RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557758.1

PRMT5-227, Transcript of protein arginine methyltransferase 5, human

TSL 3

Gene PRMT5, Length 597 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRMT5-227	ENST00000557758	SEC14L4	Q9UDX3	406 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PRMT5-227	ENST00000557758	MMP24	Q9Y5R2	645 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PRMT5-227	ENST00000557758	FER1L5	A0AVI2	2057 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PRMT5-227	ENST00000557758	SCN5A	Q14524	2016 aa		4.65	□□□□□ -1.66
PRMT5-227	ENST00000557758	TRBV5-4	A0A0C4DH59	114 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758		A0A1B0GUA9	196 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	CCDC182	A6NF36	153 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	PRAC2	D3DTV9	90 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	FBP2	O00757	339 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	PSTPIP1	O43586	416 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	FAM189A1	O60320	539 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	HCN1	O60741	890 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	NADK	O95544	446 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	ACAA1	P09110	424 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	MYL2	P10916	166 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	CD52	P31358	61 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	OPRD1	P41143	372 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	XCR1	P46094	333 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	C1QTNF8	P60827	252 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	RAD51	Q06609	339 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	MGAT3	Q09327	533 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	ST3GAL3	Q11203	375 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	ANGPT1	Q15389	498 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	SRSF7	Q16629	238 aa	Known RBP eCLIP	4.65	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	DCST2	Q5T1A1	773 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	CCDC137	Q6PK04	289 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	ASCL4	Q6XD76	172 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	RBMS3	Q6XE24	437 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	CREB3L2	Q70SY1	520 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	CHMP1B	Q7LBR1	199 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	SLC16A14	Q7RTX9	510 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	PEX26	Q7Z412	305 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	PTAR1	Q7Z6K3	402 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	SLC47A2	Q86VL8	602 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	ST13P4	Q8IZP2	240 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	PELI3	Q8N2H9	469 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	METTL27	Q8N6F8	245 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	C8orf31	Q8N9H6	132 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	LRRC75A	Q8NAA5	344 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	ZNRF1	Q8ND25	227 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	FBXO36	Q8NEA4	188 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	SETD7	Q8WTS6	366 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	SECTM1	Q8WVN6	248 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	CACNG8	Q8WXS5	425 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	TRNT1	Q96Q11	434 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	OR5B2	Q96R09	309 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	TMEM246	Q9BRR3	403 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	ZNF670	Q9BS34	389 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	HINT2	Q9BX68	163 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	TM6SF2	Q9BZW4	377 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	CXCL16	Q9H2A7	254 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	OR51M1	Q9H341	326 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	ZNF334	Q9HCZ1	680 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	ACP6	Q9NPH0	428 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	IL1RAP	Q9NPH3	570 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	BARX2	Q9UMQ3	279 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	RBMX2	Q9Y388	322 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	COQ4	Q9Y3A0	265 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	SAR1B	Q9Y6B6	198 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	NCAN	O14594	1321 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	SCN1A	P35498	2009 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	TRBV7-9	A0A0J9YWB2	115 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	PLSCR5	A0PG75	271 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	PDZK1P1	A8MUH7	402 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	C11orf98	E9PRG8	122 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	FCN1	O00602	326 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	SOCS2	O14508	198 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	RAB29	O14966	203 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	TYROBP	O43914	113 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	AIRE	O43918	545 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	HUS1	O60921	280 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	TRMU	O75648	421 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	CDC123	O75794	336 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	LCA5L	O95447	670 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	ZBTB11	O95625	1053 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	TOMM40	O96008	361 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	TCP1	P17987	556 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	BCKDHB	P21953	392 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	CCNO	P22674	350 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	FCGR2C	P31995	323 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	SPAM1	P38567	509 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	CRYBA2	P53672	197 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	IST1	P53990	364 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	TMEM50B	P56557	158 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	ZNF33B	Q06732	778 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	SRSF4	Q08170	494 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	C2orf54	Q08AI8	447 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	MLF2	Q15773	248 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	DUSP7	Q16829	419 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	SEL1L2	Q5TEA6	688 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	C9orf135	Q5VTT2	229 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	REEP3	Q6NUK4	255 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	CRIP3	Q6Q6R5	217 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	APOOL	Q6UXV4	268 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	LRRC74B	Q6ZQY2	392 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	ASCL5	Q7RTU5	278 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	MTERF4	Q7Z6M4	381 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	IFNE	Q86WN2	208 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	GPR65	Q8IYL9	337 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PRMT5-227	ENST00000557758	RNF10	Q8N5U6	811 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.3 ms