RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357436.4

SH3BP1-201, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP1, Length 2,852 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-201ENST00000357436 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.31
SH3BP1-201ENST00000357436 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa17.02■□□□□ 0.31
SH3BP1-201ENST00000357436 OIT3Q8WWZ8 545 aa17.02■□□□□ 0.31
SH3BP1-201ENST00000357436 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP17.02■□□□□ 0.31
SH3BP1-201ENST00000357436 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.31
SH3BP1-201ENST00000357436 EMC3Q9P0I2 261 aa17.02■□□□□ 0.31
SH3BP1-201ENST00000357436 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.31
SH3BP1-201ENST00000357436 NUP210LQ5VU65 1888 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP1-201ENST00000357436 TMEM72A0PK05 275 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP1-201ENST00000357436 TXNDC12O95881 172 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP1-201ENST00000357436 TACSTD2P09758 323 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP1-201ENST00000357436 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP1-201ENST00000357436 C7orf57Q8NEG2 295 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP1-201ENST00000357436 SUN5Q8TC36 379 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP1-201ENST00000357436 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
SH3BP1-201ENST00000357436 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
SH3BP1-201ENST00000357436 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
SH3BP1-201ENST00000357436 LIN7BQ9HAP6 207 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP1-201ENST00000357436 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
SH3BP1-201ENST00000357436 CTSFQ9UBX1 484 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP1-201ENST00000357436 GABARAPH6UMI1 98 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP1-201ENST00000357436 ITGA10O75578 1167 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP1-201ENST00000357436 IL33O95760 270 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP1-201ENST00000357436 OR8G3PP0DMU2 310 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP1-201ENST00000357436 CCR9P51686 369 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM69AQ5T7M9 428 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP1-201ENST00000357436 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
SH3BP1-201ENST00000357436 LPAR4Q99677 370 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP1-201ENST00000357436 DPYSL5Q9BPU6 564 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP1-201ENST00000357436 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP1-201ENST00000357436 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
SH3BP1-201ENST00000357436 DCTN6O00399 190 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP1-201ENST00000357436 GMDSO60547 372 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP1-201ENST00000357436 TIAF1O95411 115 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP1-201ENST00000357436 ABHD16AO95870 558 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP1-201ENST00000357436 HPXP02790 462 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP1-201ENST00000357436 HPGDP15428 266 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP1-201ENST00000357436 SDHBP21912 280 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP1-201ENST00000357436 CCR4P51679 360 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC37A1P57057 533 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP1-201ENST00000357436 HSD11B2P80365 405 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP1-201ENST00000357436 STPG1Q5TH74 334 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP1-201ENST00000357436 LIPNQ5VXI9 398 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP1-201ENST00000357436 LANCL3Q6ZV70 420 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP1-201ENST00000357436 OR8H3Q8N146 312 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP1-201ENST00000357436 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC38A9Q8NBW4 561 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP1-201ENST00000357436 OR52I2Q8NH67 350 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP1-201ENST00000357436 RADILQ96JH8 1075 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP1-201ENST00000357436 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
SH3BP1-201ENST00000357436 C20orf85Q9H1P6 137 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP1-201ENST00000357436 HRASLSQ9HDD0 168 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF264O43296 627 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP1-201ENST00000357436 RPP14O95059 124 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
SH3BP1-201ENST00000357436 F13BP05160 661 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP1-201ENST00000357436 DNASE1P24855 282 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP1-201ENST00000357436 PTH2RP49190 550 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP1-201ENST00000357436 ZP1P60852 638 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP1-201ENST00000357436 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
SH3BP1-201ENST00000357436 GRM7Q14831 915 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP1-201ENST00000357436 WDR45BQ5MNZ6 344 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP1-201ENST00000357436 LYSMD4Q5XG99 296 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP1-201ENST00000357436 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP1-201ENST00000357436 STAC2Q6ZMT1 411 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP1-201ENST00000357436 OR11G2Q8NGC1 345 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP1-201ENST00000357436 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
SH3BP1-201ENST00000357436 FGF21Q9NSA1 209 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP1-201ENST00000357436 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
SH3BP1-201ENST00000357436 FRRS1LQ9P0K9 344 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP1-201ENST00000357436 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
SH3BP1-201ENST00000357436 OR5V1Q9UGF6 321 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP1-201ENST00000357436 RCE1Q9Y256 329 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP1-201ENST00000357436 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP1-201ENST00000357436 CACNA1CQ13936 2221 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP1-201ENST00000357436 SCDO00767 359 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP1-201ENST00000357436 PEX14O75381 377 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP1-201ENST00000357436 PPICP45877 212 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP1-201ENST00000357436 CLDN12P56749 244 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP1-201ENST00000357436 Q499Y3 187 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP1-201ENST00000357436 TMEM255AQ5JRV8 349 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
SH3BP1-201ENST00000357436 CDC20BQ86Y33 519 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP1-201ENST00000357436 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
SH3BP1-201ENST00000357436 MRI1Q9BV20 369 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP1-201ENST00000357436 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
SH3BP1-201ENST00000357436 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
SH3BP1-201ENST00000357436 H0YIG0 161 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP1-201ENST00000357436 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
SH3BP1-201ENST00000357436 SULT1B1O43704 296 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP1-201ENST00000357436 SSNA1O43805 119 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP1-201ENST00000357436 DUX1O43812 170 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP1-201ENST00000357436 UTS2O95399 124 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP1-201ENST00000357436 ECDO95905 644 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
SH3BP1-201ENST00000357436 CALCBP10092 127 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP1-201ENST00000357436 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
SH3BP1-201ENST00000357436 BIKQ13323 160 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP1-201ENST00000357436 GPR139Q6DWJ6 353 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM220AQ7Z4H9 259 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP1-201ENST00000357436 SERPINA12Q8IW75 414 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP1-201ENST00000357436 EID2Q8N6I1 236 aa16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.7 ms