RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517083.1

RNU6-548P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 548, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-548P, Length 115 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-548P-201ENST00000517083 ADPRMQ3LIE5 342 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF718Q3SXZ3 478 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF404Q494X3 552 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 TMEM35AQ53FP2 167 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 RUNDC3AQ59EK9 446 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 PCID2Q5JVF3 399 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 RESP18Q5W5W9 173 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR4C11Q6IEV9 310 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 MRNIPQ6NTE8 343 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 GSG1LQ6UXU4 331 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 C18orf65Q6ZTR6 163 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 MICALCLQ6ZW33 695 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZER1Q7Z7L7 766 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 LYG2Q86SG7 212 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF329Q86UD4 541 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 GPAT4Q86UL3 456 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 IGFN1Q86VF2 1251 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 NR2C2APQ86WQ0 139 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 MYO1HQ8N1T3 1032 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 MPP5Q8N3R9 675 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 COMMD1Q8N668 190 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 POM121L12Q8N7R1 296 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR2Z1Q8NG97 314 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR4N2Q8NGD1 307 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR52K1Q8NGK4 314 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR1J2Q8NGS2 313 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR1J1Q8NGS3 322 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR56A3Q8NH54 315 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 UBALD1Q8TB05 177 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 TMEM255BQ8WV15 326 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 ST8SIA4Q92187 359 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 P3H4Q92791 437 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 RGMAQ96B86 450 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 KLHL29Q96CT2 875 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 LYZL4Q96KX0 146 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 SAMD8Q96LT4 415 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 GPR78Q96P69 363 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 GBP4Q96PP9 640 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 RNF157Q96PX1 679 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 FRG2BQ96QU4 278 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 PCDHB18PQ96TA0 734 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 EPYCQ99645 322 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 ARHGDIGQ99819 225 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 AGPAT1Q99943 283 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 EGFL8Q99944 293 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 RSRP1Q9BUV0 290 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 RABEP2Q9H5N1 569 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 REEP1Q9H902 201 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 PARVBQ9HBI1 364 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 SMURF1Q9HCE7 757 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 Q9N2J8 555 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 SAYSD1Q9NPB0 183 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 DCAF16Q9NXF7 216 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 TAS2R9Q9NYW1 312 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 FBXO5Q9UKT4 447 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 PSME2Q9UL46 239 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 CTNND2Q9UQB3 1225 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 RCE1Q9Y256 329 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 CARD8Q9Y2G2 431 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 DHRS7Q9Y394 339 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 TNXBP22105 4242 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 A0A1B0GVL5 298 aa1.48□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 CTAGE15A4D2H0 777 aa1.48□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 CTAGE9A4FU28 777 aa1.48□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 MROH6A6NGR9 719 aa1.48□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa1.48□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 H0Y980 276 aa1.48□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 H7C0C1 242 aa1.48□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP1.48□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 PDPK1O15530 556 aa1.48□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 ADAM20O43506 726 aa1.48□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 DNPH1O43598 174 aa1.48□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP1.48□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 GUCY1B2O75343 617 aa1.48□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 ENTPD5O75356 428 aa1.48□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 SLC43A1O75387 559 aa1.48□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 TIPRLO75663 272 aa1.48□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 WDR47O94967 919 aa1.48□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 UBL3O95164 117 aa1.48□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP1.48□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 TGFB1P01137 390 aa1.48□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 PTHP01270 115 aa1.48□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 IGHV3-13P01766 116 aa1.48□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 HLA-HP01893 362 aa1.48□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 ATP1B1P05026 303 aa1.48□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.1 ms