RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000228468.8

ASIC1-201, Transcript of acid sensing ion channel subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ASIC1, Length 4,072 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1-201ENST00000228468 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
ASIC1-201ENST00000228468 OR5M1Q8NGP8 315 aa14.71□□□□□ -0.05
ASIC1-201ENST00000228468 NEK7Q8TDX7 302 aa14.71□□□□□ -0.05
ASIC1-201ENST00000228468 VOPP1Q96AW1 172 aa14.71□□□□□ -0.05
ASIC1-201ENST00000228468 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
ASIC1-201ENST00000228468 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
ASIC1-201ENST00000228468 C20orf85Q9H1P6 137 aa14.71□□□□□ -0.05
ASIC1-201ENST00000228468 GSKIPQ9P0R6 139 aa14.71□□□□□ -0.05
ASIC1-201ENST00000228468 A0A087WUJ7 227 aa14.71□□□□□ -0.05
ASIC1-201ENST00000228468 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa14.71□□□□□ -0.05
ASIC1-201ENST00000228468 IFITM5A6NNB3 132 aa14.71□□□□□ -0.05
ASIC1-201ENST00000228468 C1QBP02746 253 aa14.71□□□□□ -0.05
ASIC1-201ENST00000228468 SLC2A1P11166 492 aa14.71□□□□□ -0.05
ASIC1-201ENST00000228468 DEFA5Q01523 94 aa14.71□□□□□ -0.05
ASIC1-201ENST00000228468 ACKR1Q16570 336 aa14.71□□□□□ -0.05
ASIC1-201ENST00000228468 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
ASIC1-201ENST00000228468 NCOR1O75376 2440 aa14.71□□□□□ -0.05
ASIC1-201ENST00000228468 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
ASIC1-201ENST00000228468 OR2AT4A6NND4 320 aa14.71□□□□□ -0.06
ASIC1-201ENST00000228468 TP53P04637 393 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
ASIC1-201ENST00000228468 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
ASIC1-201ENST00000228468 POU3F4P49335 361 aa14.71□□□□□ -0.06
ASIC1-201ENST00000228468 C1QL3Q5VWW1 255 aa14.71□□□□□ -0.06
ASIC1-201ENST00000228468 RAET1LQ5VY80 246 aa14.71□□□□□ -0.06
ASIC1-201ENST00000228468 SLC16A9Q7RTY1 509 aa14.71□□□□□ -0.06
ASIC1-201ENST00000228468 HSD17B8Q92506 261 aa14.71□□□□□ -0.06
ASIC1-201ENST00000228468 PPP1R14AQ96A00 147 aa14.71□□□□□ -0.06
ASIC1-201ENST00000228468 SHDQ96IW2 340 aa14.71□□□□□ -0.06
ASIC1-201ENST00000228468 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
ASIC1-201ENST00000228468 DCTDP32321 178 aa14.7□□□□□ -0.06
ASIC1-201ENST00000228468 BDH1Q02338 343 aa14.7□□□□□ -0.06
ASIC1-201ENST00000228468 CAMK2DQ13557 499 aa14.7□□□□□ -0.06
ASIC1-201ENST00000228468 YIF1BQ5BJH7 314 aa14.7□□□□□ -0.06
ASIC1-201ENST00000228468 BEST3Q8N1M1 668 aa14.7□□□□□ -0.06
ASIC1-201ENST00000228468 CCDC120Q96HB5 630 aa14.7□□□□□ -0.06
ASIC1-201ENST00000228468 KLF15Q9UIH9 416 aa14.7□□□□□ -0.06
ASIC1-201ENST00000228468 HHLA2Q9UM44 414 aa14.7□□□□□ -0.06
ASIC1-201ENST00000228468 PLPP2O43688 288 aa14.7□□□□□ -0.06
ASIC1-201ENST00000228468 THY1P04216 161 aa14.7□□□□□ -0.06
ASIC1-201ENST00000228468 SDHAP31040 664 aa14.7□□□□□ -0.06
ASIC1-201ENST00000228468 SCRN3Q0VDG4 424 aa14.7□□□□□ -0.06
ASIC1-201ENST00000228468 BEX5Q5H9J7 111 aa14.7□□□□□ -0.06
ASIC1-201ENST00000228468 GLYATL3Q5SZD4 288 aa14.7□□□□□ -0.06
ASIC1-201ENST00000228468 TMEM205Q6UW68 189 aa14.7□□□□□ -0.06
ASIC1-201ENST00000228468 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa14.7□□□□□ -0.06
ASIC1-201ENST00000228468 COMMD7Q86VX2 200 aa14.7□□□□□ -0.06
ASIC1-201ENST00000228468 ZNF321PQ8N8H1 164 aa14.7□□□□□ -0.06
ASIC1-201ENST00000228468 GPBAR1Q8TDU6 330 aa14.7□□□□□ -0.06
ASIC1-201ENST00000228468 NIPAL2Q9H841 368 aa14.7□□□□□ -0.06
ASIC1-201ENST00000228468 COPS3Q9UNS2 423 aa14.7□□□□□ -0.06
ASIC1-201ENST00000228468 SHISA3A0PJX4 238 aa14.7□□□□□ -0.06
ASIC1-201ENST00000228468 M0QYG6 137 aa14.7□□□□□ -0.06
ASIC1-201ENST00000228468 SEC14L5O43304 696 aa14.7□□□□□ -0.06
ASIC1-201ENST00000228468 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
ASIC1-201ENST00000228468 RP2O75695 350 aa14.7□□□□□ -0.06
ASIC1-201ENST00000228468 MPIG6BO95866 241 aa14.7□□□□□ -0.06
ASIC1-201ENST00000228468 CRABP1P29762 137 aa14.7□□□□□ -0.06
ASIC1-201ENST00000228468 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
ASIC1-201ENST00000228468 CCINQ13939 588 aa14.7□□□□□ -0.06
ASIC1-201ENST00000228468 CD226Q15762 336 aa14.7□□□□□ -0.06
ASIC1-201ENST00000228468 FAM69AQ5T7M9 428 aa14.7□□□□□ -0.06
ASIC1-201ENST00000228468 GLB1L2Q8IW92 636 aa14.7□□□□□ -0.06
ASIC1-201ENST00000228468 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
ASIC1-201ENST00000228468 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa14.69□□□□□ -0.06
ASIC1-201ENST00000228468 FITM1A5D6W6 292 aa14.69□□□□□ -0.06
ASIC1-201ENST00000228468 RAB40ALP0C0E4 278 aa14.69□□□□□ -0.06
ASIC1-201ENST00000228468 CD27P26842 260 aa14.69□□□□□ -0.06
ASIC1-201ENST00000228468 RAB40AQ8WXH6 277 aa14.69□□□□□ -0.06
ASIC1-201ENST00000228468 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
ASIC1-201ENST00000228468 MOKQ9UQ07 419 aa14.69□□□□□ -0.06
ASIC1-201ENST00000228468 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa14.69□□□□□ -0.06
ASIC1-201ENST00000228468 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa14.69□□□□□ -0.06
ASIC1-201ENST00000228468 F5H5K5 113 aa14.69□□□□□ -0.06
ASIC1-201ENST00000228468 PHYHO14832 338 aa14.69□□□□□ -0.06
ASIC1-201ENST00000228468 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
ASIC1-201ENST00000228468 IGHA1P01876 353 aa14.69□□□□□ -0.06
ASIC1-201ENST00000228468 TRAPPC2P0DI81 140 aa14.69□□□□□ -0.06
ASIC1-201ENST00000228468 TRAPPC2BP0DI82 140 aa14.69□□□□□ -0.06
ASIC1-201ENST00000228468 PPICP45877 212 aa14.69□□□□□ -0.06
ASIC1-201ENST00000228468 C14orf28Q4W4Y0 310 aa14.69□□□□□ -0.06
ASIC1-201ENST00000228468 NKAPLQ5M9Q1 402 aa14.69□□□□□ -0.06
ASIC1-201ENST00000228468 ALKAL2Q6UX46 152 aa14.69□□□□□ -0.06
ASIC1-201ENST00000228468 OR13C9Q8NGT0 318 aa14.69□□□□□ -0.06
ASIC1-201ENST00000228468 C8orf44Q96CB5 159 aa14.69□□□□□ -0.06
ASIC1-201ENST00000228468 SUSD2Q9UGT4 822 aa14.69□□□□□ -0.06
ASIC1-201ENST00000228468 C4orf47A7E2U8 309 aa14.69□□□□□ -0.06
ASIC1-201ENST00000228468 C9J4A7 227 aa14.69□□□□□ -0.06
ASIC1-201ENST00000228468 P2RY10O00398 339 aa14.69□□□□□ -0.06
ASIC1-201ENST00000228468 IGKV1D-16P01601 117 aa14.69□□□□□ -0.06
ASIC1-201ENST00000228468 LINC00271P0C7V0 271 aa14.69□□□□□ -0.06
ASIC1-201ENST00000228468 ZNF43P17038 809 aa14.69□□□□□ -0.06
ASIC1-201ENST00000228468 CCNOP22674 350 aa14.69□□□□□ -0.06
ASIC1-201ENST00000228468 CXADRP78310 365 aa14.69□□□□□ -0.06
ASIC1-201ENST00000228468 TDGQ13569 410 aa14.69□□□□□ -0.06
ASIC1-201ENST00000228468 SLC25A30Q5SVS4 291 aa14.69□□□□□ -0.06
ASIC1-201ENST00000228468 AWAT2Q6E213 333 aa14.69□□□□□ -0.06
ASIC1-201ENST00000228468 SYS1Q8N2H4 156 aa14.69□□□□□ -0.06
ASIC1-201ENST00000228468 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
ASIC1-201ENST00000228468 ZFAND1Q8TCF1 268 aa14.69□□□□□ -0.06
ASIC1-201ENST00000228468 ZPLD1Q8TCW7 415 aa14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms