RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000327307.11

RRN3-202, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RRN3, Length 2,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3-202ENST00000327307 UFC1Q9Y3C8 167 aa6.27□□□□□ -1.41
RRN3-202ENST00000327307 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
RRN3-202ENST00000327307 ACTL7BQ9Y614 415 aa6.27□□□□□ -1.41
RRN3-202ENST00000327307 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa6.27□□□□□ -1.41
RRN3-202ENST00000327307 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
RRN3-202ENST00000327307 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa6.27□□□□□ -1.41
RRN3-202ENST00000327307 TAF1P21675 1872 aa6.27□□□□□ -1.41
RRN3-202ENST00000327307 A0A0X1KG70 313 aa6.26□□□□□ -1.41
RRN3-202ENST00000327307 A0A1W2PRD5 423 aa6.26□□□□□ -1.41
RRN3-202ENST00000327307 GLTPD2A6NH11 291 aa6.26□□□□□ -1.41
RRN3-202ENST00000327307 I3L4J1 428 aa6.26□□□□□ -1.41
RRN3-202ENST00000327307 I3L521 148 aa6.26□□□□□ -1.41
RRN3-202ENST00000327307 SLC16A5O15375 505 aa6.26□□□□□ -1.41
RRN3-202ENST00000327307 NKX2-8O15522 239 aa6.26□□□□□ -1.41
RRN3-202ENST00000327307 MSI1O43347 362 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
RRN3-202ENST00000327307 TCF21O43680 179 aa6.26□□□□□ -1.41
RRN3-202ENST00000327307 SEMA7AO75326 666 aa6.26□□□□□ -1.41
RRN3-202ENST00000327307 S1PR2O95136 353 aa6.26□□□□□ -1.41
RRN3-202ENST00000327307 MPZL1O95297 269 aa6.26□□□□□ -1.41
RRN3-202ENST00000327307 THY1P04216 161 aa6.26□□□□□ -1.41
RRN3-202ENST00000327307 HIST1H2ABP04908 130 aa6.26□□□□□ -1.41
RRN3-202ENST00000327307 ALDOBP05062 364 aa6.26□□□□□ -1.41
RRN3-202ENST00000327307 SFTPBP07988 381 aa6.26□□□□□ -1.41
RRN3-202ENST00000327307 CST2P09228 141 aa6.26□□□□□ -1.41
RRN3-202ENST00000327307 WNT2P09544 360 aa6.26□□□□□ -1.41
RRN3-202ENST00000327307 DANCRP0C864 163 aa6.26□□□□□ -1.41
RRN3-202ENST00000327307 CELP19835 753 aa6.26□□□□□ -1.41
RRN3-202ENST00000327307 HIST1H2ADP20671 130 aa6.26□□□□□ -1.41
RRN3-202ENST00000327307 OMGP23515 440 aa6.26□□□□□ -1.41
RRN3-202ENST00000327307 CASP1P29466 404 aa6.26□□□□□ -1.41
RRN3-202ENST00000327307 RABGGTBP53611 331 aa6.26□□□□□ -1.41
RRN3-202ENST00000327307 CDKN2DP55273 166 aa6.26□□□□□ -1.41
RRN3-202ENST00000327307 TAS2R50P59544 299 aa6.26□□□□□ -1.41
RRN3-202ENST00000327307 MVKQ03426 396 aa6.26□□□□□ -1.41
RRN3-202ENST00000327307 TSNQ15631 228 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
RRN3-202ENST00000327307 TAB1Q15750 504 aa6.26□□□□□ -1.41
RRN3-202ENST00000327307 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
RRN3-202ENST00000327307 HLA-BQ31612 363 aa6.26□□□□□ -1.41
RRN3-202ENST00000327307 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa6.26□□□□□ -1.41
RRN3-202ENST00000327307 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa6.26□□□□□ -1.41
RRN3-202ENST00000327307 REP15Q6BDI9 236 aa6.26□□□□□ -1.41
RRN3-202ENST00000327307 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa6.26□□□□□ -1.41
RRN3-202ENST00000327307 DLK2Q6UY11 383 aa6.26□□□□□ -1.41
RRN3-202ENST00000327307 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP6.26□□□□□ -1.418e-9■■■■■ 28.6
RRN3-202ENST00000327307 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa6.26□□□□□ -1.41
RRN3-202ENST00000327307 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
RRN3-202ENST00000327307 UEVLDQ8IX04 471 aa6.26□□□□□ -1.41
RRN3-202ENST00000327307 DAW1Q8N136 415 aa6.26□□□□□ -1.41
RRN3-202ENST00000327307 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
RRN3-202ENST00000327307 ZNF611Q8N823 705 aa6.26□□□□□ -1.41
RRN3-202ENST00000327307 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
RRN3-202ENST00000327307 SLC26A10Q8NG04 563 aa6.26□□□□□ -1.41
RRN3-202ENST00000327307 OR4D5Q8NGN0 318 aa6.26□□□□□ -1.41
RRN3-202ENST00000327307 OR2Y1Q8NGV0 311 aa6.26□□□□□ -1.41
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RRN3-202ENST00000327307 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
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RRN3-202ENST00000327307 RLIMQ9NVW2 624 aa6.26□□□□□ -1.41
RRN3-202ENST00000327307 RASL12Q9NYN1 266 aa6.26□□□□□ -1.41
RRN3-202ENST00000327307 TAS2R13Q9NYV9 303 aa6.26□□□□□ -1.41
RRN3-202ENST00000327307 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
RRN3-202ENST00000327307 SLC25A13Q9UJS0 675 aa6.26□□□□□ -1.41
RRN3-202ENST00000327307 SSR3Q9UNL2 185 aa6.26□□□□□ -1.41
RRN3-202ENST00000327307 ZMYM6O95789 1325 aa6.26□□□□□ -1.41
RRN3-202ENST00000327307 CARMIL3Q8ND23 1372 aa6.26□□□□□ -1.41
RRN3-202ENST00000327307 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa6.26□□□□□ -1.41
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RRN3-202ENST00000327307 TSPAN19P0C672 248 aa6.26□□□□□ -1.41
RRN3-202ENST00000327307 FOLR1P15328 257 aa6.26□□□□□ -1.41
RRN3-202ENST00000327307 EPHA3P29320 983 aa6.26□□□□□ -1.41
RRN3-202ENST00000327307 VHLP40337 213 aa6.26□□□□□ -1.41
RRN3-202ENST00000327307 MAXP61244 160 aa6.26□□□□□ -1.41
RRN3-202ENST00000327307 BTN3A2P78410 334 aa6.26□□□□□ -1.41
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RRN3-202ENST00000327307 CDK5R2Q13319 367 aa6.26□□□□□ -1.41
RRN3-202ENST00000327307 CARD16Q5EG05 197 aa6.26□□□□□ -1.41
RRN3-202ENST00000327307 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
RRN3-202ENST00000327307 RESP18Q5W5W9 173 aa6.26□□□□□ -1.41
RRN3-202ENST00000327307 SMARCD3Q6STE5 483 aa6.26□□□□□ -1.41
RRN3-202ENST00000327307 CD164L2Q6UWJ8 174 aa6.26□□□□□ -1.41
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