RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498530.5

PMPCB-208, Transcript of peptidase, mitochondrial processing beta subunit, human

TSL 2

Gene PMPCB, Length 1,161 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PMPCB-208	ENST00000498530	METTL7B	Q6UX53	244 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	PRSS41	Q7RTY9	318 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	HDDC2	Q7Z4H3	204 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	SLC25A42	Q86VD7	318 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	APRG1	Q8IVJ8	170 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	CADM2	Q8N3J6	435 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	DNASE2B	Q8WZ79	361 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	RAB1C	Q92928	201 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	KIAA1143	Q96AT1	154 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	CMTM7	Q96FZ5	175 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	ITCH	Q96J02	903 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	JSRP1	Q96MG2	331 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	HIST1H4G	Q99525	98 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	WWOX	Q9NZC7	414 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	FLVCR1	Q9Y5Y0	555 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	4.62	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	KIF14	Q15058	1648 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530		A0A0G2JRQ6	117 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530		A0A1B0GU03	582 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530		A0A1W2PPV4	95 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530		E9PQ18	207 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	MBTPS2	O43462	519 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	CMA1	P23946	247 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	NTS	P30990	170 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	RORA	P35398	523 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	LONP1	P36776	959 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	CD151	P48509	253 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	GSS	P48637	474 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	KRTAP10-7	P60409	375 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	ASAH1	Q13510	395 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	PGGHG	Q32M88	737 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	CSGALNACT2	Q8N6G5	542 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	OR9A1P	Q8NGU1	263 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	AGAP11	Q8TF27	550 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	FGF11	Q92914	225 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	ASB9	Q96DX5	294 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	CERS2	Q96G23	380 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	C20orf85	Q9H1P6	137 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	GBA3	Q9H227	469 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	RANBP3	Q9H6Z4	567 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	PXMP2	Q9NR77	195 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	B4GALT7	Q9UBV7	327 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	TCF20	Q9UGU0	1960 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	GLI3	P10071	1580 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	IGLV3-22	A0A075B6J6	115 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	ZNF879	B4DU55	563 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	PRR23D1	E9PI22	279 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530		K7N7A8	449 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	BCKDK	O14874	412 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	MRPS12	O15235	138 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	LYPLA1	O75608	230 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	IGHV3-13	P01766	116 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	DCN	P07585	359 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	UBC	P0CG48	685 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	STAG3L2	P0CL84	134 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	PRR23D2	P0DMB1	279 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	CD82	P27701	267 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	AQP1	P29972	269 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	CCNG1	P51959	295 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	SLC25A1	P53007	311 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	IST1	P53990	364 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	LIN9	Q5TKA1	542 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	ADAM5	Q6NVV9	412 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	TTC23L	Q6PF05	361 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	UNQ9370/PRO34162	Q6UXP9	181 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	GPRIN3	Q6ZVF9	776 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	SLC26A11	Q86WA9	606 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	PDIK1L	Q8N165	341 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	JAGN1	Q8N5M9	183 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	TTC29	Q8NA56	475 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	OR10G3	Q8NGC4	313 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	OR1E3	Q8WZA6	343 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	FGF14	Q92915	247 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	SMARCD2	Q92925	531 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	TMEM246	Q9BRR3	403 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	TXLNG	Q9NUQ3	528 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	UXT	Q9UBK9	157 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	SLC17A4	Q9Y2C5	497 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	STK38L	Q9Y2H1	464 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	MOB4	Q9Y3A3	225 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530		V9GY05	133 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	TIAM1	Q13009	1591 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	IGHV3OR16-13	A0A075B7E8	117 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530		M0R3G1	203 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	CDC7	O00311	574 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	AIRE	O43918	545 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	EIF4E2	O60573	245 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	EED	O75530	441 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	CLPX	O76031	633 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	TGM6	O95932	706 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	HLA-H	P01893	362 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	SEMG1	P04279	462 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	CCDC172	P0C7W6	258 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	UGT1A3	P35503	534 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PMPCB-208	ENST00000498530	NPBWR2	P48146	333 aa		4.59	□□□□□ -1.67

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