RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616395.4

TRAPPC3-209, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,336 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-209ENST00000616395 RIBC2Q9H4K1 309 aa15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 GLRX2Q9NS18 164 aa15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 FAM118AQ9NWS6 357 aa15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 BLOC1S6Q9UL45 172 aa15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 MYRFQ9Y2G1 1151 aa15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 OR10H3O60404 316 aa15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 COX10Q12887 443 aa15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 RAB35Q15286 201 aa15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 C11orf71Q6IPW1 123 aa15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 OLIG3Q7RTU3 272 aa15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 OR4C15Q8NGM1 316 aa15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 OR6T1Q8NGN1 323 aa15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 DHRS1Q96LJ7 313 aa15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 TEX12Q9BXU0 123 aa15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 PTGES2Q9H7Z7 377 aa15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 VNN3Q9NY84 501 aa15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 FREM1Q5H8C1 2179 aa15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 TGP01266 2768 aa15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 ALPK2Q86TB3 2170 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 CDHR4A6H8M9 788 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 J3KTA2 159 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 SLC16A6O15403 523 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 LYNP07948 512 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 COPZ1P61923 177 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 ESRRGP62508 458 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 TMEM44Q2T9K0 475 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 THAP5Q7Z6K1 395 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 CDK20Q8IZL9 346 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 DEPDC4Q8N2C3 294 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 OR4C3Q8NH37 302 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 FEVQ99581 238 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 GMPPBQ9Y5P6 360 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 TRAPPC13A5PLN9 417 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 CXCL13O43927 109 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 CYP7B1O75881 506 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 SYNGR4O95473 234 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 ANGPTL1O95841 491 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 CSTAP01040 98 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 OPN1LWP04000 364 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 LIMS1P48059 325 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 DAPP51397 102 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 ENTPD8Q5MY95 495 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 PDZK1Q5T2W1 519 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 TFAP2EQ6VUC0 442 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 HS3ST5Q8IZT8 346 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 PARP8Q8N3A8 854 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 SGMS2Q8NHU3 365 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 PIGXQ8TBF5 258 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 DUSP19Q8WTR2 217 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 ADGRG7Q96K78 797 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 KLHDC3Q9BQ90 382 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 POTEKPQ9BYX7 375 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 SDHAF3Q9NRP4 125 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 CBLN4Q9NTU7 201 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 A4GNTQ9UNA3 340 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 MGAM2Q2M2H8 2515 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 SERINC4A6NH21 518 aa15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 ABCD4O14678 606 aa15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 TTKP33981 857 aa15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 NPRL3Q12980 569 aa15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 GGTLC2Q14390 218 aa15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 P2RY6Q15077 328 aa15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 TMEM154Q6P9G4 183 aa15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 ZNF613Q6PF04 617 aa15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 UGT2A3Q6UWM9 527 aa15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 ZNF730Q6ZMV8 503 aa15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 GALNT5Q7Z7M9 940 aa15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 AQP11Q8NBQ7 271 aa15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 SLC41A3Q96GZ6 507 aa15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 PRR14Q9BWN1 585 aa15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 PRRG3Q9BZD7 231 aa15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 RHCGQ9UBD6 479 aa15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 DYSFO75923 2080 aa15.46■□□□□ 0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 SH3PXD2BA1X283 911 aa15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 DLGAP1O14490 977 aa15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 OIP5O43482 229 aa15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.4 ms