RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462335.1

PKP4-208, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 4

Gene PKP4, Length 561 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-208ENST00000462335 OR1K1Q8NGR3 316 aa8.41□□□□□ -1.06
PKP4-208ENST00000462335 OR2T29Q8NH02 315 aa8.41□□□□□ -1.06
PKP4-208ENST00000462335 MOSPD2Q8NHP6 518 aa8.41□□□□□ -1.06
PKP4-208ENST00000462335 LIPHQ8WWY8 451 aa8.41□□□□□ -1.06
PKP4-208ENST00000462335 CHID1Q9BWS9 393 aa8.41□□□□□ -1.06
PKP4-208ENST00000462335 RERGLQ9H628 205 aa8.41□□□□□ -1.06
PKP4-208ENST00000462335 SEC61A2Q9H9S3 476 aa8.41□□□□□ -1.06
PKP4-208ENST00000462335 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa8.41□□□□□ -1.06
PKP4-208ENST00000462335 FAIMQ9NVQ4 179 aa8.41□□□□□ -1.06
PKP4-208ENST00000462335 HIF3AQ9Y2N7 669 aa8.41□□□□□ -1.06
PKP4-208ENST00000462335 ATP23Q9Y6H3 246 aa8.41□□□□□ -1.06
PKP4-208ENST00000462335 U3KQV3 271 aa8.41□□□□□ -1.06
PKP4-208ENST00000462335 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
PKP4-208ENST00000462335 CENPBD1B2RD01 187 aa8.4□□□□□ -1.06
PKP4-208ENST00000462335 ZNF432O94892 652 aa8.4□□□□□ -1.06
PKP4-208ENST00000462335 RAB36O95755 333 aa8.4□□□□□ -1.06
PKP4-208ENST00000462335 CRYAAP02489 173 aa8.4□□□□□ -1.06
PKP4-208ENST00000462335 THBDP07204 575 aa8.4□□□□□ -1.06
PKP4-208ENST00000462335 OR8G3PP0DMU2 310 aa8.4□□□□□ -1.06
PKP4-208ENST00000462335 BMP4P12644 408 aa8.4□□□□□ -1.06
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PKP4-208ENST00000462335 PLP2Q04941 152 aa8.4□□□□□ -1.06
PKP4-208ENST00000462335 BSPH1Q075Z2 132 aa8.4□□□□□ -1.06
PKP4-208ENST00000462335 SGCAQ16586 387 aa8.4□□□□□ -1.06
PKP4-208ENST00000462335 TBRG1Q3YBR2 411 aa8.4□□□□□ -1.06
PKP4-208ENST00000462335 THEM4Q5T1C6 240 aa8.4□□□□□ -1.06
PKP4-208ENST00000462335 GPR139Q6DWJ6 353 aa8.4□□□□□ -1.06
PKP4-208ENST00000462335 TMEM53Q6P2H8 277 aa8.4□□□□□ -1.06
PKP4-208ENST00000462335 SMARCD3Q6STE5 483 aa8.4□□□□□ -1.06
PKP4-208ENST00000462335 C20orf204Q6ZNR8 217 aa8.4□□□□□ -1.06
PKP4-208ENST00000462335 JAZF1Q86VZ6 243 aa8.4□□□□□ -1.06
PKP4-208ENST00000462335 TMEM123Q8N131 208 aa8.4□□□□□ -1.06
PKP4-208ENST00000462335 FANK1Q8TC84 345 aa8.4□□□□□ -1.06
PKP4-208ENST00000462335 ASB10Q8WXI3 467 aa8.4□□□□□ -1.06
PKP4-208ENST00000462335 NSMAFQ92636 917 aa8.4□□□□□ -1.06
PKP4-208ENST00000462335 PIGTQ969N2 578 aa8.4□□□□□ -1.06
PKP4-208ENST00000462335 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
PKP4-208ENST00000462335 ZNF570Q96NI8 536 aa8.4□□□□□ -1.06
PKP4-208ENST00000462335 KATNB1Q9BVA0 655 aa8.4□□□□□ -1.06
PKP4-208ENST00000462335 IFT27Q9BW83 186 aa8.4□□□□□ -1.06
PKP4-208ENST00000462335 TEX12Q9BXU0 123 aa8.4□□□□□ -1.06
PKP4-208ENST00000462335 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
PKP4-208ENST00000462335 LRMDAQ9H2I8 198 aa8.4□□□□□ -1.06
PKP4-208ENST00000462335 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
PKP4-208ENST00000462335 POMPQ9Y244 141 aa8.4□□□□□ -1.06
PKP4-208ENST00000462335 SPEF1Q9Y4P9 236 aa8.4□□□□□ -1.06
PKP4-208ENST00000462335 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
PKP4-208ENST00000462335 DEFB108AA8MXU0 73 aa8.39□□□□□ -1.07
PKP4-208ENST00000462335 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa8.39□□□□□ -1.07
PKP4-208ENST00000462335 ABCD4O14678 606 aa8.39□□□□□ -1.07
PKP4-208ENST00000462335 DHHO43323 396 aa8.39□□□□□ -1.07
PKP4-208ENST00000462335 KLF4O43474 513 aa8.39□□□□□ -1.07
PKP4-208ENST00000462335 FZD7O75084 574 aa8.39□□□□□ -1.07
PKP4-208ENST00000462335 TRMUO75648 421 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
PKP4-208ENST00000462335 SEC14L2O76054 403 aa8.39□□□□□ -1.07
PKP4-208ENST00000462335 PRSS23O95084 383 aa8.39□□□□□ -1.07
PKP4-208ENST00000462335 UBL3O95164 117 aa8.39□□□□□ -1.07
PKP4-208ENST00000462335 RENP00797 406 aa8.39□□□□□ -1.07
PKP4-208ENST00000462335 PTHP01270 115 aa8.39□□□□□ -1.07
PKP4-208ENST00000462335 RAF1P04049 648 aa8.39□□□□□ -1.07
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PKP4-208ENST00000462335 B4GALT1P15291 398 aa8.39□□□□□ -1.07
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PKP4-208ENST00000462335 GSTM3P21266 225 aa8.39□□□□□ -1.07
PKP4-208ENST00000462335 ARR3P36575 388 aa8.39□□□□□ -1.07
PKP4-208ENST00000462335 ERFP50548 548 aa8.39□□□□□ -1.07
PKP4-208ENST00000462335 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
PKP4-208ENST00000462335 KRTAP10-9P60411 292 aa8.39□□□□□ -1.07
PKP4-208ENST00000462335 MYBPC1Q00872 1141 aa8.39□□□□□ -1.07
PKP4-208ENST00000462335 PIGFQ07326 219 aa8.39□□□□□ -1.07
PKP4-208ENST00000462335 NPRL3Q12980 569 aa8.39□□□□□ -1.07
PKP4-208ENST00000462335 SLC36A2Q495M3 483 aa8.39□□□□□ -1.07
PKP4-208ENST00000462335 NCMAPQ5T1S8 102 aa8.39□□□□□ -1.07
PKP4-208ENST00000462335 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa8.39□□□□□ -1.07
PKP4-208ENST00000462335 ADAM5Q6NVV9 412 aa8.39□□□□□ -1.07
PKP4-208ENST00000462335 DNM1P34Q6PK57 102 aa8.39□□□□□ -1.07
PKP4-208ENST00000462335 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa8.39□□□□□ -1.07
PKP4-208ENST00000462335 SLC16A14Q7RTX9 510 aa8.39□□□□□ -1.07
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PKP4-208ENST00000462335 NOXO1Q8NFA2 376 aa8.39□□□□□ -1.07
PKP4-208ENST00000462335 IL17RDQ8NFM7 739 aa8.39□□□□□ -1.07
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PKP4-208ENST00000462335 TMEM171Q8WVE6 324 aa8.39□□□□□ -1.07
PKP4-208ENST00000462335 CANT1Q8WVQ1 401 aa8.39□□□□□ -1.07
PKP4-208ENST00000462335 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP8.39□□□□□ -1.07
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PKP4-208ENST00000462335 TMEM54Q969K7 222 aa8.39□□□□□ -1.07
PKP4-208ENST00000462335 MCHR2Q969V1 340 aa8.39□□□□□ -1.07
PKP4-208ENST00000462335 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
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PKP4-208ENST00000462335 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
PKP4-208ENST00000462335 CCL19Q99731 98 aa8.39□□□□□ -1.07
PKP4-208ENST00000462335 FOXB1Q99853 325 aa8.39□□□□□ -1.07
PKP4-208ENST00000462335 ALG12Q9BV10 488 aa8.39□□□□□ -1.07
PKP4-208ENST00000462335 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
PKP4-208ENST00000462335 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa8.39□□□□□ -1.07
PKP4-208ENST00000462335 KIF17Q9P2E2 1029 aa8.39□□□□□ -1.07
PKP4-208ENST00000462335 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa8.39□□□□□ -1.07
PKP4-208ENST00000462335 FBXL3Q9UKT7 428 aa8.39□□□□□ -1.07
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