RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384354.1

RNU6-171P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 171, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-171P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-171P-201ENST00000384354 MFSD8Q8NHS3 518 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 LINC01006Q8NI28 216 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 SYNPRQ8TBG9 265 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 ACMSDQ8TDX5 336 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 UBE2FQ969M7 185 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 VPS33AQ96AX1 596 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 MOAP1Q96BY2 351 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 ITPKCQ96DU7 683 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 PPP3R2Q96LZ3 170 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 OXGR1Q96P68 337 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 FOXB1Q99853 325 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 TOR3AQ9H497 397 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 PIF1Q9H611 641 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 MSL2Q9HCI7 577 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 POLE3Q9NRF9 147 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 KLHL14Q9P2G3 628 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 SLC7A8Q9UHI5 535 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 TRIM33Q9UPN9 1127 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 NOX1Q9Y5S8 564 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 DNAH1Q9P2D7 4330 aa4.53□□□□□ -1.69
RNU6-171P-201ENST00000384354 PPIAL4EA0A075B759 164 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-171P-201ENST00000384354 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-171P-201ENST00000384354 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-171P-201ENST00000384354 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-171P-201ENST00000384354 CLPSL1A2RUU4 121 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-171P-201ENST00000384354 MEGF11A6BM72 1044 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-171P-201ENST00000384354 DUXAA6NLW8 204 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-171P-201ENST00000384354 CEACAM18A8MTB9 384 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-171P-201ENST00000384354 A8MXK9 166 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-171P-201ENST00000384354 SRRM5B3KS81 715 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-171P-201ENST00000384354 PPIAL4DF5H284 164 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-171P-201ENST00000384354 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
RNU6-171P-201ENST00000384354 MGRN1O60291 552 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-171P-201ENST00000384354 TPST2O60704 377 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-171P-201ENST00000384354 FCN3O75636 299 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-171P-201ENST00000384354 VAMP5O95183 116 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-171P-201ENST00000384354 RAB36O95755 333 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-171P-201ENST00000384354 NGFP01138 241 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-171P-201ENST00000384354 IGHV4-59P01825 116 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-171P-201ENST00000384354 BGLAPP02818 100 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-171P-201ENST00000384354 SERPINA5P05154 406 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-171P-201ENST00000384354 BCHEP06276 602 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-171P-201ENST00000384354 SFTPBP07988 381 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-171P-201ENST00000384354 GUSBP08236 651 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-171P-201ENST00000384354 MELTFP08582 738 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-171P-201ENST00000384354 FGF4P08620 206 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-171P-201ENST00000384354 ABHD2P08910 425 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-171P-201ENST00000384354 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
RNU6-171P-201ENST00000384354 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
RNU6-171P-201ENST00000384354 SBK2P0C263 348 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-171P-201ENST00000384354 PPIAL4FP0DN26 164 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-171P-201ENST00000384354 ETFAP13804 333 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-171P-201ENST00000384354 ANPEPP15144 967 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-171P-201ENST00000384354 IL7RP16871 459 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-171P-201ENST00000384354 GATA3P23771 443 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-171P-201ENST00000384354 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZNF81P51508 661 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-171P-201ENST00000384354 DLX1P56177 255 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-171P-201ENST00000384354 HPCAP84074 193 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-171P-201ENST00000384354 GALK2Q01415 458 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-171P-201ENST00000384354 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
RNU6-171P-201ENST00000384354 RBBP4Q09028 425 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-171P-201ENST00000384354 C1DQ13901 141 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
RNU6-171P-201ENST00000384354 FAM189A2Q15884 450 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-171P-201ENST00000384354 HFEQ30201 348 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-171P-201ENST00000384354 OXLD1Q5BKU9 147 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-171P-201ENST00000384354 THEM4Q5T1C6 240 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-171P-201ENST00000384354 ATAD3BQ5T9A4 648 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-171P-201ENST00000384354 LRFN4Q6PJG9 635 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-171P-201ENST00000384354 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-171P-201ENST00000384354 Q6ZR03 302 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-171P-201ENST00000384354 Q6ZSV7 163 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-171P-201ENST00000384354 C9orf139Q6ZV77 190 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-171P-201ENST00000384354 LCA5Q86VQ0 697 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-171P-201ENST00000384354 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
RNU6-171P-201ENST00000384354 CMIPQ8IY22 773 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-171P-201ENST00000384354 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
RNU6-171P-201ENST00000384354 SLC22A24Q8N4F4 322 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-171P-201ENST00000384354 PIK3C3Q8NEB9 887 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-171P-201ENST00000384354 ANKK1Q8NFD2 765 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-171P-201ENST00000384354 IL17RDQ8NFM7 739 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-171P-201ENST00000384354 OR8J2Q8NGG1 315 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-171P-201ENST00000384354 OR52E2Q8NGJ4 325 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-171P-201ENST00000384354 OR10S1Q8NGN2 331 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-171P-201ENST00000384354 OR52P1PQ8NH57 321 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-171P-201ENST00000384354 UPRTQ96BW1 309 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-171P-201ENST00000384354 TUBGCP3Q96CW5 907 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-171P-201ENST00000384354 CCDC126Q96EE4 140 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-171P-201ENST00000384354 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
RNU6-171P-201ENST00000384354 SLC41A3Q96GZ6 507 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-171P-201ENST00000384354 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
RNU6-171P-201ENST00000384354 ARHGDIGQ99819 225 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-171P-201ENST00000384354 CDADC1Q9BWV3 514 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-171P-201ENST00000384354 ULBP2Q9BZM5 246 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-171P-201ENST00000384354 C20orf27Q9GZN8 174 aa4.52□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms