-211ENST00000520276 PXKQ7Z7A4 578 aa9.21□□□□□ -0.94
TRPS1-211ENST00000520276 CPOQ8IVL8 374 aa9.21□□□□□ -0.94
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF383Q8NA42 475 aa9.21□□□□□ -0.94
TRPS1-211ENST00000520276 AGBL5Q8NDL9 886 aa9.21□□□□□ -0.94
TRPS1-211ENST00000520276 OR6T1Q8NGN1 323 aa9.21□□□□□ -0.94
TRPS1-211ENST00000520276 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
TRPS1-211ENST00000520276 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
TRPS1-211ENST00000520276 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
TRPS1-211ENST00000520276 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
TRPS1-211ENST00000520276 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
TRPS1-211ENST00000520276 POLE3Q9NRF9 147 aa9.21□□□□□ -0.94
TRPS1-211ENST00000520276 A0A087WUU8 490 aa9.21□□□□□ -0.94
TRPS1-211ENST00000520276 UBE2QL1A1L167 161 aa9.21□□□□□ -0.94
TRPS1-211ENST00000520276 DCDC2BA2VCK2 349 aa9.21□□□□□ -0.94
TRPS1-211ENST00000520276 RFPL4AA6NLU0 287 aa9.21□□□□□ -0.94
TRPS1-211ENST00000520276 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa9.21□□□□□ -0.94
TRPS1-211ENST00000520276 CTDSPLO15194 276 aa9.21□□□□□ -0.94
TRPS1-211ENST00000520276 SURF4O15260 269 aa9.21□□□□□ -0.94
TRPS1-211ENST00000520276 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
TRPS1-211ENST00000520276 REM1O75628 298 aa9.21□□□□□ -0.94
TRPS1-211ENST00000520276 SNAPC5O75971 98 aa9.21□□□□□ -0.94
TRPS1-211ENST00000520276 HTR5AP47898 357 aa9.21□□□□□ -0.94
TRPS1-211ENST00000520276 SSX2Q16385 188 aa9.21□□□□□ -0.94
TRPS1-211ENST00000520276 DHRS13Q6UX07 377 aa9.21□□□□□ -0.94
TRPS1-211ENST00000520276 PMM1Q92871 262 aa9.21□□□□□ -0.94
TRPS1-211ENST00000520276 SLAMF9Q96A28 289 aa9.21□□□□□ -0.94
TRPS1-211ENST00000520276 ISOC2Q96AB3 205 aa9.21□□□□□ -0.94
TRPS1-211ENST00000520276 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa9.21□□□□□ -0.94
TRPS1-211ENST00000520276 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa9.2□□□□□ -0.94
TRPS1-211ENST00000520276 C9orf170A2RU37 121 aa9.2□□□□□ -0.94
TRPS1-211ENST00000520276 OR1F1O43749 312 aa9.2□□□□□ -0.94
TRPS1-211ENST00000520276 GDF9O60383 454 aa9.2□□□□□ -0.94
TRPS1-211ENST00000520276 KRT33AO76009 404 aa9.2□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms