RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545279.5

SMAD5-211, Transcript of SMAD family member 5, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMAD5, Length 7,012 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5-211ENST00000545279 PAQR6Q6TCH4 344 aa5.95□□□□□ -1.46
SMAD5-211ENST00000545279 LRRC18Q8N456 261 aa5.95□□□□□ -1.46
SMAD5-211ENST00000545279 RNF170Q96K19 258 aa5.95□□□□□ -1.46
SMAD5-211ENST00000545279 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
SMAD5-211ENST00000545279 SLC22A11Q9NSA0 550 aa5.95□□□□□ -1.46
SMAD5-211ENST00000545279 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa5.95□□□□□ -1.46
SMAD5-211ENST00000545279 RNF150Q9ULK6 438 aa5.95□□□□□ -1.46
SMAD5-211ENST00000545279 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
SMAD5-211ENST00000545279 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa5.95□□□□□ -1.46
SMAD5-211ENST00000545279 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa5.95□□□□□ -1.46
SMAD5-211ENST00000545279 ALG1L2C9J202 215 aa5.95□□□□□ -1.46
SMAD5-211ENST00000545279 ENSAO43768 121 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
SMAD5-211ENST00000545279 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
SMAD5-211ENST00000545279 OR7A10O76100 309 aa5.95□□□□□ -1.46
SMAD5-211ENST00000545279 GOSR1O95249 250 aa5.95□□□□□ -1.46
SMAD5-211ENST00000545279 OSMP13725 252 aa5.95□□□□□ -1.46
SMAD5-211ENST00000545279 GLRA1P23415 457 aa5.95□□□□□ -1.46
SMAD5-211ENST00000545279 GZMKP49863 264 aa5.95□□□□□ -1.46
SMAD5-211ENST00000545279 DUSP8Q13202 625 aa5.95□□□□□ -1.46
SMAD5-211ENST00000545279 SYPL1Q16563 259 aa5.95□□□□□ -1.46
SMAD5-211ENST00000545279 SWI5Q1ZZU3 235 aa5.95□□□□□ -1.46
SMAD5-211ENST00000545279 CEACAM16Q2WEN9 425 aa5.95□□□□□ -1.46
SMAD5-211ENST00000545279 ENTPD8Q5MY95 495 aa5.95□□□□□ -1.46
SMAD5-211ENST00000545279 ANKRD34AQ69YU3 496 aa5.95□□□□□ -1.46
SMAD5-211ENST00000545279 TRIM46Q7Z4K8 759 aa5.95□□□□□ -1.46
SMAD5-211ENST00000545279 ROBO4Q8WZ75 1007 aa5.95□□□□□ -1.46
SMAD5-211ENST00000545279 SPIN2AQ99865 258 aa5.95□□□□□ -1.46
SMAD5-211ENST00000545279 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa5.95□□□□□ -1.46
SMAD5-211ENST00000545279 NAV1Q8NEY1 1877 aa5.95□□□□□ -1.46
SMAD5-211ENST00000545279 AGAP5A6NIR3 686 aa5.95□□□□□ -1.46
SMAD5-211ENST00000545279 F2RL2O00254 374 aa5.95□□□□□ -1.46
SMAD5-211ENST00000545279 PLOD2O00469 737 aa5.95□□□□□ -1.46
SMAD5-211ENST00000545279 SOX14O95416 240 aa5.95□□□□□ -1.46
SMAD5-211ENST00000545279 SERPINE2P07093 398 aa5.95□□□□□ -1.46
SMAD5-211ENST00000545279 ITGAMP11215 1152 aa5.95□□□□□ -1.46
SMAD5-211ENST00000545279 PSKH1P11801 424 aa5.95□□□□□ -1.46
SMAD5-211ENST00000545279 TRIM16LQ309B1 348 aa5.95□□□□□ -1.46
SMAD5-211ENST00000545279 VASNQ6EMK4 673 aa5.95□□□□□ -1.46
SMAD5-211ENST00000545279 SPINK14Q6IE38 97 aa5.95□□□□□ -1.46
SMAD5-211ENST00000545279 DOK3Q7L591 496 aa5.95□□□□□ -1.46
SMAD5-211ENST00000545279 FAM214BQ7L5A3 538 aa5.95□□□□□ -1.46
SMAD5-211ENST00000545279 SSX6Q7RTT6 188 aa5.95□□□□□ -1.46
SMAD5-211ENST00000545279 VRK2Q86Y07 508 aa5.95□□□□□ -1.46
SMAD5-211ENST00000545279 OR6V1Q8N148 313 aa5.95□□□□□ -1.46
SMAD5-211ENST00000545279 OR5D16Q8NGK9 328 aa5.95□□□□□ -1.46
SMAD5-211ENST00000545279 NEIL3Q8TAT5 605 aa5.95□□□□□ -1.46
SMAD5-211ENST00000545279 HES4Q9HCC6 221 aa5.95□□□□□ -1.46
SMAD5-211ENST00000545279 RAB18Q9NP72 206 aa5.95□□□□□ -1.46
SMAD5-211ENST00000545279 C15orf41Q9Y2V0 281 aa5.95□□□□□ -1.46
SMAD5-211ENST00000545279 A0A0G2JMP0 313 aa5.95□□□□□ -1.46
SMAD5-211ENST00000545279 ZNF254O75437 659 aa5.95□□□□□ -1.46
SMAD5-211ENST00000545279 TFPTP0C1Z6 253 aa5.95□□□□□ -1.46
SMAD5-211ENST00000545279 APEHP13798 732 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
SMAD5-211ENST00000545279 AMY2BP19961 511 aa5.95□□□□□ -1.46
SMAD5-211ENST00000545279 LAP3P28838 519 aa5.95□□□□□ -1.46
SMAD5-211ENST00000545279 GIPRP48546 466 aa5.95□□□□□ -1.46
SMAD5-211ENST00000545279 GGTLC2Q14390 218 aa5.95□□□□□ -1.46
SMAD5-211ENST00000545279 BCL2A1Q16548 175 aa5.95□□□□□ -1.46
SMAD5-211ENST00000545279 GLRX5Q86SX6 157 aa5.95□□□□□ -1.46
SMAD5-211ENST00000545279 ARMC10Q8N2F6 343 aa5.95□□□□□ -1.46
SMAD5-211ENST00000545279 OR4M2Q8NGB6 313 aa5.95□□□□□ -1.46
SMAD5-211ENST00000545279 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
SMAD5-211ENST00000545279 SLC35A4Q96G79 324 aa5.95□□□□□ -1.46
SMAD5-211ENST00000545279 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
SMAD5-211ENST00000545279 SESN1Q9Y6P5 492 aa5.95□□□□□ -1.46
SMAD5-211ENST00000545279 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa5.95□□□□□ -1.46
SMAD5-211ENST00000545279 M0R3H8 397 aa5.95□□□□□ -1.46
SMAD5-211ENST00000545279 GPRIN2O60269 458 aa5.95□□□□□ -1.46
SMAD5-211ENST00000545279 IGHV3-9P01782 118 aa5.95□□□□□ -1.46
SMAD5-211ENST00000545279 OR1E2P47887 323 aa5.95□□□□□ -1.46
SMAD5-211ENST00000545279 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
SMAD5-211ENST00000545279 SHBQ15464 509 aa5.95□□□□□ -1.46
SMAD5-211ENST00000545279 NDUFA5Q16718 116 aa5.95□□□□□ -1.46
SMAD5-211ENST00000545279 ZNF425Q6IV72 752 aa5.95□□□□□ -1.46
SMAD5-211ENST00000545279 LINGO2Q7L985 606 aa5.95□□□□□ -1.46
SMAD5-211ENST00000545279 ZNF584Q8IVC4 421 aa5.95□□□□□ -1.46
SMAD5-211ENST00000545279 MED30Q96HR3 178 aa5.95□□□□□ -1.46
SMAD5-211ENST00000545279 NODALQ96S42 347 aa5.95□□□□□ -1.46
SMAD5-211ENST00000545279 ALG8Q9BVK2 526 aa5.95□□□□□ -1.46
SMAD5-211ENST00000545279 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa5.95□□□□□ -1.46
SMAD5-211ENST00000545279 KLHL31Q9H511 634 aa5.95□□□□□ -1.46
SMAD5-211ENST00000545279 DAPK2Q9UIK4 370 aa5.95□□□□□ -1.46
SMAD5-211ENST00000545279 RNF24Q9Y225 148 aa5.95□□□□□ -1.46
SMAD5-211ENST00000545279 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa5.94□□□□□ -1.46
SMAD5-211ENST00000545279 ST8SIA5O15466 376 aa5.94□□□□□ -1.46
SMAD5-211ENST00000545279 SBK2P0C263 348 aa5.94□□□□□ -1.46
SMAD5-211ENST00000545279 TGM4P49221 684 aa5.94□□□□□ -1.46
SMAD5-211ENST00000545279 CBLBQ13191 982 aa5.94□□□□□ -1.46
SMAD5-211ENST00000545279 GPR157Q5UAW9 335 aa5.94□□□□□ -1.46
SMAD5-211ENST00000545279 SLC16A11Q8NCK7 471 aa5.94□□□□□ -1.46
SMAD5-211ENST00000545279 OR9I1Q8NGQ6 314 aa5.94□□□□□ -1.46
SMAD5-211ENST00000545279 WDR20Q8TBZ3 569 aa5.94□□□□□ -1.46
SMAD5-211ENST00000545279 ARSGQ96EG1 525 aa5.94□□□□□ -1.46
SMAD5-211ENST00000545279 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
SMAD5-211ENST00000545279 SAMD8Q96LT4 415 aa5.94□□□□□ -1.46
SMAD5-211ENST00000545279 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
SMAD5-211ENST00000545279 TGIF2Q9GZN2 237 aa5.94□□□□□ -1.46
SMAD5-211ENST00000545279 HSD3B7Q9H2F3 369 aa5.94□□□□□ -1.46
SMAD5-211ENST00000545279 SIAEQ9HAT2 523 aa5.94□□□□□ -1.46
SMAD5-211ENST00000545279 H7C2Y5 167 aa5.94□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms