RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398741.5

PRAME-201, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS P2 TSL 5 BASIC

Gene PRAME, Length 2,202 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-201ENST00000398741 IL33O95760 270 aa11.9□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 CLPSP04118 112 aa11.9□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 GIPP09681 153 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 EGR4Q05215 589 aa11.9□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 EGR3Q06889 387 aa11.9□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa11.9□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 CBFBQ13951 182 aa11.9□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 KIAA0895LQ68EN5 471 aa11.9□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 DPY19L4Q7Z388 723 aa11.9□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 GLB1L2Q8IW92 636 aa11.9□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 OR2G2Q8NGZ5 317 aa11.9□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 INTS14Q96SY0 518 aa11.9□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 DHRS9Q9BPW9 319 aa11.9□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 FKRPQ9H9S5 495 aa11.9□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 SOHLH2Q9NX45 425 aa11.9□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 STEAP1Q9UHE8 339 aa11.9□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 CYP8B1Q9UNU6 501 aa11.9□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa11.9□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 GMFGO60234 142 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 RBBP9O75884 186 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 NDUFB6O95139 128 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 AKR7A3O95154 331 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 IL5P05113 134 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 TACR3P29371 465 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 RPS27P42677 84 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 OPCMLQ14982 345 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 PCGF3Q3KNV8 242 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 ZNF626Q68DY1 528 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 S1PR5Q9H228 398 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 CA10Q9NS85 328 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 UBE2QL1A1L167 161 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 OR4C45A6NMZ5 311 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 A8MUA0 341 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 SNRPGP15A8MWD9 76 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 PHYHO14832 338 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 TPPPO94811 219 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 CFDP00746 253 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 ALOX5APP20292 161 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 GALNSP34059 522 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 SCAND1P57086 179 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 RAP2BP61225 183 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 CCINQ13939 588 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 HDDC2Q7Z4H3 204 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 UXS1Q8NBZ7 420 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 OIT3Q8WWZ8 545 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 ELMOD3Q96FG2 381 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 SYT4Q9H2B2 425 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 NARFLQ9H6Q4 476 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 GMEB2Q9UKD1 530 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 MMP17Q9ULZ9 603 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 PLCL2Q9UPR0 1127 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 F5P12259 2224 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 L7N2F9 121 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 XKRYO14609 159 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 XRCC3O43542 346 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 HLA-DQA2P01906 255 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 PROS1P07225 676 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 M6PRP20645 277 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 ENPP1P22413 925 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 MST1P26927 711 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 PPICP45877 212 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 CAPZBP47756 277 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 CCR5P51681 352 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 POMZP3Q6PJE2 187 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 SIX5Q8N196 739 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 ZNF321PQ8N8H1 164 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 OR10AC1Q8NH08 325 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 TAAR8Q969N4 342 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 OMA1Q96E52 524 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 LRRC61Q9BV99 259 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 GSX2Q9BZM3 304 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 ULBP3Q9BZM4 244 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 OR8D2Q9GZM6 311 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 CD207Q9UJ71 328 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 NUP50Q9UKX7 468 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 LRP4O75096 1905 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 HSPB2A8KAH6 182 aa11.87□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 SNAPC5O75971 98 aa11.87□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 GPANK1O95872 356 aa11.87□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 CSF1P09603 554 aa11.87□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 CXCR1P25024 350 aa11.87□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 RORAP35398 523 aa11.87□□□□□ -0.51
PRAME-201ENST00000398741 CENPAP49450 140 aa11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms