RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368547.3

ECHS1-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase, short chain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHS1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1-201ENST00000368547 GPR171O14626 319 aa26.25■■□□□ 1.79
ECHS1-201ENST00000368547 SLC35A2P78381 396 aa26.25■■□□□ 1.79
ECHS1-201ENST00000368547 FOXF2Q12947 444 aa26.25■■□□□ 1.79
ECHS1-201ENST00000368547 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
ECHS1-201ENST00000368547 TCEANCQ8N8B7 351 aa26.25■■□□□ 1.79
ECHS1-201ENST00000368547 TMEM163Q8TC26 289 aa26.25■■□□□ 1.79
ECHS1-201ENST00000368547 MED29Q9NX70 200 aa26.25■■□□□ 1.79
ECHS1-201ENST00000368547 RELNP78509 3460 aa26.25■■□□□ 1.79
ECHS1-201ENST00000368547 A0A1W2PRG6 482 aa26.25■■□□□ 1.79
ECHS1-201ENST00000368547 SURF4O15260 269 aa26.25■■□□□ 1.79
ECHS1-201ENST00000368547 XPNPEP2O43895 674 aa26.25■■□□□ 1.79
ECHS1-201ENST00000368547 PRKYO43930 277 aa26.25■■□□□ 1.79
ECHS1-201ENST00000368547 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
ECHS1-201ENST00000368547 IFNGR1P15260 489 aa26.25■■□□□ 1.79
ECHS1-201ENST00000368547 AGTR1P30556 359 aa26.25■■□□□ 1.79
ECHS1-201ENST00000368547 GUSBP1Q15486 140 aa26.25■■□□□ 1.79
ECHS1-201ENST00000368547 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa26.25■■□□□ 1.79
ECHS1-201ENST00000368547 SLC35D2Q76EJ3 337 aa26.25■■□□□ 1.79
ECHS1-201ENST00000368547 TXNDC15Q96J42 360 aa26.25■■□□□ 1.79
ECHS1-201ENST00000368547 ZFP3Q96NJ6 502 aa26.25■■□□□ 1.79
ECHS1-201ENST00000368547 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
ECHS1-201ENST00000368547 IFT27Q9BW83 186 aa26.25■■□□□ 1.79
ECHS1-201ENST00000368547 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa26.25■■□□□ 1.79
ECHS1-201ENST00000368547 A0A1B0GUH1 482 aa26.24■■□□□ 1.79
ECHS1-201ENST00000368547 M0R129 80 aa26.24■■□□□ 1.79
ECHS1-201ENST00000368547 LRRTM2O43300 516 aa26.24■■□□□ 1.79
ECHS1-201ENST00000368547 FAM20BO75063 409 aa26.24■■□□□ 1.79
ECHS1-201ENST00000368547 CD14P08571 375 aa26.24■■□□□ 1.79
ECHS1-201ENST00000368547 ATP6V1B1P15313 513 aa26.24■■□□□ 1.79
ECHS1-201ENST00000368547 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
ECHS1-201ENST00000368547 CDH15P55291 814 aa26.24■■□□□ 1.79
ECHS1-201ENST00000368547 CLDN17P56750 224 aa26.24■■□□□ 1.79
ECHS1-201ENST00000368547 ERVK-25P63136 954 aa26.24■■□□□ 1.79
ECHS1-201ENST00000368547 ACKR1Q16570 336 aa26.24■■□□□ 1.79
ECHS1-201ENST00000368547 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa26.24■■□□□ 1.79
ECHS1-201ENST00000368547 FAM214BQ7L5A3 538 aa26.24■■□□□ 1.79
ECHS1-201ENST00000368547 IL4I1Q96RQ9 567 aa26.24■■□□□ 1.79
ECHS1-201ENST00000368547 NRIP3Q9NQ35 241 aa26.24■■□□□ 1.79
ECHS1-201ENST00000368547 A0A0G2JNJ9 132 aa26.23■■□□□ 1.79
ECHS1-201ENST00000368547 NTF4P34130 210 aa26.23■■□□□ 1.79
ECHS1-201ENST00000368547 RPL5P46777 297 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
ECHS1-201ENST00000368547 NR1H2P55055 460 aa26.23■■□□□ 1.79
ECHS1-201ENST00000368547 SIRPAP78324 504 aa26.23■■□□□ 1.79
ECHS1-201ENST00000368547 MELKQ14680 651 aa26.23■■□□□ 1.79
ECHS1-201ENST00000368547 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa26.23■■□□□ 1.79
ECHS1-201ENST00000368547 TXNIPQ9H3M7 391 aa26.23■■□□□ 1.79
ECHS1-201ENST00000368547 Q9UFV3 132 aa26.23■■□□□ 1.79
ECHS1-201ENST00000368547 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa26.23■■□□□ 1.79
ECHS1-201ENST00000368547 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
ECHS1-201ENST00000368547 MYO7BQ6PIF6 2116 aa26.23■■□□□ 1.79
ECHS1-201ENST00000368547 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
ECHS1-201ENST00000368547 PPP1R3DO95685 299 aa26.22■■□□□ 1.79
ECHS1-201ENST00000368547 TFAP2AP05549 437 aa26.22■■□□□ 1.79
ECHS1-201ENST00000368547 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
ECHS1-201ENST00000368547 RND1Q92730 232 aa26.22■■□□□ 1.79
ECHS1-201ENST00000368547 PLEKHA8Q96JA3 519 aa26.22■■□□□ 1.79
ECHS1-201ENST00000368547 EMC6Q9BV81 110 aa26.22■■□□□ 1.79
ECHS1-201ENST00000368547 FN3KQ9H479 309 aa26.22■■□□□ 1.79
ECHS1-201ENST00000368547 FKBP14Q9NWM8 211 aa26.22■■□□□ 1.79
ECHS1-201ENST00000368547 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
ECHS1-201ENST00000368547 EMC9Q9Y3B6 208 aa26.22■■□□□ 1.79
ECHS1-201ENST00000368547 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa26.22■■□□□ 1.79
ECHS1-201ENST00000368547 BCL10O95999 233 aa26.21■■□□□ 1.79
ECHS1-201ENST00000368547 IGHMP01871 453 aa26.21■■□□□ 1.79
ECHS1-201ENST00000368547 CRHP06850 196 aa26.21■■□□□ 1.79
ECHS1-201ENST00000368547 C4orf17Q53FE4 359 aa26.21■■□□□ 1.79
ECHS1-201ENST00000368547 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF540Q8NDQ6 660 aa26.21■■□□□ 1.79
ECHS1-201ENST00000368547 TSPAN32Q96QS1 320 aa26.21■■□□□ 1.79
ECHS1-201ENST00000368547 NPIPB13A6NJU9 1138 aa26.21■■□□□ 1.79
ECHS1-201ENST00000368547 HSPB2A8KAH6 182 aa26.21■■□□□ 1.79
ECHS1-201ENST00000368547 NPIPB4C9JG80 1138 aa26.21■■□□□ 1.79
ECHS1-201ENST00000368547 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa26.21■■□□□ 1.79
ECHS1-201ENST00000368547 TNFSF13O75888 250 aa26.21■■□□□ 1.79
ECHS1-201ENST00000368547 DAP3P51398 398 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
ECHS1-201ENST00000368547 BIDP55957 195 aa26.21■■□□□ 1.79
ECHS1-201ENST00000368547 RPL27P61353 136 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
ECHS1-201ENST00000368547 HSPB2Q16082 182 aa26.21■■□□□ 1.79
ECHS1-201ENST00000368547 FAM122BQ7Z309 247 aa26.21■■□□□ 1.79
ECHS1-201ENST00000368547 WDFY1Q8IWB7 410 aa26.21■■□□□ 1.79
ECHS1-201ENST00000368547 TMEM45BQ96B21 275 aa26.21■■□□□ 1.79
ECHS1-201ENST00000368547 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP26.21■■□□□ 1.79
ECHS1-201ENST00000368547 C12orf49Q9H741 205 aa26.21■■□□□ 1.79
ECHS1-201ENST00000368547 CMC2Q9NRP2 79 aa26.21■■□□□ 1.79
ECHS1-201ENST00000368547 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
ECHS1-201ENST00000368547 GRHPRQ9UBQ7 328 aa26.21■■□□□ 1.79
ECHS1-201ENST00000368547 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.78
ECHS1-201ENST00000368547 SLC35F4A4IF30 521 aa26.2■■□□□ 1.78
ECHS1-201ENST00000368547 PTGES3LE9PB15 166 aa26.2■■□□□ 1.78
ECHS1-201ENST00000368547 ENTPD6O75354 484 aa26.2■■□□□ 1.78
ECHS1-201ENST00000368547 CTSSP25774 331 aa26.2■■□□□ 1.78
ECHS1-201ENST00000368547 VWA1Q6PCB0 445 aa26.2■■□□□ 1.78
ECHS1-201ENST00000368547 AAED1Q7RTV5 226 aa26.2■■□□□ 1.78
ECHS1-201ENST00000368547 ASB10Q8WXI3 467 aa26.2■■□□□ 1.78
ECHS1-201ENST00000368547 LRR1Q96L50 414 aa26.2■■□□□ 1.78
ECHS1-201ENST00000368547 Q96M85 177 aa26.2■■□□□ 1.78
ECHS1-201ENST00000368547 A6NHS1 94 aa26.19■■□□□ 1.78
ECHS1-201ENST00000368547 SNTNA6NMZ2 147 aa26.19■■□□□ 1.78
ECHS1-201ENST00000368547 ARPC3O15145 178 aa26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.3 ms