RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284957.9

RABGEF1-201, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-201ENST00000284957 PXKQ7Z7A4 578 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 ADCK1Q86TW2 530 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 THAP4Q8WY91 577 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 ZFP64Q9NPA5 681 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 ISYNA1Q9NPH2 558 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 INPP5EQ9NRR6 644 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 MED29Q9NX70 200 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 COPS3Q9UNS2 423 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 TRAPPC4Q9Y296 219 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 A0A1W2PRG6 482 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 TRABD2BA6NFA1 517 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 H0YC42 278 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 GPANK1O95872 356 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 H3F3AP84243 136 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 HSF1Q00613 529 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 SULF2Q8IWU5 870 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 OR2M7Q8NG81 312 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 ASB10Q8WXI3 467 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 MOKQ9UQ07 419 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC22A23A1A5C7 686 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 NPIPB13A6NJU9 1138 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 NPIPB4C9JG80 1138 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 XKRYO14609 159 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 PSKH1P11801 424 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 CASRP41180 1078 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 OR2B6P58173 313 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 TOMM20Q15388 145 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 ETFDHQ16134 617 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 LCN1P1Q5VSP4 162 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 KLBQ86Z14 1044 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 TIGD4Q8IY51 512 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 MDS2Q8NDY4 140 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 OR2T4Q8NH00 348 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 SNX18Q96RF0 628 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 PIGQQ9BRB3 760 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 TTTY10Q9BZA0 68 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 PRR32B1ATL7 298 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 E9PI62 339 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 SULT2B1O00204 365 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 PMS2P2O95744 297 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 RENP00797 406 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 OR2T7P0C7T2 308 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 CTLA4P16410 223 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 RFC3P40938 356 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 OR12D2P58182 307 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 RAC1P63000 192 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC35D2Q76EJ3 337 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC35F2Q8IXU6 374 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF248Q8NDW4 579 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 OR2T27Q8NH04 317 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM173AQ9BQD7 235 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 ABI3Q9P2A4 366 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 B9D1Q9UPM9 204 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 A0A0J9YW62 118 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 DCDC2BA2VCK2 349 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 AQP7P3A6NL99 342 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 BCL10O95999 233 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 CLDN20P56880 219 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 ACTC1P68032 377 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 ACTA1P68133 377 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 OR14L1PQ8NHC6 308 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 TMEM203Q969S6 136 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 C4orf36Q96KX1 117 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 AGAP4Q96P64 663 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 KCNK17Q96T54 332 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 EMC6Q9BV81 110 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 WDR76Q9H967 626 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 BABAM2Q9NXR7 383 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 NOX1Q9Y5S8 564 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 MGAQ8IWI9 3026 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 TVP23AA6NH52 213 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 EFSO43281 561 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 RRADP55042 308 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 RPS25P62851 125 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 OTPQ5XKR4 325 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 GGNQ86UU5 652 aa8.35□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.7 ms