RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568693.1

E2F4-211, Transcript of E2F transcription factor 4, human

TSL 2

Gene E2F4, Length 596 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
E2F4-211	ENST00000568693	XKRY	O14609	159 aa		7.39	□□□□□ -1.23
E2F4-211	ENST00000568693	PRODH	O43272	600 aa		7.39	□□□□□ -1.23
E2F4-211	ENST00000568693	TRAF3IP2	O43734	574 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
E2F4-211	ENST00000568693	CYTIP	O60759	359 aa		7.39	□□□□□ -1.23
E2F4-211	ENST00000568693	RAMP1	O60894	148 aa		7.39	□□□□□ -1.23
E2F4-211	ENST00000568693	ENTPD6	O75354	484 aa		7.39	□□□□□ -1.23
E2F4-211	ENST00000568693	SERPINI2	O75830	405 aa		7.39	□□□□□ -1.23
E2F4-211	ENST00000568693	PLG	P00747	810 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
E2F4-211	ENST00000568693	LYN	P07948	512 aa		7.39	□□□□□ -1.23
E2F4-211	ENST00000568693	SFTPC	P11686	197 aa		7.39	□□□□□ -1.23
E2F4-211	ENST00000568693	HLA-DOB	P13765	273 aa		7.39	□□□□□ -1.23
E2F4-211	ENST00000568693	IFNGR1	P15260	489 aa		7.39	□□□□□ -1.23
E2F4-211	ENST00000568693	CRHBP	P24387	322 aa		7.39	□□□□□ -1.23
E2F4-211	ENST00000568693	FMO3	P31513	532 aa		7.39	□□□□□ -1.23
E2F4-211	ENST00000568693	GABARAPL2	P60520	117 aa		7.39	□□□□□ -1.23
E2F4-211	ENST00000568693	RAP1B	P61224	184 aa		7.39	□□□□□ -1.23
E2F4-211	ENST00000568693	RPL27	P61353	136 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
E2F4-211	ENST00000568693	RAP1A	P62834	184 aa		7.39	□□□□□ -1.23
E2F4-211	ENST00000568693	CSNK2B	P67870	215 aa		7.39	□□□□□ -1.23
E2F4-211	ENST00000568693	KHDRBS1	Q07666	443 aa	Known RBP eCLIP	7.39	□□□□□ -1.23
E2F4-211	ENST00000568693	CRMP1	Q14194	572 aa		7.39	□□□□□ -1.23
E2F4-211	ENST00000568693	ZNF362	Q5T0B9	420 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
E2F4-211	ENST00000568693	SLC35F1	Q5T1Q4	408 aa		7.39	□□□□□ -1.23
E2F4-211	ENST00000568693	ARMC4	Q5T2S8	1044 aa		7.39	□□□□□ -1.23
E2F4-211	ENST00000568693	AADACL4	Q5VUY2	407 aa		7.39	□□□□□ -1.23
E2F4-211	ENST00000568693	NXNL2	Q5VZ03	156 aa		7.39	□□□□□ -1.23
E2F4-211	ENST00000568693	TMEM225	Q6GV28	225 aa		7.39	□□□□□ -1.23
E2F4-211	ENST00000568693	NIPAL3	Q6P499	406 aa		7.39	□□□□□ -1.23
E2F4-211	ENST00000568693	NHLRC1	Q6VVB1	395 aa		7.39	□□□□□ -1.23
E2F4-211	ENST00000568693	SLC35D2	Q76EJ3	337 aa		7.39	□□□□□ -1.23
E2F4-211	ENST00000568693	CXXC5	Q7LFL8	322 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
E2F4-211	ENST00000568693	HDDC2	Q7Z4H3	204 aa		7.39	□□□□□ -1.23
E2F4-211	ENST00000568693	GPAT4	Q86UL3	456 aa		7.39	□□□□□ -1.23
E2F4-211	ENST00000568693	JAZF1	Q86VZ6	243 aa		7.39	□□□□□ -1.23
E2F4-211	ENST00000568693	GID4	Q8IVV7	300 aa		7.39	□□□□□ -1.23
E2F4-211	ENST00000568693	PM20D2	Q8IYS1	436 aa		7.39	□□□□□ -1.23
E2F4-211	ENST00000568693	KDM8	Q8N371	416 aa		7.39	□□□□□ -1.23
E2F4-211	ENST00000568693	ARIH2OS	Q8N7S6	290 aa		7.39	□□□□□ -1.23
E2F4-211	ENST00000568693	SLC37A3	Q8NCC5	494 aa		7.39	□□□□□ -1.23
E2F4-211	ENST00000568693	NPEPL1	Q8NDH3	523 aa		7.39	□□□□□ -1.23
E2F4-211	ENST00000568693	SDR9C7	Q8NEX9	313 aa		7.39	□□□□□ -1.23
E2F4-211	ENST00000568693	OR52E2	Q8NGJ4	325 aa		7.39	□□□□□ -1.23
E2F4-211	ENST00000568693	OR4K13	Q8NH42	304 aa		7.39	□□□□□ -1.23
E2F4-211	ENST00000568693	ASB10	Q8WXI3	467 aa		7.39	□□□□□ -1.23
E2F4-211	ENST00000568693	RFK	Q969G6	155 aa		7.39	□□□□□ -1.23
E2F4-211	ENST00000568693	WDYHV1	Q96HA8	205 aa		7.39	□□□□□ -1.23
E2F4-211	ENST00000568693	GPR137	Q96N19	417 aa		7.39	□□□□□ -1.23
E2F4-211	ENST00000568693	ZNF582	Q96NG8	517 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
E2F4-211	ENST00000568693	DDO	Q99489	341 aa		7.39	□□□□□ -1.23
E2F4-211	ENST00000568693	HINT3	Q9NQE9	182 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
E2F4-211	ENST00000568693	PLCXD1	Q9NUJ7	323 aa		7.39	□□□□□ -1.23
E2F4-211	ENST00000568693	DNAJC27	Q9NZQ0	273 aa		7.39	□□□□□ -1.23
E2F4-211	ENST00000568693	ZNF346	Q9UL40	294 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
E2F4-211	ENST00000568693	NPIPA1	Q9UND3	350 aa		7.39	□□□□□ -1.23
E2F4-211	ENST00000568693	PIEZO2	Q9H5I5	2752 aa		7.39	□□□□□ -1.23
E2F4-211	ENST00000568693	COL6A6	A6NMZ7	2263 aa		7.39	□□□□□ -1.23
E2F4-211	ENST00000568693	MED12	Q93074	2177 aa		7.39	□□□□□ -1.23
E2F4-211	ENST00000568693	TLN1	Q9Y490	2541 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
E2F4-211	ENST00000568693	IGKV3D-15	A0A087WSY6	115 aa		7.38	□□□□□ -1.23
E2F4-211	ENST00000568693	PRSS37	A4D1T9	235 aa		7.38	□□□□□ -1.23
E2F4-211	ENST00000568693	MAGEA13P	A6NCF6	341 aa		7.38	□□□□□ -1.23
E2F4-211	ENST00000568693	FAM183A	A6NL82	134 aa		7.38	□□□□□ -1.23
E2F4-211	ENST00000568693	ZNF716	A6NP11	495 aa		7.38	□□□□□ -1.23
E2F4-211	ENST00000568693	PRR23D1	E9PI22	279 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
E2F4-211	ENST00000568693	NPIPA2	E9PIF3	369 aa		7.38	□□□□□ -1.23
E2F4-211	ENST00000568693	NPIPA3	F8WFD2	350 aa		7.38	□□□□□ -1.23
E2F4-211	ENST00000568693	XPNPEP2	O43895	674 aa		7.38	□□□□□ -1.23
E2F4-211	ENST00000568693	SYNGR4	O95473	234 aa		7.38	□□□□□ -1.23
E2F4-211	ENST00000568693	BCL10	O95999	233 aa		7.38	□□□□□ -1.23
E2F4-211	ENST00000568693	PRR23D2	P0DMB1	279 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
E2F4-211	ENST00000568693	DBT	P11182	482 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
E2F4-211	ENST00000568693	PIP	P12273	146 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
E2F4-211	ENST00000568693	ZNF43	P17038	809 aa		7.38	□□□□□ -1.23
E2F4-211	ENST00000568693	SLC2A5	P22732	501 aa		7.38	□□□□□ -1.23
E2F4-211	ENST00000568693	ACVR2A	P27037	513 aa		7.38	□□□□□ -1.23
E2F4-211	ENST00000568693	HTR1F	P30939	366 aa		7.38	□□□□□ -1.23
E2F4-211	ENST00000568693	ACVR1B	P36896	505 aa		7.38	□□□□□ -1.23
E2F4-211	ENST00000568693	CDKN2A	P42771	156 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
E2F4-211	ENST00000568693	SLC15A1	P46059	708 aa		7.38	□□□□□ -1.23
E2F4-211	ENST00000568693	SLC25A1	P53007	311 aa		7.38	□□□□□ -1.23
E2F4-211	ENST00000568693	SLC16A1	P53985	500 aa		7.38	□□□□□ -1.23
E2F4-211	ENST00000568693	SRY	Q05066	204 aa		7.38	□□□□□ -1.23
E2F4-211	ENST00000568693	ZNF91	Q05481	1191 aa		7.38	□□□□□ -1.23
E2F4-211	ENST00000568693	NFATC3	Q12968	1075 aa		7.38	□□□□□ -1.23
E2F4-211	ENST00000568693	ITGAD	Q13349	1161 aa		7.38	□□□□□ -1.23
E2F4-211	ENST00000568693	BLMH	Q13867	455 aa		7.38	□□□□□ -1.23
E2F4-211	ENST00000568693	C1D	Q13901	141 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
E2F4-211	ENST00000568693	MELK	Q14680	651 aa		7.38	□□□□□ -1.23
E2F4-211	ENST00000568693	SLC17A1	Q14916	467 aa		7.38	□□□□□ -1.23
E2F4-211	ENST00000568693	C3AR1	Q16581	482 aa		7.38	□□□□□ -1.23
E2F4-211	ENST00000568693	SMN1	Q16637	294 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
E2F4-211	ENST00000568693	KRTCAP3	Q53RY4	240 aa		7.38	□□□□□ -1.23
E2F4-211	ENST00000568693	ZNF324B	Q6AW86	544 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
E2F4-211	ENST00000568693	PLBD1	Q6P4A8	553 aa		7.38	□□□□□ -1.23
E2F4-211	ENST00000568693	LEG1	Q6P5S2	330 aa		7.38	□□□□□ -1.23
E2F4-211	ENST00000568693	FCRLA	Q7L513	359 aa		7.38	□□□□□ -1.23
E2F4-211	ENST00000568693	BCDIN3D	Q7Z5W3	292 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
E2F4-211	ENST00000568693	CPO	Q8IVL8	374 aa		7.38	□□□□□ -1.23
E2F4-211	ENST00000568693	GHDC	Q8N2G8	530 aa		7.38	□□□□□ -1.23
E2F4-211	ENST00000568693	TEX19	Q8NA77	164 aa		7.38	□□□□□ -1.23

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.4 ms