RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564091.6

CLN3-211, Transcript of CLN3, battenin, humanhuman

TSL 5

Gene CLN3, Length 790 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3-211ENST00000564091 CORINQ9Y5Q5 1042 aa14.51□□□□□ -0.09
CLN3-211ENST00000564091 A0A0B4J2E0 115 aa14.5□□□□□ -0.09
CLN3-211ENST00000564091 A0A1B0GX12 115 aa14.5□□□□□ -0.09
CLN3-211ENST00000564091 ZNF726A6NNF4 738 aa14.5□□□□□ -0.09
CLN3-211ENST00000564091 PATE4P0C8F1 98 aa14.5□□□□□ -0.09
CLN3-211ENST00000564091 AHCYP23526 432 aa14.5□□□□□ -0.09
CLN3-211ENST00000564091 GLRXP35754 106 aa14.5□□□□□ -0.09
CLN3-211ENST00000564091 EVX1P49640 407 aa14.5□□□□□ -0.09
CLN3-211ENST00000564091 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
CLN3-211ENST00000564091 RAB1AP62820 205 aa14.5□□□□□ -0.09
CLN3-211ENST00000564091 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CLN3-211ENST00000564091 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
CLN3-211ENST00000564091 FAM91A1Q658Y4 838 aa14.5□□□□□ -0.09
CLN3-211ENST00000564091 REEP3Q6NUK4 255 aa14.5□□□□□ -0.09
CLN3-211ENST00000564091 EPGNQ6UW88 154 aa14.5□□□□□ -0.09
CLN3-211ENST00000564091 KRT73Q86Y46 540 aa14.5□□□□□ -0.09
CLN3-211ENST00000564091 FUNDC1Q8IVP5 155 aa14.5□□□□□ -0.09
CLN3-211ENST00000564091 C10orf53Q8N6V4 93 aa14.5□□□□□ -0.09
CLN3-211ENST00000564091 EPYCQ99645 322 aa14.5□□□□□ -0.09
CLN3-211ENST00000564091 ASPNQ9BXN1 380 aa14.5□□□□□ -0.09
CLN3-211ENST00000564091 ULBP2Q9BZM5 246 aa14.5□□□□□ -0.09
CLN3-211ENST00000564091 TMEM27Q9HBJ8 222 aa14.5□□□□□ -0.09
CLN3-211ENST00000564091 LPAR2Q9HBW0 351 aa14.5□□□□□ -0.09
CLN3-211ENST00000564091 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa14.5□□□□□ -0.09
CLN3-211ENST00000564091 ZNF224Q9NZL3 707 aa14.5□□□□□ -0.09
CLN3-211ENST00000564091 SELENONQ9NZV5 590 aa14.5□□□□□ -0.09
CLN3-211ENST00000564091 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CLN3-211ENST00000564091 SPEF1Q9Y4P9 236 aa14.5□□□□□ -0.09
CLN3-211ENST00000564091 NOX1Q9Y5S8 564 aa14.5□□□□□ -0.09
CLN3-211ENST00000564091 USH1CQ9Y6N9 552 aa14.5□□□□□ -0.09
CLN3-211ENST00000564091 WNT9BO14905 357 aa14.49□□□□□ -0.09
CLN3-211ENST00000564091 RAB36O95755 333 aa14.49□□□□□ -0.09
CLN3-211ENST00000564091 AQP1P29972 269 aa14.49□□□□□ -0.09
CLN3-211ENST00000564091 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
CLN3-211ENST00000564091 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
CLN3-211ENST00000564091 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
CLN3-211ENST00000564091 NCALDP61601 193 aa14.49□□□□□ -0.09
CLN3-211ENST00000564091 PUDPQ08623 228 aa14.49□□□□□ -0.09
CLN3-211ENST00000564091 RAB39AQ14964 217 aa14.49□□□□□ -0.09
CLN3-211ENST00000564091 PAGE3Q5JUK9 113 aa14.49□□□□□ -0.09
CLN3-211ENST00000564091 LRIF1Q5T3J3 769 aa14.49□□□□□ -0.09
CLN3-211ENST00000564091 ZNF627Q7L945 461 aa14.49□□□□□ -0.09
CLN3-211ENST00000564091 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
CLN3-211ENST00000564091 SCAIQ8N9R8 606 aa14.49□□□□□ -0.09
CLN3-211ENST00000564091 OR6S1Q8NH40 331 aa14.49□□□□□ -0.09
CLN3-211ENST00000564091 CLDND2Q8NHS1 167 aa14.49□□□□□ -0.09
CLN3-211ENST00000564091 FGFBP3Q8TAT2 258 aa14.49□□□□□ -0.09
CLN3-211ENST00000564091 FOXB1Q99853 325 aa14.49□□□□□ -0.09
CLN3-211ENST00000564091 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa14.49□□□□□ -0.09
CLN3-211ENST00000564091 MS4A5Q9H3V2 200 aa14.49□□□□□ -0.09
CLN3-211ENST00000564091 IKZF5Q9H5V7 419 aa14.49□□□□□ -0.09
CLN3-211ENST00000564091 OCEL1Q9H607 264 aa14.49□□□□□ -0.09
CLN3-211ENST00000564091 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
CLN3-211ENST00000564091 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa14.49□□□□□ -0.09
CLN3-211ENST00000564091 VAPAQ9P0L0 249 aa14.49□□□□□ -0.09
CLN3-211ENST00000564091 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
CLN3-211ENST00000564091 METRNQ9UJH8 293 aa14.49□□□□□ -0.09
CLN3-211ENST00000564091 B4DSR2 109 aa14.48□□□□□ -0.09
CLN3-211ENST00000564091 FAM157AC9JC47 383 aa14.48□□□□□ -0.09
CLN3-211ENST00000564091 PLPP3O14495 311 aa14.48□□□□□ -0.09
CLN3-211ENST00000564091 VENTXO95231 258 aa14.48□□□□□ -0.09
CLN3-211ENST00000564091 SLC18A1P54219 525 aa14.48□□□□□ -0.09
CLN3-211ENST00000564091 CDH12P55289 794 aa14.48□□□□□ -0.09
CLN3-211ENST00000564091 STX1BP61266 288 aa14.48□□□□□ -0.09
CLN3-211ENST00000564091 GALK2Q01415 458 aa14.48□□□□□ -0.09
CLN3-211ENST00000564091 SCARB2Q14108 478 aa14.48□□□□□ -0.09
CLN3-211ENST00000564091 FXNQ16595 210 aa14.48□□□□□ -0.09
CLN3-211ENST00000564091 UGT2A3Q6UWM9 527 aa14.48□□□□□ -0.09
CLN3-211ENST00000564091 RDH5Q92781 318 aa14.48□□□□□ -0.09
CLN3-211ENST00000564091 YIPF5Q969M3 257 aa14.48□□□□□ -0.09
CLN3-211ENST00000564091 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
CLN3-211ENST00000564091 TREM2Q9NZC2 230 aa14.48□□□□□ -0.09
CLN3-211ENST00000564091 DUSP13Q9UII6 198 aa14.48□□□□□ -0.09
CLN3-211ENST00000564091 SLC13A4Q9UKG4 626 aa14.48□□□□□ -0.09
CLN3-211ENST00000564091 C11orf98E9PRG8 122 aa14.47□□□□□ -0.09
CLN3-211ENST00000564091 NAT2P11245 290 aa14.47□□□□□ -0.09
CLN3-211ENST00000564091 CSNK1A1P48729 337 aa14.47□□□□□ -0.09
CLN3-211ENST00000564091 ALKBH6Q3KRA9 238 aa14.47□□□□□ -0.09
CLN3-211ENST00000564091 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa14.47□□□□□ -0.09
CLN3-211ENST00000564091 WDR88Q6ZMY6 472 aa14.47□□□□□ -0.09
CLN3-211ENST00000564091 PXKQ7Z7A4 578 aa14.47□□□□□ -0.09
CLN3-211ENST00000564091 GLCCI1Q86VQ1 547 aa14.47□□□□□ -0.09
CLN3-211ENST00000564091 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
CLN3-211ENST00000564091 SKA3Q8IX90 412 aa14.47□□□□□ -0.09
CLN3-211ENST00000564091 SMYD1Q8NB12 490 aa14.47□□□□□ -0.09
CLN3-211ENST00000564091 SPDL1Q96EA4 605 aa14.47□□□□□ -0.09
CLN3-211ENST00000564091 RACGAP1Q9H0H5 632 aa14.47□□□□□ -0.09
CLN3-211ENST00000564091 HIF1ANQ9NWT6 349 aa14.47□□□□□ -0.09
CLN3-211ENST00000564091 CCDC167Q9P0B6 97 aa14.47□□□□□ -0.09
CLN3-211ENST00000564091 A0A1W2PPW3 197 aa14.46□□□□□ -0.09
CLN3-211ENST00000564091 PRORSD1PA6NEY8 169 aa14.46□□□□□ -0.09
CLN3-211ENST00000564091 M0R3H8 397 aa14.46□□□□□ -0.09
CLN3-211ENST00000564091 PPIHO43447 177 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
CLN3-211ENST00000564091 NCR1O76036 304 aa14.46□□□□□ -0.09
CLN3-211ENST00000564091 UBL3O95164 117 aa14.46□□□□□ -0.09
CLN3-211ENST00000564091 ADORA3P0DMS8 318 aa14.46□□□□□ -0.09
CLN3-211ENST00000564091 SAGP10523 405 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
CLN3-211ENST00000564091 PCMT1P22061 227 aa14.46□□□□□ -0.09
CLN3-211ENST00000564091 ACHEP22303 614 aa14.46□□□□□ -0.09
CLN3-211ENST00000564091 SLC6A2P23975 617 aa14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.8 ms