RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
HERC3-211ENST00000513325 SVEP1Q4LDE5 3571 aa14.56□□□□□ -0.08
HERC3-211ENST00000513325 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
HERC3-211ENST00000513325 CHP2O43745 196 aa14.55□□□□□ -0.08
HERC3-211ENST00000513325 UBL3O95164 117 aa14.55□□□□□ -0.08
HERC3-211ENST00000513325 CH25HO95992 272 aa14.55□□□□□ -0.08
HERC3-211ENST00000513325 ALDH3B1P43353 468 aa14.55□□□□□ -0.08
HERC3-211ENST00000513325 SEC24CP53992 1094 aa14.55□□□□□ -0.08
HERC3-211ENST00000513325 CDH15P55291 814 aa14.55□□□□□ -0.08
HERC3-211ENST00000513325 RBBP4Q09028 425 aa14.55□□□□□ -0.08
HERC3-211ENST00000513325 CCNIQ14094 377 aa14.55□□□□□ -0.08
HERC3-211ENST00000513325 SELPLGQ14242 412 aa14.55□□□□□ -0.08
HERC3-211ENST00000513325 RAB39AQ14964 217 aa14.55□□□□□ -0.08
HERC3-211ENST00000513325 CYP51A1Q16850 503 aa14.55□□□□□ -0.08
HERC3-211ENST00000513325 ENTPD8Q5MY95 495 aa14.55□□□□□ -0.08
HERC3-211ENST00000513325 WDR88Q6ZMY6 472 aa14.55□□□□□ -0.08
HERC3-211ENST00000513325 SLC35D2Q76EJ3 337 aa14.55□□□□□ -0.08
HERC3-211ENST00000513325 DHDDSQ86SQ9 333 aa14.55□□□□□ -0.08
HERC3-211ENST00000513325 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
HERC3-211ENST00000513325 GPR32P1Q8NGA4 272 aa14.55□□□□□ -0.08
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HERC3-211ENST00000513325 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
HERC3-211ENST00000513325 GLTPQ9NZD2 209 aa14.55□□□□□ -0.08
HERC3-211ENST00000513325 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
HERC3-211ENST00000513325 FZR1Q9UM11 496 aa14.55□□□□□ -0.08
HERC3-211ENST00000513325 NDUFAF1Q9Y375 327 aa14.55□□□□□ -0.08
HERC3-211ENST00000513325 LYPD3O95274 346 aa14.54□□□□□ -0.08
HERC3-211ENST00000513325 HPXP02790 462 aa14.54□□□□□ -0.08
HERC3-211ENST00000513325 THY1P04216 161 aa14.54□□□□□ -0.08
HERC3-211ENST00000513325 C8BP07358 591 aa14.54□□□□□ -0.08
HERC3-211ENST00000513325 COL8A2P25067 703 aa14.54□□□□□ -0.08
HERC3-211ENST00000513325 SRP14P37108 136 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
HERC3-211ENST00000513325 MTPNP58546 118 aa14.54□□□□□ -0.08
HERC3-211ENST00000513325 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
HERC3-211ENST00000513325 ZNF74Q16587 644 aa14.54□□□□□ -0.08
HERC3-211ENST00000513325 FXNQ16595 210 aa14.54□□□□□ -0.08
HERC3-211ENST00000513325 ELFN2Q5R3F8 820 aa14.54□□□□□ -0.08
HERC3-211ENST00000513325 LIPNQ5VXI9 398 aa14.54□□□□□ -0.08
HERC3-211ENST00000513325 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
HERC3-211ENST00000513325 CARM1Q86X55 608 aa14.54□□□□□ -0.08
HERC3-211ENST00000513325 ZNF584Q8IVC4 421 aa14.54□□□□□ -0.08
HERC3-211ENST00000513325 LRRC17Q8N6Y2 441 aa14.54□□□□□ -0.08
HERC3-211ENST00000513325 OR4D11Q8NGI4 311 aa14.54□□□□□ -0.08
HERC3-211ENST00000513325 OR6X1Q8NH79 312 aa14.54□□□□□ -0.08
HERC3-211ENST00000513325 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
HERC3-211ENST00000513325 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa14.54□□□□□ -0.08
HERC3-211ENST00000513325 DYDC1Q8WWB3 177 aa14.54□□□□□ -0.08
HERC3-211ENST00000513325 C1orf159Q96HA4 380 aa14.54□□□□□ -0.08
HERC3-211ENST00000513325 CGREF1Q99674 301 aa14.54□□□□□ -0.08
HERC3-211ENST00000513325 RABEP2Q9H5N1 569 aa14.54□□□□□ -0.08
HERC3-211ENST00000513325 TAS2R5Q9NYW4 299 aa14.54□□□□□ -0.08
HERC3-211ENST00000513325 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
HERC3-211ENST00000513325 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
HERC3-211ENST00000513325 ANGPT2O15123 496 aa14.53□□□□□ -0.08
HERC3-211ENST00000513325 RNF13O43567 381 aa14.53□□□□□ -0.08
HERC3-211ENST00000513325 SERPINA5P05154 406 aa14.53□□□□□ -0.08
HERC3-211ENST00000513325 LSP1P33241 339 aa14.53□□□□□ -0.08
HERC3-211ENST00000513325 RPS23P62266 143 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
HERC3-211ENST00000513325 ZP4Q12836 540 aa14.53□□□□□ -0.08
HERC3-211ENST00000513325 MELKQ14680 651 aa14.53□□□□□ -0.08
HERC3-211ENST00000513325 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
HERC3-211ENST00000513325 LRFN4Q6PJG9 635 aa14.53□□□□□ -0.08
HERC3-211ENST00000513325 RETREG3Q86VR2 466 aa14.53□□□□□ -0.08
HERC3-211ENST00000513325 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
HERC3-211ENST00000513325 SLC22A24Q8N4F4 322 aa14.53□□□□□ -0.08
HERC3-211ENST00000513325 DPP10Q8N608 796 aa14.53□□□□□ -0.08
HERC3-211ENST00000513325 ZNF566Q969W8 418 aa14.53□□□□□ -0.08
HERC3-211ENST00000513325 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
HERC3-211ENST00000513325 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa14.53□□□□□ -0.08
HERC3-211ENST00000513325 NANSQ9NR45 359 aa14.53□□□□□ -0.08
HERC3-211ENST00000513325 TMEM38BQ9NVV0 291 aa14.53□□□□□ -0.08
HERC3-211ENST00000513325 DUSP13Q9UII6 198 aa14.53□□□□□ -0.08
HERC3-211ENST00000513325 FBXL3Q9UKT7 428 aa14.53□□□□□ -0.08
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HERC3-211ENST00000513325 NAT2P11245 290 aa14.52□□□□□ -0.09
HERC3-211ENST00000513325 CD247P20963 164 aa14.52□□□□□ -0.09
HERC3-211ENST00000513325 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
HERC3-211ENST00000513325 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
HERC3-211ENST00000513325 TTMPQ5BVD1 217 aa14.52□□□□□ -0.09
HERC3-211ENST00000513325 UGT2A3Q6UWM9 527 aa14.52□□□□□ -0.09
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HERC3-211ENST00000513325 RDH5Q92781 318 aa14.52□□□□□ -0.09
HERC3-211ENST00000513325 TAMM41Q96BW9 452 aa14.52□□□□□ -0.09
HERC3-211ENST00000513325 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
HERC3-211ENST00000513325 SH3GL3Q99963 347 aa14.52□□□□□ -0.09
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HERC3-211ENST00000513325 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
HERC3-211ENST00000513325 SLC7A8Q9UHI5 535 aa14.52□□□□□ -0.09
HERC3-211ENST00000513325 SLC7A7Q9UM01 511 aa14.52□□□□□ -0.09
HERC3-211ENST00000513325 A0A1W2PPW3 197 aa14.51□□□□□ -0.09
HERC3-211ENST00000513325 TRAPPC13A5PLN9 417 aa14.51□□□□□ -0.09
HERC3-211ENST00000513325 DHHO43323 396 aa14.51□□□□□ -0.09
HERC3-211ENST00000513325 TCF21O43680 179 aa14.51□□□□□ -0.09
HERC3-211ENST00000513325 FAM157BP0CG42 384 aa14.51□□□□□ -0.09
HERC3-211ENST00000513325 UMPSP11172 480 aa14.51□□□□□ -0.09
HERC3-211ENST00000513325 ACHEP22303 614 aa14.51□□□□□ -0.09
HERC3-211ENST00000513325 PCGF2P35227 344 aa14.51□□□□□ -0.09
HERC3-211ENST00000513325 NFYCQ13952 458 aa14.51□□□□□ -0.09
HERC3-211ENST00000513325 RINLQ6ZS11 566 aa14.51□□□□□ -0.09
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