RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-201ENST00000404162 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 OR2T1O43869 369 aa16.31■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 GPANK1O95872 356 aa16.31■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 KNG1P01042 644 aa16.31■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 OR8G3PP0DMU2 310 aa16.31■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 FAM69AQ5T7M9 428 aa16.31■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 C16orf87Q6PH81 154 aa16.31■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF621Q6ZSS3 439 aa16.31■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 SLC30A7Q8NEW0 376 aa16.31■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP16.31■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 OR6N1Q8NGY5 312 aa16.31■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 WFDC12Q8WWY7 111 aa16.31■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 C11orf40Q8WZ69 217 aa16.31■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 ELMOD3Q96FG2 381 aa16.31■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP16.31■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 WNK1Q9H4A3 2382 aa16.3■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 UBOX5O94941 541 aa16.3■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF12P17014 697 aa16.3■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 S100A3P33764 101 aa16.3■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP16.3■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 RHOUQ7L0Q8 258 aa16.3■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 MIER2Q8N344 545 aa16.3■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 ICA1LQ8NDH6 482 aa16.3■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 PANX1Q96RD7 426 aa16.3■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 SPATA9Q9BWV2 254 aa16.3■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 INSIG2Q9Y5U4 225 aa16.3■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa16.29■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa16.29■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 SPRY3O43610 288 aa16.29■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 IGHV1-46P01743 117 aa16.29■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 SERPINB5P36952 375 aa16.29■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 RBMXP38159 391 aaKnown RBP16.29■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF81P51508 661 aa16.29■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP16.29■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 C6orf89Q6UWU4 347 aa16.29■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 C17orf107Q6ZR85 190 aa16.29■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP16.29■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP16.29■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 TRIML2Q8N7C3 387 aa16.29■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa16.29■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 SLC38A4Q969I6 547 aa16.29■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP16.29■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 APOPT1Q96IL0 206 aa16.29■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 TEX37Q96LM6 180 aa16.29■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 CITED1Q99966 193 aa16.29■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 CDH20Q9HBT6 801 aa16.29■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 P2RX2Q9UBL9 471 aa16.29■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP16.29■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 A0A087WUJ7 227 aa16.28■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa16.28■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF726A6NNF4 738 aa16.28■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 E9PBE3 544 aa16.28■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 M0QZ24 198 aa16.28■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 ALX3O95076 343 aa16.28■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 IGHV3-13P01766 116 aa16.28■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 IGHMP01871 453 aa16.28■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 BCHEP06276 602 aa16.28■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa16.28■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 NQO1P15559 274 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 UCP2P55851 309 aa16.28■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 KRTAP10-3P60369 221 aa16.28■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 FBLN7Q53RD9 439 aa16.28■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM255AQ5JRV8 349 aa16.28■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 WDR88Q6ZMY6 472 aa16.28■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 SNX32Q86XE0 403 aa16.28■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 SLC22A24Q8N4F4 322 aa16.28■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 SLC41A3Q96GZ6 507 aa16.28■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 SH3GL3Q99963 347 aa16.28■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 NPHS2Q9NP85 383 aa16.28■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 MKS1Q9NXB0 559 aa16.28■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 DCAF16Q9NXF7 216 aa16.28■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 KLHL14Q9P2G3 628 aa16.28■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF232Q9UNY5 417 aa16.28■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP16.28■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 TANC2Q9HCD6 1990 aa16.27■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 RYR3Q15413 4870 aa16.27■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa16.27■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 TM9SF1O15321 606 aa16.27■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 MT-ND5P03915 603 aa16.27■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 ETFAP13804 333 aa16.27■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 DRD4P21917 467 aa16.27■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 MTNR1AP48039 350 aa16.27■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 MVDP53602 400 aa16.27■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 NME5P56597 212 aa16.27■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 MOGQ16653 247 aa16.27■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 DPY19L1Q2PZI1 675 aa16.27■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 SPRNQ5BIV9 151 aa16.27■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 FAM209AQ5JX71 171 aa16.27■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 BRICD5Q6PL45 260 aa16.27■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 IFT20Q8IY31 132 aa16.27■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 SLC38A5Q8WUX1 472 aa16.27■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 ZIM3Q96PE6 472 aa16.27■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 MRI1Q9BV20 369 aa16.27■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 BEX1Q9HBH7 125 aa16.27■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 TCF7L2Q9NQB0 619 aa16.27■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 CALML5Q9NZT1 146 aa16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 77.3 ms