RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485019.1

RBM34-208, Transcript of RNA binding motif protein 34, human

TSL 3

Gene RBM34, Length 409 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM34-208	ENST00000485019	NPIPB4	C9JG80	1138 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RBM34-208	ENST00000485019	XKRY	O14609	159 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RBM34-208	ENST00000485019	PPP1R3D	O95685	299 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RBM34-208	ENST00000485019	QDPR	P09417	244 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RBM34-208	ENST00000485019	ANXA8	P13928	327 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RBM34-208	ENST00000485019	ZNF23	P17027	643 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RBM34-208	ENST00000485019	PRKACG	P22612	351 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RBM34-208	ENST00000485019	FXYD6P3	P58550	94 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RBM34-208	ENST00000485019	RAP1B	P61224	184 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RBM34-208	ENST00000485019	RAP1A	P62834	184 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RBM34-208	ENST00000485019	MYBPC1	Q00872	1141 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RBM34-208	ENST00000485019	CD47	Q08722	323 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RBM34-208	ENST00000485019	GABRA6	Q16445	453 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RBM34-208	ENST00000485019	FBXW10	Q5XX13	1052 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RBM34-208	ENST00000485019	FAM205BP	Q63HN1	556 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RBM34-208	ENST00000485019	RPL13AP3	Q6NVV1	102 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RBM34-208	ENST00000485019	SHQ1	Q6PI26	577 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
RBM34-208	ENST00000485019	ZNF620	Q6ZNG0	422 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RBM34-208	ENST00000485019	RASSF6	Q6ZTQ3	369 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RBM34-208	ENST00000485019	HIPK1	Q86Z02	1210 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RBM34-208	ENST00000485019	WFDC8	Q8IUA0	241 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RBM34-208	ENST00000485019	ATG16L2	Q8NAA4	619 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RBM34-208	ENST00000485019	ACBD4	Q8NC06	268 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RBM34-208	ENST00000485019	NOXO1	Q8NFA2	376 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RBM34-208	ENST00000485019	OR52L1	Q8NGH7	329 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RBM34-208	ENST00000485019	HSD17B8	Q92506	261 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RBM34-208	ENST00000485019	HDAC2	Q92769	488 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
RBM34-208	ENST00000485019	STMN2	Q93045	179 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RBM34-208	ENST00000485019	MUCL1	Q96DR8	90 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RBM34-208	ENST00000485019	NRBF2	Q96F24	287 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RBM34-208	ENST00000485019		Q96M85	177 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RBM34-208	ENST00000485019	ERMAP	Q96PL5	475 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
RBM34-208	ENST00000485019	RBP7	Q96R05	134 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RBM34-208	ENST00000485019	GPX7	Q96SL4	187 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
RBM34-208	ENST00000485019	NRIP3	Q9NQ35	241 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RBM34-208	ENST00000485019	KIF17	Q9P2E2	1029 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RBM34-208	ENST00000485019	MED12L	Q86YW9	2145 aa		11.21	□□□□□ -0.62
RBM34-208	ENST00000485019	NBAS	A2RRP1	2371 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RBM34-208	ENST00000485019		A0A096LPE4	126 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RBM34-208	ENST00000485019	TEX13C	A0A0J9YWL9	993 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RBM34-208	ENST00000485019		A0A1W2PPZ6	126 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RBM34-208	ENST00000485019	CENPBD1	B2RD01	187 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RBM34-208	ENST00000485019		G3V2T6	193 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RBM34-208	ENST00000485019	RPL36A-HNRNPH2	H7BZ11	118 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RBM34-208	ENST00000485019	SOCS2	O14508	198 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RBM34-208	ENST00000485019	ENTPD5	O75356	428 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RBM34-208	ENST00000485019	SOX14	O95416	240 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RBM34-208	ENST00000485019	NR2C1	P13056	603 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RBM34-208	ENST00000485019	NOS3	P29474	1203 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RBM34-208	ENST00000485019	SDHA	P31040	664 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RBM34-208	ENST00000485019	SH3BGR	P55822	239 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
RBM34-208	ENST00000485019	ARF1	P84077	181 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
RBM34-208	ENST00000485019	COX10	Q12887	443 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RBM34-208	ENST00000485019	KRR1	Q13601	381 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
RBM34-208	ENST00000485019	CLEC12A	Q5QGZ9	265 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RBM34-208	ENST00000485019	TIMM23B	Q5SRD1	257 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RBM34-208	ENST00000485019	GPR139	Q6DWJ6	353 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RBM34-208	ENST00000485019	KLHL24	Q6TFL4	600 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RBM34-208	ENST00000485019	ARIH2OS	Q8N7S6	290 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RBM34-208	ENST00000485019	ICA1L	Q8NDH6	482 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RBM34-208	ENST00000485019	C1orf162	Q8NEQ5	155 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
RBM34-208	ENST00000485019	OR1K1	Q8NGR3	316 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RBM34-208	ENST00000485019	OR52N5	Q8NH56	324 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RBM34-208	ENST00000485019	ZNF519	Q8TB69	540 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RBM34-208	ENST00000485019	MAGEE2	Q8TD90	523 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
RBM34-208	ENST00000485019	MCHR2	Q969V1	340 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RBM34-208	ENST00000485019	RASD2	Q96D21	266 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RBM34-208	ENST00000485019	ZNF837	Q96EG3	531 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
RBM34-208	ENST00000485019	MUS81	Q96NY9	551 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RBM34-208	ENST00000485019	ALG12	Q9BV10	488 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RBM34-208	ENST00000485019	MRPL13	Q9BYD1	178 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
RBM34-208	ENST00000485019	S100A14	Q9HCY8	104 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RBM34-208	ENST00000485019	TBC1D23	Q9NUY8	699 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RBM34-208	ENST00000485019	MAGED1	Q9Y5V3	778 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
RBM34-208	ENST00000485019	CDH10	Q9Y6N8	788 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RBM34-208	ENST00000485019		A0A1W2PR80	420 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RBM34-208	ENST00000485019	OR5H1	A6NKK0	313 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RBM34-208	ENST00000485019	ZNF99	A8MXY4	864 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
RBM34-208	ENST00000485019		H3BN98	237 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RBM34-208	ENST00000485019		H3BNX3	289 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RBM34-208	ENST00000485019		H7C1C5	153 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RBM34-208	ENST00000485019	IMPA2	O14732	288 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RBM34-208	ENST00000485019	DHH	O43323	396 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RBM34-208	ENST00000485019	SEC14L2	O76054	403 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RBM34-208	ENST00000485019	THBD	P07204	575 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RBM34-208	ENST00000485019	POU1F1	P28069	291 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RBM34-208	ENST00000485019	ZNF84	P51523	738 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RBM34-208	ENST00000485019	UBE2N	P61088	152 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
RBM34-208	ENST00000485019	LCN6	P62502	163 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RBM34-208	ENST00000485019	PPA1	Q15181	289 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RBM34-208	ENST00000485019	TAB1	Q15750	504 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RBM34-208	ENST00000485019	HIKESHI	Q53FT3	197 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RBM34-208	ENST00000485019	ANKRD16	Q6P6B7	361 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RBM34-208	ENST00000485019	KLHL17	Q6TDP4	642 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RBM34-208	ENST00000485019	C22orf34	Q6ZV56	151 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RBM34-208	ENST00000485019	FAM122B	Q7Z309	247 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RBM34-208	ENST00000485019	P2RY8	Q86VZ1	359 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RBM34-208	ENST00000485019	JAZF1	Q86VZ6	243 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RBM34-208	ENST00000485019	ZDHHC13	Q8IUH4	622 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RBM34-208	ENST00000485019	SVOPL	Q8N434	492 aa		11.19	□□□□□ -0.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.4 ms