RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436404.6

CNGA3-205, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNGA3, Length 2,504 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-205ENST00000436404 PTAFRP25105 342 aa15.35■□□□□ 0.05
CNGA3-205ENST00000436404 RAB28P51157 221 aa15.35■□□□□ 0.05
CNGA3-205ENST00000436404 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
CNGA3-205ENST00000436404 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
CNGA3-205ENST00000436404 ELOCQ15369 112 aa15.35■□□□□ 0.05
CNGA3-205ENST00000436404 NXPE4Q6UWF7 544 aa15.35■□□□□ 0.05
CNGA3-205ENST00000436404 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa15.35■□□□□ 0.05
CNGA3-205ENST00000436404 STK35Q8TDR2 534 aa15.35■□□□□ 0.05
CNGA3-205ENST00000436404 C15orf40Q8WUR7 153 aa15.35■□□□□ 0.05
CNGA3-205ENST00000436404 ARHGDIGQ99819 225 aa15.35■□□□□ 0.05
CNGA3-205ENST00000436404 TLNRD1Q9H1K6 362 aa15.35■□□□□ 0.05
CNGA3-205ENST00000436404 FSCN3Q9NQT6 498 aa15.35■□□□□ 0.05
CNGA3-205ENST00000436404 SLC13A4Q9UKG4 626 aa15.35■□□□□ 0.05
CNGA3-205ENST00000436404 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa15.35■□□□□ 0.05
CNGA3-205ENST00000436404 BCL2L11O43521 198 aa15.34■□□□□ 0.05
CNGA3-205ENST00000436404 OR2F2O95006 317 aa15.34■□□□□ 0.05
CNGA3-205ENST00000436404 RAB40ALP0C0E4 278 aa15.34■□□□□ 0.05
CNGA3-205ENST00000436404 PTHLHP12272 177 aa15.34■□□□□ 0.05
CNGA3-205ENST00000436404 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
CNGA3-205ENST00000436404 NPBWR1P48145 328 aa15.34■□□□□ 0.05
CNGA3-205ENST00000436404 HCCSP53701 268 aa15.34■□□□□ 0.05
CNGA3-205ENST00000436404 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP15.34■□□□□ 0.05
CNGA3-205ENST00000436404 OR2F1Q13607 317 aa15.34■□□□□ 0.05
CNGA3-205ENST00000436404 ZNF345Q14585 488 aa15.34■□□□□ 0.05
CNGA3-205ENST00000436404 SMCO1Q147U7 214 aa15.34■□□□□ 0.05
CNGA3-205ENST00000436404 ZNF740Q8NDX6 193 aa15.34■□□□□ 0.05
CNGA3-205ENST00000436404 RAB40AQ8WXH6 277 aa15.34■□□□□ 0.05
CNGA3-205ENST00000436404 SGK3Q96BR1 496 aa15.34■□□□□ 0.05
CNGA3-205ENST00000436404 ZNF75AQ96N20 296 aa15.34■□□□□ 0.05
CNGA3-205ENST00000436404 TWSG1Q9GZX9 223 aa15.34■□□□□ 0.05
CNGA3-205ENST00000436404 MOKQ9UQ07 419 aa15.34■□□□□ 0.05
CNGA3-205ENST00000436404 SLC22A7Q9Y694 548 aa15.34■□□□□ 0.05
CNGA3-205ENST00000436404 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa15.34■□□□□ 0.05
CNGA3-205ENST00000436404 IFITM5A6NNB3 132 aa15.34■□□□□ 0.05
CNGA3-205ENST00000436404 CDC42EP2O14613 210 aa15.34■□□□□ 0.05
CNGA3-205ENST00000436404 IMPA2O14732 288 aa15.34■□□□□ 0.05
CNGA3-205ENST00000436404 TO15178 435 aa15.34■□□□□ 0.05
CNGA3-205ENST00000436404 ZGLP1P0C6A0 271 aa15.34■□□□□ 0.05
CNGA3-205ENST00000436404 PSMB5P28074 263 aa15.34■□□□□ 0.05
CNGA3-205ENST00000436404 KHKP50053 298 aa15.34■□□□□ 0.05
CNGA3-205ENST00000436404 SLC16A1P53985 500 aa15.34■□□□□ 0.05
CNGA3-205ENST00000436404 FUT5Q11128 374 aa15.34■□□□□ 0.05
CNGA3-205ENST00000436404 NDUFAF6Q330K2 333 aa15.34■□□□□ 0.05
CNGA3-205ENST00000436404 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
CNGA3-205ENST00000436404 OR2L8Q8NGY9 312 aa15.34■□□□□ 0.05
CNGA3-205ENST00000436404 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa15.34■□□□□ 0.05
CNGA3-205ENST00000436404 UBE2E3Q969T4 207 aa15.34■□□□□ 0.05
CNGA3-205ENST00000436404 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
CNGA3-205ENST00000436404 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
CNGA3-205ENST00000436404 RNF122Q9H9V4 155 aa15.34■□□□□ 0.05
CNGA3-205ENST00000436404 ASF1BQ9NVP2 202 aa15.34■□□□□ 0.05
CNGA3-205ENST00000436404 ANKRD10Q9NXR5 420 aa15.34■□□□□ 0.05
CNGA3-205ENST00000436404 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
CNGA3-205ENST00000436404 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa15.33■□□□□ 0.05
CNGA3-205ENST00000436404 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa15.33■□□□□ 0.04
CNGA3-205ENST00000436404 A0A0G2JNG1 304 aa15.33■□□□□ 0.04
CNGA3-205ENST00000436404 KIR2DS3K7RE56 304 aa15.33■□□□□ 0.04
CNGA3-205ENST00000436404 PLPP1O14494 284 aa15.33■□□□□ 0.04
CNGA3-205ENST00000436404 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP15.33■□□□□ 0.04
CNGA3-205ENST00000436404 PRF1P14222 555 aa15.33■□□□□ 0.04
CNGA3-205ENST00000436404 NDUFS1P28331 727 aa15.33■□□□□ 0.04
CNGA3-205ENST00000436404 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP15.33■□□□□ 0.04
CNGA3-205ENST00000436404 HSD17B2P37059 387 aa15.33■□□□□ 0.04
CNGA3-205ENST00000436404 GPR18Q14330 331 aa15.33■□□□□ 0.04
CNGA3-205ENST00000436404 KIR2DS5Q14953 304 aa15.33■□□□□ 0.04
CNGA3-205ENST00000436404 Q3ZCU0 254 aa15.33■□□□□ 0.04
CNGA3-205ENST00000436404 KRT77Q7Z794 578 aa15.33■□□□□ 0.04
CNGA3-205ENST00000436404 SYNPRQ8TBG9 265 aa15.33■□□□□ 0.04
CNGA3-205ENST00000436404 SMPDL3BQ92485 455 aa15.33■□□□□ 0.04
CNGA3-205ENST00000436404 SMIM19Q96E16 107 aa15.33■□□□□ 0.04
CNGA3-205ENST00000436404 OR14A2Q96R54 314 aa15.33■□□□□ 0.04
CNGA3-205ENST00000436404 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP15.33■□□□□ 0.04
CNGA3-205ENST00000436404 ADGRL4Q9HBW9 690 aa15.33■□□□□ 0.04
CNGA3-205ENST00000436404 SUSD2Q9UGT4 822 aa15.33■□□□□ 0.04
CNGA3-205ENST00000436404 FRYLO94915 3013 aa15.33■□□□□ 0.04
CNGA3-205ENST00000436404 B4DGG1 531 aa15.33■□□□□ 0.04
CNGA3-205ENST00000436404 TMEM127O75204 238 aa15.33■□□□□ 0.04
CNGA3-205ENST00000436404 GIMD1P0DJR0 217 aa15.33■□□□□ 0.04
CNGA3-205ENST00000436404 ABOP16442 354 aa15.33■□□□□ 0.04
CNGA3-205ENST00000436404 SRMP19623 302 aa15.33■□□□□ 0.04
CNGA3-205ENST00000436404 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP15.33■□□□□ 0.04
CNGA3-205ENST00000436404 LCTLQ6UWM7 567 aa15.33■□□□□ 0.04
CNGA3-205ENST00000436404 GKN2Q86XP6 184 aa15.33■□□□□ 0.04
CNGA3-205ENST00000436404 MISPQ8IVT2 679 aa15.33■□□□□ 0.04
CNGA3-205ENST00000436404 SLC25A45Q8N413 288 aa15.33■□□□□ 0.04
CNGA3-205ENST00000436404 PEX11GQ96HA9 241 aa15.33■□□□□ 0.04
CNGA3-205ENST00000436404 OR52D1Q9H346 318 aa15.33■□□□□ 0.04
CNGA3-205ENST00000436404 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP15.33■□□□□ 0.04
CNGA3-205ENST00000436404 POT1Q9NUX5 634 aa15.33■□□□□ 0.04
CNGA3-205ENST00000436404 PATE3B3GLJ2 98 aa15.32■□□□□ 0.04
CNGA3-205ENST00000436404 ZNF879B4DU55 563 aa15.32■□□□□ 0.04
CNGA3-205ENST00000436404 LMO7DNF2Z398 122 aa15.32■□□□□ 0.04
CNGA3-205ENST00000436404 FBP1P09467 338 aa15.32■□□□□ 0.04
CNGA3-205ENST00000436404 CBR1P16152 277 aa15.32■□□□□ 0.04
CNGA3-205ENST00000436404 ADH7P40394 386 aa15.32■□□□□ 0.04
CNGA3-205ENST00000436404 MLC1Q15049 377 aa15.32■□□□□ 0.04
CNGA3-205ENST00000436404 RNF212Q495C1 297 aa15.32■□□□□ 0.04
CNGA3-205ENST00000436404 RAB12Q6IQ22 244 aa15.32■□□□□ 0.04
CNGA3-205ENST00000436404 TMEM71Q6P5X7 295 aa15.32■□□□□ 0.04
CNGA3-205ENST00000436404 DNM1P46Q6ZS02 220 aa15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms