RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623316.1

ATRX-210, Transcript of ATRX, chromatin remodeler, humanhuman

TSL 5

Gene ATRX, Length 803 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRX-210ENST00000623316 CYTIPO60759 359 aa5.13□□□□□ -1.59
ATRX-210ENST00000623316 STK16O75716 305 aa5.13□□□□□ -1.59
ATRX-210ENST00000623316 IGHV4-59P01825 116 aa5.13□□□□□ -1.59
ATRX-210ENST00000623316 ALPLP05186 524 aa5.13□□□□□ -1.59
ATRX-210ENST00000623316 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
ATRX-210ENST00000623316 SERPINB8P50452 374 aa5.13□□□□□ -1.59
ATRX-210ENST00000623316 LINC00205P59089 165 aa5.13□□□□□ -1.59
ATRX-210ENST00000623316 PDZK1IP1Q13113 114 aa5.13□□□□□ -1.59
ATRX-210ENST00000623316 GPR50Q13585 617 aa5.13□□□□□ -1.59
ATRX-210ENST00000623316 FAM53BQ14153 422 aa5.13□□□□□ -1.59
ATRX-210ENST00000623316 DOC2AQ14183 400 aa5.13□□□□□ -1.59
ATRX-210ENST00000623316 HEPACAMQ14CZ8 416 aa5.13□□□□□ -1.59
ATRX-210ENST00000623316 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa5.13□□□□□ -1.59
ATRX-210ENST00000623316 LCE1DQ5T752 114 aa5.13□□□□□ -1.59
ATRX-210ENST00000623316 FAM219BQ5XKK7 198 aa5.13□□□□□ -1.59
ATRX-210ENST00000623316 AWAT2Q6E213 333 aa5.13□□□□□ -1.59
ATRX-210ENST00000623316 SLC25A24Q6NUK1 477 aa5.13□□□□□ -1.59
ATRX-210ENST00000623316 ARSKQ6UWY0 536 aa5.13□□□□□ -1.59
ATRX-210ENST00000623316 PRSS57Q6UWY2 283 aa5.13□□□□□ -1.59
ATRX-210ENST00000623316 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa5.13□□□□□ -1.59
ATRX-210ENST00000623316 FRA10AC1Q70Z53 315 aa5.13□□□□□ -1.59
ATRX-210ENST00000623316 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
ATRX-210ENST00000623316 SLC43A2Q8N370 569 aa5.13□□□□□ -1.59
ATRX-210ENST00000623316 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
ATRX-210ENST00000623316 OR9A4Q8NGU2 314 aa5.13□□□□□ -1.59
ATRX-210ENST00000623316 OR4C3Q8NH37 302 aa5.13□□□□□ -1.59
ATRX-210ENST00000623316 NT5CQ8TCD5 201 aa5.13□□□□□ -1.59
ATRX-210ENST00000623316 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
ATRX-210ENST00000623316 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
ATRX-210ENST00000623316 DTNBP1Q96EV8 351 aa5.13□□□□□ -1.59
ATRX-210ENST00000623316 CATSPER2Q96P56 530 aa5.13□□□□□ -1.59
ATRX-210ENST00000623316 SSX3Q99909 188 aa5.13□□□□□ -1.59
ATRX-210ENST00000623316 FUNDC2Q9BWH2 189 aa5.13□□□□□ -1.59
ATRX-210ENST00000623316 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa5.13□□□□□ -1.59
ATRX-210ENST00000623316 ZNF665Q9H7R5 613 aa5.13□□□□□ -1.59
ATRX-210ENST00000623316 VIPAS39Q9H9C1 493 aa5.13□□□□□ -1.59
ATRX-210ENST00000623316 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
ATRX-210ENST00000623316 WWOXQ9NZC7 414 aa5.13□□□□□ -1.59
ATRX-210ENST00000623316 NUDT4Q9NZJ9 180 aa5.13□□□□□ -1.59
ATRX-210ENST00000623316 CD274Q9NZQ7 290 aa5.13□□□□□ -1.59
ATRX-210ENST00000623316 TMEM216Q9P0N5 145 aa5.13□□□□□ -1.59
ATRX-210ENST00000623316 RNF7Q9UBF6 113 aa5.13□□□□□ -1.59
ATRX-210ENST00000623316 IL20RAQ9UHF4 553 aa5.13□□□□□ -1.59
ATRX-210ENST00000623316 ENTPD4Q9Y227 616 aa5.13□□□□□ -1.59
ATRX-210ENST00000623316 SLC22A7Q9Y694 548 aa5.13□□□□□ -1.59
ATRX-210ENST00000623316 V9GYY5 206 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
ATRX-210ENST00000623316 TEX15Q9BXT5 2789 aa5.12□□□□□ -1.59
ATRX-210ENST00000623316 A0A087WZY1 265 aa5.12□□□□□ -1.59
ATRX-210ENST00000623316 ZNF860A6NHJ4 632 aa5.12□□□□□ -1.59
ATRX-210ENST00000623316 ARGFXA6NJG6 315 aa5.12□□□□□ -1.59
ATRX-210ENST00000623316 SUPT3HB4E1H0 165 aa5.12□□□□□ -1.59
ATRX-210ENST00000623316 C9J4A7 227 aa5.12□□□□□ -1.59
ATRX-210ENST00000623316 SGK494L7N484 410 aa5.12□□□□□ -1.59
ATRX-210ENST00000623316 E2F3O00716 465 aa5.12□□□□□ -1.59
ATRX-210ENST00000623316 TXNDC9O14530 226 aa5.12□□□□□ -1.59
ATRX-210ENST00000623316 CHEK1O14757 476 aa5.12□□□□□ -1.59
ATRX-210ENST00000623316 CIDEAO60543 219 aa5.12□□□□□ -1.59
ATRX-210ENST00000623316 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
ATRX-210ENST00000623316 SAP30O75446 220 aa5.12□□□□□ -1.59
ATRX-210ENST00000623316 SUPT3HO75486 399 aa5.12□□□□□ -1.59
ATRX-210ENST00000623316 CEACAM4O75871 244 aa5.12□□□□□ -1.59
ATRX-210ENST00000623316 KRT33AO76009 404 aa5.12□□□□□ -1.59
ATRX-210ENST00000623316 SYNGR4O95473 234 aa5.12□□□□□ -1.59
ATRX-210ENST00000623316 NSA2O95478 260 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
ATRX-210ENST00000623316 SERPINA6P08185 405 aa5.12□□□□□ -1.59
ATRX-210ENST00000623316 CT45A8P0DMV1 189 aa5.12□□□□□ -1.59
ATRX-210ENST00000623316 CT45A9P0DMV2 189 aa5.12□□□□□ -1.59
ATRX-210ENST00000623316 IL1RNP18510 177 aa5.12□□□□□ -1.59
ATRX-210ENST00000623316 MMP11P24347 488 aa5.12□□□□□ -1.59
ATRX-210ENST00000623316 ACKR3P25106 362 aa5.12□□□□□ -1.59
ATRX-210ENST00000623316 TRPC1P48995 793 aa5.12□□□□□ -1.59
ATRX-210ENST00000623316 CCL11P51671 97 aa5.12□□□□□ -1.59
ATRX-210ENST00000623316 PMP22Q01453 160 aa5.12□□□□□ -1.59
ATRX-210ENST00000623316 CHIT1Q13231 466 aa5.12□□□□□ -1.59
ATRX-210ENST00000623316 RAPSNQ13702 412 aa5.12□□□□□ -1.59
ATRX-210ENST00000623316 P2RY6Q15077 328 aa5.12□□□□□ -1.59
ATRX-210ENST00000623316 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
ATRX-210ENST00000623316 PDK4Q16654 411 aa5.12□□□□□ -1.59
ATRX-210ENST00000623316 FAM83EQ2M2I3 478 aa5.12□□□□□ -1.59
ATRX-210ENST00000623316 ADPRMQ3LIE5 342 aa5.12□□□□□ -1.59
ATRX-210ENST00000623316 GPAT3Q53EU6 434 aa5.12□□□□□ -1.59
ATRX-210ENST00000623316 CT45A2Q5DJT8 189 aa5.12□□□□□ -1.59
ATRX-210ENST00000623316 WDR38Q5JTN6 314 aa5.12□□□□□ -1.59
ATRX-210ENST00000623316 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa5.12□□□□□ -1.59
ATRX-210ENST00000623316 PRMT9Q6P2P2 845 aa5.12□□□□□ -1.59
ATRX-210ENST00000623316 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa5.12□□□□□ -1.59
ATRX-210ENST00000623316 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa5.12□□□□□ -1.59
ATRX-210ENST00000623316 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
ATRX-210ENST00000623316 PRSS58Q8IYP2 241 aa5.12□□□□□ -1.59
ATRX-210ENST00000623316 TCAIMQ8N3R3 496 aa5.12□□□□□ -1.59
ATRX-210ENST00000623316 RNF175Q8N4F7 328 aa5.12□□□□□ -1.59
ATRX-210ENST00000623316 LRRC17Q8N6Y2 441 aa5.12□□□□□ -1.59
ATRX-210ENST00000623316 CCDC197Q8NCU1 140 aa5.12□□□□□ -1.59
ATRX-210ENST00000623316 FAM71CQ8NEG0 241 aa5.12□□□□□ -1.59
ATRX-210ENST00000623316 OR5T3Q8NGG3 340 aa5.12□□□□□ -1.59
ATRX-210ENST00000623316 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa5.12□□□□□ -1.59
ATRX-210ENST00000623316 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP5.12□□□□□ -1.59
ATRX-210ENST00000623316 THRSPQ92748 146 aa5.12□□□□□ -1.59
ATRX-210ENST00000623316 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
ATRX-210ENST00000623316 RAB39BQ96DA2 213 aa5.12□□□□□ -1.59
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