RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481848.6

SOGA3-207, Transcript of SOGA family member 3, humanhuman

APPRIS P5 TSL 5 BASIC

Gene SOGA3, Length 11,464 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3-207ENST00000481848 FAM74A3Q4VXF1 159 aa11.61□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 SPICQ8N5J4 248 aa11.61□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 TMEM217Q8N7C4 229 aa11.61□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 OR10P1Q8NGE3 313 aa11.61□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 FOXN4Q96NZ1 517 aa11.61□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa11.61□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 PSAT1Q9Y617 370 aa11.61□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 CPEP16870 476 aa11.61□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 AGTR2P50052 363 aa11.61□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 ERASQ7Z444 233 aa11.61□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 TAC4Q86UU9 113 aa11.61□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 MAP3K3Q99759 626 aa11.61□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 SYT17Q9BSW7 474 aa11.61□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 TRAPPC4Q9Y296 219 aa11.61□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 C5orf52A6NGY3 159 aa11.61□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 HAAOP46952 286 aa11.61□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 RTL8BQ17RB0 113 aa11.61□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 RPEL1Q2QD12 228 aa11.61□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 SERINC5Q86VE9 423 aa11.61□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 TMEM156Q8N614 296 aa11.61□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 OR2M3Q8NG83 312 aa11.61□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 FBXO27Q8NI29 283 aa11.61□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 MTX2O75431 263 aa11.61□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 RPL12P30050 165 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 KIAA1958Q8N8K9 716 aa11.61□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 IL36AQ9UHA7 158 aa11.61□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 HEATR5AQ86XA9 2040 aa11.61□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 PPM1DO15297 605 aa11.61□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 PAPLNO95428 1278 aa11.61□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 DEGS1O15121 323 aa11.61□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 GLAP06280 429 aa11.61□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 ACRV1P26436 265 aa11.61□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP11.61□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 C9orf152Q5JTZ5 239 aa11.61□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 NECAP1Q8NC96 275 aa11.61□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa11.61□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 MEGF10Q96KG7 1140 aa11.61□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 HSPB2A8KAH6 182 aa11.61□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 CTXN1P60606 82 aa11.61□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 HSPB2Q16082 182 aa11.61□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 SLC24A5Q71RS6 500 aa11.61□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 DHRS4Q9BTZ2 278 aa11.61□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 ELOVL1Q9BW60 279 aa11.61□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 DEFB129Q9H1M3 183 aa11.61□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 SLC17A3O00476 420 aa11.61□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 SCO1O75880 301 aa11.61□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 IL5P05113 134 aa11.61□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 GLYATL3Q5SZD4 288 aa11.61□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 SAXO2Q658L1 398 aa11.61□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 FCRLBQ6BAA4 426 aa11.61□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 OR5AR1Q8NGP9 310 aa11.61□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 LHX4Q969G2 390 aa11.61□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 FBXW5Q969U6 566 aa11.61□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 LHX3Q9UBR4 397 aa11.61□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 MED12Q93074 2177 aa11.61□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa11.61□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa11.61□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 CSNK1A1P48729 337 aa11.61□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 SLC35A2P78381 396 aa11.61□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 CAPNS2Q96L46 248 aa11.61□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 TRIB1Q96RU8 372 aa11.61□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 WDR18Q9BV38 432 aa11.61□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 GPR61Q9BZJ8 451 aa11.61□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 SIAH2O43255 324 aa11.6□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 CHRM2P08172 466 aa11.6□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 GPM6AP51674 278 aa11.6□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 TMEM107Q6UX40 140 aa11.6□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 LRRC3BQ96PB8 259 aa11.6□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 SORT1Q99523 831 aa11.6□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 RAB6CQ9H0N0 254 aa11.6□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 SLC23A1Q9UHI7 598 aa11.6□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 TRAPPC2LH3BP13 241 aa11.6□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 TMEM123Q8N131 208 aa11.6□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 UPK3BL1B0FP48 263 aa11.6□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 UPK3BL2E5RIL1 263 aa11.6□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 ASGR2P07307 311 aa11.6□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 LIMS3P0CW19 117 aa11.6□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 LIMS4P0CW20 117 aa11.6□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 TMEM11P17152 192 aa11.6□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 ENPP1P22413 925 aa11.6□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 NXNL2Q5VZ03 156 aa11.6□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa11.6□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 A0A1B0GTQ1 180 aa11.6□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 APBB3O95704 486 aa11.6□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 KDM4DQ6B0I6 523 aa11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.6 ms