RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590061.1

SMAD4-210, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD4, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-210ENST00000590061 RBP7Q96R05 134 aa6.57□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa6.57□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 WFDC6Q9BQY6 131 aa6.57□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 PRRG4Q9BZD6 226 aa6.57□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 SLC25A18Q9H1K4 315 aa6.57□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 OR52D1Q9H346 318 aa6.57□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 TXNIPQ9H3M7 391 aa6.57□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 RNF122Q9H9V4 155 aa6.57□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa6.57□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 DCAF16Q9NXF7 216 aa6.57□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 KLHL9Q9P2J3 617 aa6.57□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 REV1Q9UBZ9 1251 aa6.57□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 NPIPA1Q9UND3 350 aa6.57□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 MOKQ9UQ07 419 aa6.57□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 MYRFQ9Y2G1 1151 aa6.57□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 NTNG1Q9Y2I2 539 aa6.57□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa6.57□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 EML6Q6ZMW3 1958 aa6.57□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 FREM3P0C091 2139 aa6.56□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 SVILO95425 2214 aa6.56□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 SLC22A31A6NKX4 558 aa6.56□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 AQP7P3A6NL99 342 aa6.56□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 MCIDASD6RGH6 385 aa6.56□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 FTCDNL1E5RQL4 147 aa6.56□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 NPIPA2E9PIF3 369 aa6.56□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 NPIPA3F8WFD2 350 aa6.56□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 G3V3Y1 287 aa6.56□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 H3BML4 177 aa6.56□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 PLPP3O14495 311 aa6.56□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 GMFGO60234 142 aa6.56□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 WDR1O75083 606 aa6.56□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 BCL10O95999 233 aa6.56□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 IGHMP01871 453 aa6.56□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 BGLAPP02818 100 aa6.56□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 CRHP06850 196 aa6.56□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 RPSAP08865 295 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 C1QTNF9P0C862 333 aa6.56□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 ADORA3P0DMS8 318 aa6.56□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 CCNA2P20248 432 aa6.56□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 MAKP20794 623 aa6.56□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 AHCYP23526 432 aa6.56□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 PAX7P23759 505 aa6.56□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 MST1P26927 711 aa6.56□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 ACVR2AP27037 513 aa6.56□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 GRPRP30550 384 aa6.56□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 UQCRC1P31930 480 aa6.56□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 MAGEA5P43359 124 aa6.56□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 CHN2P52757 468 aa6.56□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 B3GALT5-AS1P59052 145 aa6.56□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 RPL27P61353 136 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 IL5RAQ01344 420 aa6.56□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 EGR4Q05215 589 aa6.56□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 OR7A5Q15622 319 aa6.56□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 STK11Q15831 433 aa6.56□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 PGGHGQ32M88 737 aa6.56□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 SLC35D3Q5M8T2 416 aa6.56□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 C12orf73Q69YU5 71 aa6.56□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 WDR88Q6ZMY6 472 aa6.56□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 USP51Q70EK9 711 aa6.56□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 TRILQ7L0X0 811 aa6.56□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 HS3ST5Q8IZT8 346 aa6.56□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 MFSD4AQ8N468 514 aa6.56□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa6.56□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa6.56□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 OR2T4Q8NH00 348 aa6.56□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 PFN4Q8NHR9 129 aa6.56□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 RHOXF1Q8NHV9 184 aa6.56□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 FAM81AQ8TBF8 368 aa6.56□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 POC1BQ8TC44 478 aa6.56□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 MYDGFQ969H8 173 aa6.56□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa6.56□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 MNTQ99583 582 aa6.56□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 TM9SF2Q99805 663 aa6.56□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 ALG12Q9BV10 488 aa6.56□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 PRORYQ9H606 182 aa6.56□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 CALHM2Q9HA72 323 aa6.56□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 NRIP3Q9NQ35 241 aa6.56□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 CMC2Q9NRP2 79 aa6.56□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 DEPPQ9NTK1 212 aa6.56□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 C20orf141Q9NUB4 165 aa6.56□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa6.56□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 RCE1Q9Y256 329 aa6.56□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF407Q9C0G0 2248 aa6.56□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 PCNX3Q9H6A9 2034 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 MAGEA13PA6NCF6 341 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 FAM166BA8MTA8 275 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF724A8MTY0 619 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 MASP2O00187 686 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 PRODHO43272 600 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-210ENST00000590061 TMCC2O75069 709 aa6.55□□□□□ -1.36
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