RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393150.7

CASP4-201, Transcript of caspase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CASP4, Length 1,340 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4-201ENST00000393150 TMEM237Q96Q45 408 aa6.7□□□□□ -1.34
CASP4-201ENST00000393150 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
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CASP4-201ENST00000393150 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CASP4-201ENST00000393150 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa6.7□□□□□ -1.34
CASP4-201ENST00000393150 OR11A1Q9GZK7 315 aa6.7□□□□□ -1.34
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CASP4-201ENST00000393150 OR10A2Q9H208 303 aa6.7□□□□□ -1.34
CASP4-201ENST00000393150 LRMDAQ9H2I8 198 aa6.7□□□□□ -1.34
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CASP4-201ENST00000393150 TMED5Q9Y3A6 229 aa6.7□□□□□ -1.34
CASP4-201ENST00000393150 TMED7Q9Y3B3 224 aa6.7□□□□□ -1.34
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CASP4-201ENST00000393150 SEC14L2O76054 403 aa6.69□□□□□ -1.34
CASP4-201ENST00000393150 URI1O94763 535 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
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CASP4-201ENST00000393150 CSF1P09603 554 aa6.69□□□□□ -1.34
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CASP4-201ENST00000393150 BCKDHAP12694 445 aa6.69□□□□□ -1.34
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CASP4-201ENST00000393150 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
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CASP4-201ENST00000393150 UNC50Q53HI1 259 aa6.69□□□□□ -1.34
CASP4-201ENST00000393150 C19orf54Q5BKX5 351 aa6.69□□□□□ -1.34
CASP4-201ENST00000393150 TTMPQ5BVD1 217 aa6.69□□□□□ -1.34
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CASP4-201ENST00000393150 MDP1Q86V88 176 aa6.69□□□□□ -1.34
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CASP4-201ENST00000393150 CNPY4Q8N129 248 aa6.69□□□□□ -1.34
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CASP4-201ENST00000393150 MRAPQ8TCY5 172 aa6.69□□□□□ -1.34
CASP4-201ENST00000393150 CFHR4Q92496 578 aa6.69□□□□□ -1.34
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CASP4-201ENST00000393150 YIPF5Q969M3 257 aa6.69□□□□□ -1.34
CASP4-201ENST00000393150 TSSK3Q96PN8 268 aa6.69□□□□□ -1.34
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CASP4-201ENST00000393150 CITED1Q99966 193 aa6.69□□□□□ -1.34
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CASP4-201ENST00000393150 POLE3Q9NRF9 147 aa6.69□□□□□ -1.34
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CASP4-201ENST00000393150 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa6.69□□□□□ -1.34
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CASP4-201ENST00000393150 SLC7A8Q9UHI5 535 aa6.69□□□□□ -1.34
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CASP4-201ENST00000393150 ZNF225Q9UK10 706 aa6.69□□□□□ -1.34
CASP4-201ENST00000393150 POFUT2Q9Y2G5 429 aa6.69□□□□□ -1.34
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CASP4-201ENST00000393150 NGFP01138 241 aa6.68□□□□□ -1.34
CASP4-201ENST00000393150 PTHP01270 115 aa6.68□□□□□ -1.34
CASP4-201ENST00000393150 CHRM4P08173 479 aa6.68□□□□□ -1.34
CASP4-201ENST00000393150 UROSP10746 265 aa6.68□□□□□ -1.34
CASP4-201ENST00000393150 SOAT1P35610 550 aa6.68□□□□□ -1.34
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CASP4-201ENST00000393150 SELENOPP49908 381 aa6.68□□□□□ -1.34
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CASP4-201ENST00000393150 FAM189A2Q15884 450 aa6.68□□□□□ -1.34
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CASP4-201ENST00000393150 RNF151Q2KHN1 245 aa6.68□□□□□ -1.34
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CASP4-201ENST00000393150 SFXN5Q8TD22 340 aa6.68□□□□□ -1.34
CASP4-201ENST00000393150 SLC47A1Q96FL8 570 aa6.68□□□□□ -1.34
CASP4-201ENST00000393150 EGLN2Q96KS0 407 aa6.68□□□□□ -1.34
CASP4-201ENST00000393150 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CASP4-201ENST00000393150 OR7D2Q96RA2 312 aa6.68□□□□□ -1.34
CASP4-201ENST00000393150 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CASP4-201ENST00000393150 ING3Q9NXR8 418 aa6.68□□□□□ -1.34
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