RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580646.5

GGA3-209, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene GGA3, Length 829 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-209ENST00000580646 IST1P53990 364 aa8.74□□□□□ -1.01
GGA3-209ENST00000580646 PRPS1P60891 318 aa8.74□□□□□ -1.01
GGA3-209ENST00000580646 CCNIQ14094 377 aa8.74□□□□□ -1.01
GGA3-209ENST00000580646 SEC23BQ15437 767 aa8.74□□□□□ -1.01
GGA3-209ENST00000580646 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa8.74□□□□□ -1.01
GGA3-209ENST00000580646 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa8.74□□□□□ -1.01
GGA3-209ENST00000580646 ZFP1Q6P2D0 407 aa8.74□□□□□ -1.01
GGA3-209ENST00000580646 TBPL2Q6SJ96 375 aa8.74□□□□□ -1.01
GGA3-209ENST00000580646 SPNS3Q6ZMD2 512 aa8.74□□□□□ -1.01
GGA3-209ENST00000580646 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
GGA3-209ENST00000580646 HDDC2Q7Z4H3 204 aa8.74□□□□□ -1.01
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GGA3-209ENST00000580646 LRRC17Q8N6Y2 441 aa8.74□□□□□ -1.01
GGA3-209ENST00000580646 ZNF610Q8N9Z0 462 aa8.74□□□□□ -1.01
GGA3-209ENST00000580646 OR52J3Q8NH60 311 aa8.74□□□□□ -1.01
GGA3-209ENST00000580646 NINJ1Q92982 152 aa8.74□□□□□ -1.01
GGA3-209ENST00000580646 APH1AQ96BI3 265 aa8.74□□□□□ -1.01
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GGA3-209ENST00000580646 LIME1Q9H400 295 aa8.74□□□□□ -1.01
GGA3-209ENST00000580646 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
GGA3-209ENST00000580646 DNAJB9Q9UBS3 223 aa8.74□□□□□ -1.01
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GGA3-209ENST00000580646 MALT1Q9UDY8 824 aa8.74□□□□□ -1.01
GGA3-209ENST00000580646 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
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GGA3-209ENST00000580646 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
GGA3-209ENST00000580646 HPRP00739 348 aa8.73□□□□□ -1.01
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GGA3-209ENST00000580646 POU2F1P14859 743 aa8.73□□□□□ -1.01
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GGA3-209ENST00000580646 PTNP21246 168 aa8.73□□□□□ -1.01
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GGA3-209ENST00000580646 AHCYP23526 432 aa8.73□□□□□ -1.01
GGA3-209ENST00000580646 NTF4P34130 210 aa8.73□□□□□ -1.01
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GGA3-209ENST00000580646 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
GGA3-209ENST00000580646 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
GGA3-209ENST00000580646 TSPAN31Q12999 210 aa8.73□□□□□ -1.01
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GGA3-209ENST00000580646 FBXW9Q5XUX1 488 aa8.73□□□□□ -1.01
GGA3-209ENST00000580646 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
GGA3-209ENST00000580646 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa8.73□□□□□ -1.01
GGA3-209ENST00000580646 Q6ZT83 130 aa8.73□□□□□ -1.01
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GGA3-209ENST00000580646 ABCA4P78363 2273 aa8.72□□□□□ -1.01
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GGA3-209ENST00000580646 ATP6AP1Q15904 470 aa8.72□□□□□ -1.01
GGA3-209ENST00000580646 ZBED5Q49AG3 693 aa8.72□□□□□ -1.01
GGA3-209ENST00000580646 ALG10Q5BKT4 473 aa8.72□□□□□ -1.01
GGA3-209ENST00000580646 FAM205BPQ63HN1 556 aa8.72□□□□□ -1.01
GGA3-209ENST00000580646 PGBD2Q6P3X8 592 aa8.72□□□□□ -1.01
GGA3-209ENST00000580646 TMEM154Q6P9G4 183 aa8.72□□□□□ -1.01
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