RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462602.6

SH3BP4-208, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP4, Length 257 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-208ENST00000462602 IL18BPO95998 194 aa8.33□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 CRABP1P29762 137 aa8.33□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 OPRM1P35372 400 aa8.33□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 CSNK1A1P48729 337 aa8.33□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 SELENOPP49908 381 aa8.33□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 SIRPAP78324 504 aa8.33□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 CD47Q08722 323 aa8.33□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 CAMK2DQ13557 499 aa8.33□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 GUSBP1Q15486 140 aa8.33□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 MESTQ5EB52 335 aa8.33□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 THEM4Q5T1C6 240 aa8.33□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF691Q5VV52 312 aa8.33□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 MTFR2Q6P444 385 aa8.33□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 LEG1Q6P5S2 330 aa8.33□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 DNM1P34Q6PK57 102 aa8.33□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 C20orf196Q8IYI0 205 aa8.33□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 GCNT2Q8N0V5 402 aa8.33□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 FAM26EQ8N5C1 309 aa8.33□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 TCEANCQ8N8B7 351 aa8.33□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa8.33□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 POMGNT2Q8NAT1 580 aa8.33□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC37A3Q8NCC5 494 aa8.33□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 NPEPL1Q8NDH3 523 aa8.33□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 SDR9C7Q8NEX9 313 aa8.33□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 NOXO1Q8NFA2 376 aa8.33□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 OR6N1Q8NGY5 312 aa8.33□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM163Q8TC26 289 aa8.33□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 Q96MT0 163 aa8.33□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 MUS81Q96NY9 551 aa8.33□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 DMRTA2Q96SC8 542 aa8.33□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 KCNK17Q96T54 332 aa8.33□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 NMNAT3Q96T66 252 aa8.33□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 ANKRD60Q9BZ19 345 aa8.33□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 LINC00470Q9BZP3 86 aa8.33□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 GLTPQ9NZD2 209 aa8.33□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 NBASA2RRP1 2371 aa8.33□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 ALPK2Q86TB3 2170 aa8.32□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa8.32□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC22A23A1A5C7 686 aa8.32□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 SNTNA6NMZ2 147 aa8.32□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 DENRO43583 198 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 PRKYO43930 277 aa8.32□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 TNFSF13O75888 250 aa8.32□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 C1QL1O75973 258 aa8.32□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 KRT33AO76009 404 aa8.32□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 TOXO94900 526 aa8.32□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC2A10O95528 541 aa8.32□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 PGA4P0DJD7 388 aa8.32□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 PGA3P0DJD8 388 aa8.32□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 OR3A2P47893 321 aa8.32□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 CENPAP49450 140 aa8.32□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC25A1P53007 311 aa8.32□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 EFNB1P98172 346 aa8.32□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 IL5RAQ01344 420 aa8.32□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 RUNX1T1Q06455 604 aa8.32□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 LGALS3BPQ08380 585 aa8.32□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 CRMP1Q14194 572 aa8.32□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 IGFBP7Q16270 282 aa8.32□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC25A30Q5SVS4 291 aa8.32□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 MEDAGQ5VYS4 303 aa8.32□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 CARD17Q5XLA6 110 aa8.32□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 USP51Q70EK9 711 aa8.32□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 THAP5Q7Z6K1 395 aa8.32□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM123Q8N131 208 aa8.32□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 GPR137CQ8N3F9 429 aa8.32□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 RPRMLQ8N4K4 120 aa8.32□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 SYT14Q8NB59 555 aa8.32□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 OR2T4Q8NH00 348 aa8.32□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 RHOXF1Q8NHV9 184 aa8.32□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 PRR7Q8TB68 274 aa8.32□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM54Q969K7 222 aa8.32□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 OTULINQ96BN8 352 aa8.32□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 IL4I1Q96RQ9 567 aa8.32□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 DDOQ99489 341 aa8.32□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa8.32□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 PIGMQ9H3S5 423 aa8.32□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa8.32□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 CLN6Q9NWW5 311 aa8.32□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 ASB6Q9NWX5 421 aa8.32□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 UPB1Q9UBR1 384 aa8.32□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 PROCRQ9UNN8 238 aa8.32□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 RNF6Q9Y252 685 aa8.32□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 LRRC42Q9Y546 428 aa8.32□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms