RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507116.5

PDE4D-216, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 3,350 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-216ENST00000507116 LDB2O43679 373 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 GNG7O60262 68 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 MT-CO2P00403 227 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 TPSB2P20231 275 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 BMP5P22003 454 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 S100GP29377 79 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 DCTDP32321 178 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 PTPN7P35236 360 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 CRYBB2P43320 205 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 NPY4RP50391 375 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 SH3BP2P78314 561 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 FABP5Q01469 135 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 TMEM132DQ14C87 1099 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 TPSAB1Q15661 275 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 MAPK14Q16539 360 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 TMEM177Q53S58 311 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 DCAF12L2Q5VW00 463 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 CARD17Q5XLA6 110 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 ANKRD34AQ69YU3 496 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 FAM180AQ6UWF9 173 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 RTN4RL2Q86UN3 420 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 WFDC8Q8IUA0 241 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 RNF149Q8NC42 400 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 OR56A1Q8NGH5 318 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 OR4A4PQ8NGN8 299 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 OR5M3Q8NGP4 307 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 DCAF4Q8WV16 495 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 AUTS2Q8WXX7 1259 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 CPB2Q96IY4 423 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 SLC46A1Q96NT5 459 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 SPATC1LQ9H0A9 340 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 GSTO2Q9H4Y5 243 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 CXorf36Q9H7Y0 433 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 FOXJ3Q9UPW0 622 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 AMDHD2Q9Y303 409 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 FAM96BQ9Y3D0 163 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 CITO14578 2027 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 MON2Q7Z3U7 1717 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 FAM183AA6NL82 134 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 IDSB3KWA1 339 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 METTL18O95568 372 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 KNG1P01042 644 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 ACHEP22303 614 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 ZBTB25P24278 435 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 FPR2P25090 351 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 EPHA2P29317 976 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 GIPRP48546 466 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 SULT1A1P50225 295 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 ATP5J2P56134 94 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 FOXL2P58012 376 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 TPI1P60174 286 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 JAG1P78504 1218 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 CDC42EP1Q00587 391 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 ST3GAL4Q11206 333 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 COX19Q49B96 90 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 OVOS1Q6IE37 1185 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 ZNF562Q6V9R5 426 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa5.66□□□□□ -1.5
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PDE4D-216ENST00000507116 TMEM176AQ96HP8 235 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 KCTD7Q96MP8 289 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 MAGT1Q9H0U3 335 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 TMEM231Q9H6L2 316 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 CWH43Q9H720 699 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 TMEM27Q9HBJ8 222 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 HHATLQ9HCP6 504 aa5.66□□□□□ -1.5
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PDE4D-216ENST00000507116 MARCH5Q9NX47 278 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 SLC2A8Q9NY64 477 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 PADI3Q9ULW8 664 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 COX11Q9Y6N1 276 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 TRAV25A0A0B4J276 109 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 TMEM235A6NFC5 223 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 TBX19O60806 448 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 GPR32O75388 356 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 TGFB1P01137 390 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 OR5G3P0C626 314 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 CD79AP11912 226 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 GPR12P47775 334 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 CRISP3P54108 245 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 PITPNAQ00169 270 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 RBBP7Q16576 425 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 PLPPR5Q32ZL2 321 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 C17orf78Q8N4C9 275 aa5.66□□□□□ -1.5
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