RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485450.5

USP4-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 4, humanhuman

TSL 2

Gene USP4, Length 3,541 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4-211ENST00000485450 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 CLUHP3Q96NS8 147 aa6.99□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 SRMSQ9H3Y6 488 aa6.99□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 BRF2Q9HAW0 419 aa6.99□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 THSD1Q9NS62 852 aa6.99□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 WWOXQ9NZC7 414 aa6.99□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 NTMQ9P121 344 aa6.99□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 MGAT4CQ9UBM8 478 aa6.99□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 ASPMQ8IZT6 3477 aa6.98□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 TMEM129A0AVI4 362 aa6.98□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 TMEM218A2RU14 115 aa6.98□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 DCDC2BA2VCK2 349 aa6.98□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 ST6GAL1P15907 406 aa6.98□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 NPBWR1P48145 328 aa6.98□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 GLO1Q04760 184 aa6.98□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 TRAM1Q15629 374 aa6.98□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 C1orf185Q5T7R7 199 aa6.98□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 C12orf73Q69YU5 71 aa6.98□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 NXPE4Q6UWF7 544 aa6.98□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 OR6K3Q8NGY3 331 aa6.98□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 SPPL2AQ8TCT8 520 aa6.98□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa6.98□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 SELENOMQ8WWX9 145 aa6.98□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 ABHD1Q96SE0 405 aa6.98□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 SCNM1Q9BWG6 230 aa6.98□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 ARL6Q9H0F7 186 aa6.98□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 C20orf85Q9H1P6 137 aa6.98□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 ADAM29Q9UKF5 820 aa6.98□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa6.98□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 A0A1B0GUH1 482 aa6.98□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 J3QW42 95 aa6.98□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 HCRTR2O43614 444 aa6.98□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 F12P00748 615 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 CD3GP09693 182 aa6.98□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 NR2F6P10588 404 aa6.98□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 HSD3B1P14060 373 aa6.98□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 FOLR1P15328 257 aa6.98□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 HMGCS1Q01581 520 aa6.98□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 GTF2H2Q13888 395 aa6.98□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 SLC22A10Q63ZE4 541 aa6.98□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 SLC25A24Q6NUK1 477 aa6.98□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa6.98□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 DEGS2Q6QHC5 323 aa6.98□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 DHRS13Q6UX07 377 aa6.98□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 LRRN1Q6UXK5 716 aa6.98□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 MOB3CQ70IA8 216 aa6.98□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 OR2L5Q8NG80 312 aa6.98□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 OR1L3Q8NH93 324 aa6.98□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 NEIL3Q8TAT5 605 aa6.98□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 LCN9Q8WX39 176 aa6.98□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 GPR87Q9BY21 358 aa6.98□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 PIGMQ9H3S5 423 aa6.98□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 TCF7L1Q9HCS4 588 aa6.98□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 FAM60AQ9NP50 221 aa6.98□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 ACER3Q9NUN7 267 aa6.98□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 OCIAD1Q9NX40 245 aa6.98□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 RASL12Q9NYN1 266 aa6.98□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 ASF1AQ9Y294 204 aa6.98□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 CACNA1HO95180 2353 aa6.98□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 AKAP13Q12802 2813 aa6.98□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 EFSO43281 561 aa6.98□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 OR10H2O60403 315 aa6.98□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 CLEC3AO75596 197 aa6.98□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 MYF5P13349 255 aa6.98□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 DIO1P49895 249 aa6.98□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 HGFACQ04756 655 aa6.98□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 SMCO1Q147U7 214 aa6.98□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 CDNFQ49AH0 187 aa6.98□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 SGO1Q5FBB7 561 aa6.98□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 NKAIN2Q5VXU1 208 aa6.98□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa6.98□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 RAB42Q8N4Z0 105 aa6.98□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 ZNF321PQ8N8H1 164 aa6.98□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 AQP11Q8NBQ7 271 aa6.98□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 OR8J1Q8NGP2 316 aa6.98□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 THAP6Q8TBB0 222 aa6.98□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 CHST8Q9H2A9 424 aa6.98□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 KLHL1Q9NR64 748 aa6.98□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 CA10Q9NS85 328 aa6.98□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 A0A0U1RQV5 110 aa6.97□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 HCRTR1O43613 425 aa6.97□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 SMPD2O60906 423 aa6.97□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 GASTP01350 101 aa6.97□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 CNR1P21554 472 aa6.97□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 GAB1Q13480 694 aa6.97□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 H3F3CQ6NXT2 135 aa6.97□□□□□ -1.29
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