RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463041.1

PTPRF-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRF, Length 298 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-210ENST00000463041 LIPHQ8WWY8 451 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 HTRA1Q92743 480 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 TMEM54Q969K7 222 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF566Q969W8 418 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 FOXB1Q99853 325 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 PRSS27Q9BQR3 290 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 ULBP2Q9BZM5 246 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 CCDC134Q9H6E4 229 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 RIMS3Q9UJD0 308 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 FBXL3Q9UKT7 428 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 CMAHPQ9Y471 501 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 MXRA5Q9NR99 2828 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 DNHD1Q96M86 4753 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 A0A1W2PRG6 482 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 ELOVL7A1L3X0 281 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 CENPBD1B2RD01 187 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 VWC2LB2RUY7 222 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 hCG_2039718K7EN88 272 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 FXYD1O00168 92 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 DHHO43323 396 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 SERPINI2O75830 405 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 OR7A10O76100 309 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 UBL3O95164 117 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 FARS2O95363 451 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 PTHP01270 115 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 IFNA2P01563 188 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 HLA-HP01893 362 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 SERPINA5P05154 406 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 CELA3BP08861 270 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 OR8G3PP0DMU2 310 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 UMPSP11172 480 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF35P13682 527 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 IFNA8P32881 189 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 GLRXP35754 106 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 NR4A2P43354 598 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 GZMKP49863 264 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 TAS2R41P59536 307 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 SELENOWP63302 87 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 PIGFQ07326 219 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 NPRL3Q12980 569 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 NRN1LQ496H8 165 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 HSP90B2PQ58FF3 399 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 REP15Q6BDI9 236 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 PODNL1Q6PEZ8 512 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 LRFN4Q6PJG9 635 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 HDDC2Q7Z4H3 204 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 DPPA2Q7Z7J5 298 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 NKAIN4Q8IVV8 208 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 SKA3Q8IX90 412 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 SLC22A24Q8N4F4 322 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 LRRC17Q8N6Y2 441 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 TMEM239Q8WW34 195 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF75AQ96N20 296 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 FOXN4Q96NZ1 517 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 SORCS2Q96PQ0 1159 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 KCNK17Q96T54 332 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 PIMREGQ9BSJ6 248 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 SEC61A2Q9H9S3 476 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 TMEM160Q9NX00 188 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 ADAM21Q9UKJ8 722 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 WNK2Q9Y3S1 2297 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 SLC22A23A1A5C7 686 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 FAM220BPB1ANY3 271 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 SYNGR3O43761 229 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 CCDC22O60826 627 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 SEC14L2O76054 403 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 LY6HO94772 140 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 STAMBPO95630 424 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 RAB36O95755 333 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 IGHG1P01857 330 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 QDPRP09417 244 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 TSPAN19P0C672 248 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 PGA4P0DJD7 388 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 PGA3P0DJD8 388 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 ACADSP16219 412 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 GIFP27352 417 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 LSP1P33241 339 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 GIPRP48546 466 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF84P51523 738 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 UGT2B15P54855 530 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 GALK2Q01415 458 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 ST3GAL3Q11203 375 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP6.29□□□□□ -1.41e-8■■□□□ 11.7
PTPRF-210ENST00000463041 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRF-210ENST00000463041 LAPTM4AQ15012 233 aa6.29□□□□□ -1.4
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