RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-231	ENST00000552222	TTC33	Q6PID6	262 aa	Predicted RBP	12.11	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	OR6K3	Q8NGY3	331 aa		12.11	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	OR6S1	Q8NH40	331 aa		12.11	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	MFSD8	Q8NHS3	518 aa		12.11	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	RNF128	Q8TEB7	428 aa		12.11	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	C10orf105	Q8TEF2	133 aa		12.11	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	TMEM255B	Q8WV15	326 aa		12.11	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	CANT1	Q8WVQ1	401 aa		12.11	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	TAAR8	Q969N4	342 aa		12.11	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	DHRS1	Q96LJ7	313 aa		12.11	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	EPYC	Q99645	322 aa		12.11	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	SLC19A3	Q9BZV2	496 aa		12.11	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	ANKRD19P	Q9H560	264 aa		12.11	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	BARX1	Q9HBU1	254 aa	Predicted RBP	12.11	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	RHCG	Q9UBD6	479 aa		12.11	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222		A0A1W2PRQ8	180 aa		12.1	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	DHRS12	A0PJE2	317 aa		12.1	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	OR2T1	O43869	369 aa		12.1	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	EIF1B	O60739	113 aa	Known RBP	12.1	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	DIRAS1	O95057	198 aa		12.1	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	PLG	P00747	810 aa	Predicted RBP	12.1	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	H1F0	P07305	194 aa	Known RBP	12.1	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	UMPS	P11172	480 aa		12.1	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	HOXB6	P17509	224 aa	Known RBP	12.1	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	ENPP1	P22413	925 aa		12.1	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	USF1	P22415	310 aa	Predicted RBP	12.1	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	UGT2B15	P54855	530 aa		12.1	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	CHRNB3	Q05901	458 aa		12.1	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	DGCR6	Q14129	220 aa		12.1	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	OR7A5	Q15622	319 aa		12.1	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	CR1L	Q2VPA4	569 aa		12.1	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	C1orf146	Q5VVC0	180 aa		12.1	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	C11orf71	Q6IPW1	123 aa		12.1	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	FAM166A	Q6J272	317 aa		12.1	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	PAQR6	Q6TCH4	344 aa		12.1	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	FCRLA	Q7L513	359 aa		12.1	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	NUFIP2	Q7Z417	695 aa	Known RBP	12.1	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	DTX2	Q86UW9	622 aa		12.1	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	SPATA24	Q86W54	205 aa		12.1	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	DEPDC4	Q8N2C3	294 aa		12.1	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	SLC43A2	Q8N370	569 aa		12.1	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	TMEM239	Q8WW34	195 aa		12.1	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	FAM168A	Q92567	244 aa		12.1	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	ZHX1-C8orf76	Q96EF9	292 aa		12.1	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	ZNF347	Q96SE7	839 aa		12.1	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	TAPBPL	Q9BX59	468 aa		12.1	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	PRRG4	Q9BZD6	226 aa		12.1	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	MEPE	Q9NQ76	525 aa	Predicted RBP	12.1	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	NPAP1	Q9NZP6	1156 aa		12.1	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	GPR52	Q9Y2T5	361 aa		12.1	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	EMC9	Q9Y3B6	208 aa		12.1	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222		A0A087WUU8	490 aa		12.09	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	IGHV3-15	A0A0B4J1V0	119 aa		12.09	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	IGHV4-61	A0A0C4DH41	118 aa		12.09	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	ZNF814	B7Z6K7	855 aa		12.09	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222		E7EQL1	145 aa		12.09	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	TCF21	O43680	179 aa		12.09	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	CYTIP	O60759	359 aa		12.09	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	CIB2	O75838	187 aa		12.09	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	IGF2	P01344	180 aa		12.09	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	BGLAP	P02818	100 aa		12.09	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	MT-ND1	P03886	318 aa		12.09	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	RAP2A	P10114	183 aa		12.09	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	PSMB1	P20618	241 aa	Known RBP	12.09	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	EDNRA	P25101	427 aa		12.09	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	CDH11	P55287	796 aa		12.09	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	CTBP2	P56545	445 aa		12.09	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	SMIM11A	P58511	58 aa		12.09	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	RNPS1	Q15287	305 aa	Known RBP	12.09	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	ABLIM2	Q6H8Q1	611 aa		12.09	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	B3GLCT	Q6Y288	498 aa		12.09	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	PAPD5	Q8NDF8	572 aa	Known RBP	12.09	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	SLC7A13	Q8TCU3	470 aa		12.09	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	ACOT11	Q8WXI4	607 aa	Predicted RBP	12.09	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	SLC25A36	Q96CQ1	311 aa		12.09	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	FUZ	Q9BT04	418 aa		12.09	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	CHID1	Q9BWS9	393 aa		12.09	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	GLRX2	Q9NS18	164 aa		12.09	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	ING1	Q9UK53	422 aa	Predicted RBP	12.09	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	AURKC	Q9UQB9	309 aa		12.09	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	MED31	Q9Y3C7	131 aa		12.09	□□□□□ -0.47
CS-231	ENST00000552222	AQP7P3	A6NL99	342 aa		12.08	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	KPNA4	O00629	521 aa	Predicted RBP	12.08	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	SS18L1	O75177	396 aa	Predicted RBP	12.08	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	AKR7A3	O95154	331 aa		12.08	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	MT-ATP6	P00846	226 aa		12.08	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	TGFA	P01135	160 aa		12.08	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	ERF	P50548	548 aa		12.08	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	P2RY4	P51582	365 aa		12.08	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	RASGEF1B	Q0VAM2	473 aa		12.08	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	CCNI	Q14094	377 aa		12.08	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	MFSD13A	Q14CX5	517 aa		12.08	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	PDK3	Q15120	406 aa		12.08	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	ZNF74	Q16587	644 aa		12.08	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	GTF2IRD2B	Q6EKJ0	949 aa		12.08	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	GTF2IRD2	Q86UP8	949 aa		12.08	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	CCDC103	Q8IW40	242 aa		12.08	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	RNF113B	Q8IZP6	322 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	GABRG1	Q8N1C3	465 aa		12.08	□□□□□ -0.48
CS-231	ENST00000552222	TMEM99	Q8N816	258 aa		12.08	□□□□□ -0.48

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