RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331222.5

CLN8-201, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLN8, Length 7,169 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-201ENST00000331222 GIPRP48546 466 aa9.76□□□□□ -0.85
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CLN8-201ENST00000331222 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
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CLN8-201ENST00000331222 ABHD11Q8NFV4 315 aa9.75□□□□□ -0.85
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CLN8-201ENST00000331222 EMC7Q9NPA0 242 aa9.75□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 ANKRD61A6NGH8 418 aa9.75□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 CCSO14618 274 aa9.75□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 THBS1P07996 1170 aa9.75□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 IL3RAP26951 378 aa9.75□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 SHC1P29353 583 aa9.75□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 RPS16P62249 146 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
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