RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635861.1

CLN3-241, Transcript of CLN3, battenin, humanhuman

TSL 5

Gene CLN3, Length 1,404 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3-241ENST00000635861 MT-ATP6P00846 226 aa15.94■□□□□ 0.14
CLN3-241ENST00000635861 BGLAPP02818 100 aa15.94■□□□□ 0.14
CLN3-241ENST00000635861 CELA3BP08861 270 aa15.94■□□□□ 0.14
CLN3-241ENST00000635861 TACSTD2P09758 323 aa15.94■□□□□ 0.14
CLN3-241ENST00000635861 DAOP14920 347 aa15.94■□□□□ 0.14
CLN3-241ENST00000635861 IDH3AP50213 366 aa15.94■□□□□ 0.14
CLN3-241ENST00000635861 CHN2P52757 468 aa15.94■□□□□ 0.14
CLN3-241ENST00000635861 PUDPQ08623 228 aa15.94■□□□□ 0.14
CLN3-241ENST00000635861 NPRL3Q12980 569 aa15.94■□□□□ 0.14
CLN3-241ENST00000635861 DAG1Q14118 895 aa15.94■□□□□ 0.14
CLN3-241ENST00000635861 OR1Q1Q15612 314 aa15.94■□□□□ 0.14
CLN3-241ENST00000635861 GSG1Q2KHT4 349 aa15.94■□□□□ 0.14
CLN3-241ENST00000635861 FAM120AOSQ5T036 256 aa15.94■□□□□ 0.14
CLN3-241ENST00000635861 SPATA21Q7Z572 469 aa15.94■□□□□ 0.14
CLN3-241ENST00000635861 PXKQ7Z7A4 578 aa15.94■□□□□ 0.14
CLN3-241ENST00000635861 MDP1Q86V88 176 aa15.94■□□□□ 0.14
CLN3-241ENST00000635861 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
CLN3-241ENST00000635861 ZNF786Q8N393 782 aa15.94■□□□□ 0.14
CLN3-241ENST00000635861 CCDC197Q8NCU1 140 aa15.94■□□□□ 0.14
CLN3-241ENST00000635861 STON2Q8WXE9 905 aa15.94■□□□□ 0.14
CLN3-241ENST00000635861 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
CLN3-241ENST00000635861 RABEP2Q9H5N1 569 aa15.94■□□□□ 0.14
CLN3-241ENST00000635861 NOX3Q9HBY0 568 aa15.94■□□□□ 0.14
CLN3-241ENST00000635861 B3GNT2Q9NY97 397 aa15.94■□□□□ 0.14
CLN3-241ENST00000635861 SLAMF8Q9P0V8 285 aa15.94■□□□□ 0.14
CLN3-241ENST00000635861 ANGPT4Q9Y264 503 aa15.94■□□□□ 0.14
CLN3-241ENST00000635861 M0R3G1 203 aa15.93■□□□□ 0.14
CLN3-241ENST00000635861 TPST1O60507 370 aa15.93■□□□□ 0.14
CLN3-241ENST00000635861 ENTPD5O75356 428 aa15.93■□□□□ 0.14
CLN3-241ENST00000635861 CAPZA2P47755 286 aa15.93■□□□□ 0.14
CLN3-241ENST00000635861 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
CLN3-241ENST00000635861 SQLEQ14534 574 aa15.93■□□□□ 0.14
CLN3-241ENST00000635861 PAGE3Q5JUK9 113 aa15.93■□□□□ 0.14
CLN3-241ENST00000635861 COMTD1Q86VU5 262 aa15.93■□□□□ 0.14
CLN3-241ENST00000635861 ARMC8Q8IUR7 673 aa15.93■□□□□ 0.14
CLN3-241ENST00000635861 CHODLQ9H9P2 273 aa15.93■□□□□ 0.14
CLN3-241ENST00000635861 DYNLRB1Q9NP97 96 aa15.93■□□□□ 0.14
CLN3-241ENST00000635861 CMAHPQ9Y471 501 aa15.93■□□□□ 0.14
CLN3-241ENST00000635861 TMEM129A0AVI4 362 aa15.92■□□□□ 0.14
CLN3-241ENST00000635861 SLC35F4A4IF30 521 aa15.92■□□□□ 0.14
CLN3-241ENST00000635861 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa15.92■□□□□ 0.14
CLN3-241ENST00000635861 ZNF726A6NNF4 738 aa15.92■□□□□ 0.14
CLN3-241ENST00000635861 NR4A1P22736 598 aa15.92■□□□□ 0.14
CLN3-241ENST00000635861 MNAT1P51948 309 aa15.92■□□□□ 0.14
CLN3-241ENST00000635861 RBBP4Q09028 425 aa15.92■□□□□ 0.14
CLN3-241ENST00000635861 PMS2P3Q13401 168 aa15.92■□□□□ 0.14
CLN3-241ENST00000635861 ZNF613Q6PF04 617 aa15.92■□□□□ 0.14
CLN3-241ENST00000635861 NHLRC1Q6VVB1 395 aa15.92■□□□□ 0.14
CLN3-241ENST00000635861 ZNF813Q6ZN06 617 aa15.92■□□□□ 0.14
CLN3-241ENST00000635861 C10orf111Q8N326 155 aa15.92■□□□□ 0.14
CLN3-241ENST00000635861 SVOPLQ8N434 492 aa15.92■□□□□ 0.14
CLN3-241ENST00000635861 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa15.92■□□□□ 0.14
CLN3-241ENST00000635861 RNF217Q8TC41 542 aa15.92■□□□□ 0.14
CLN3-241ENST00000635861 EBF4Q9BQW3 602 aa15.92■□□□□ 0.14
CLN3-241ENST00000635861 POFUT2Q9Y2G5 429 aa15.92■□□□□ 0.14
CLN3-241ENST00000635861 MFN2O95140 757 aa15.91■□□□□ 0.14
CLN3-241ENST00000635861 HPRP00739 348 aa15.91■□□□□ 0.14
CLN3-241ENST00000635861 TGFAP01135 160 aa15.91■□□□□ 0.14
CLN3-241ENST00000635861 VIMP08670 466 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
CLN3-241ENST00000635861 HLA-DOBP13765 273 aa15.91■□□□□ 0.14
CLN3-241ENST00000635861 CBLP22681 906 aa15.91■□□□□ 0.14
CLN3-241ENST00000635861 RPS23P62266 143 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
CLN3-241ENST00000635861 ADRM1Q16186 407 aa15.91■□□□□ 0.14
CLN3-241ENST00000635861 PHYHD1Q5SRE7 291 aa15.91■□□□□ 0.14
CLN3-241ENST00000635861 REP15Q6BDI9 236 aa15.91■□□□□ 0.14
CLN3-241ENST00000635861 LINC00114Q6XXX2 140 aa15.91■□□□□ 0.14
CLN3-241ENST00000635861 UBASH3BQ8TF42 649 aa15.91■□□□□ 0.14
CLN3-241ENST00000635861 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
CLN3-241ENST00000635861 FOXB1Q99853 325 aa15.91■□□□□ 0.14
CLN3-241ENST00000635861 ULBP2Q9BZM5 246 aa15.91■□□□□ 0.14
CLN3-241ENST00000635861 MS4A5Q9H3V2 200 aa15.91■□□□□ 0.14
CLN3-241ENST00000635861 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa15.91■□□□□ 0.14
CLN3-241ENST00000635861 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
CLN3-241ENST00000635861 PLPP3O14495 311 aa15.9■□□□□ 0.14
CLN3-241ENST00000635861 CHP2O43745 196 aa15.9■□□□□ 0.14
CLN3-241ENST00000635861 SYNGR3O43761 229 aa15.9■□□□□ 0.14
CLN3-241ENST00000635861 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
CLN3-241ENST00000635861 UBL3O95164 117 aa15.9■□□□□ 0.14
CLN3-241ENST00000635861 ZNF35P13682 527 aa15.9■□□□□ 0.14
CLN3-241ENST00000635861 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
CLN3-241ENST00000635861 GLRXP35754 106 aa15.9■□□□□ 0.14
CLN3-241ENST00000635861 SEC24CP53992 1094 aa15.9■□□□□ 0.14
CLN3-241ENST00000635861 AQP5P55064 265 aa15.9■□□□□ 0.14
CLN3-241ENST00000635861 CDH12P55289 794 aa15.9■□□□□ 0.14
CLN3-241ENST00000635861 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
CLN3-241ENST00000635861 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
CLN3-241ENST00000635861 AGKQ53H12 422 aa15.9■□□□□ 0.14
CLN3-241ENST00000635861 SLC30A8Q8IWU4 369 aa15.9■□□□□ 0.14
CLN3-241ENST00000635861 C11orf65Q8NCR3 313 aa15.9■□□□□ 0.14
CLN3-241ENST00000635861 OR6N1Q8NGY5 312 aa15.9■□□□□ 0.14
CLN3-241ENST00000635861 OR5J2Q8NH18 312 aa15.9■□□□□ 0.14
CLN3-241ENST00000635861 ZNF75AQ96N20 296 aa15.9■□□□□ 0.14
CLN3-241ENST00000635861 MOGAT1Q96PD6 335 aa15.9■□□□□ 0.14
CLN3-241ENST00000635861 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
CLN3-241ENST00000635861 EMC6Q9BV81 110 aa15.9■□□□□ 0.14
CLN3-241ENST00000635861 IKZF5Q9H5V7 419 aa15.9■□□□□ 0.14
CLN3-241ENST00000635861 MED29Q9NX70 200 aa15.9■□□□□ 0.14
CLN3-241ENST00000635861 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
CLN3-241ENST00000635861 TPST2O60704 377 aa15.89■□□□□ 0.13
CLN3-241ENST00000635861 SEC14L2O76054 403 aa15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 95 ms