RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513284.5

RNF4-218, Transcript of ring finger protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene RNF4, Length 517 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF4-218ENST00000513284 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 PIGFQ07326 219 aa9.49□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 BNIP2Q12982 314 aa9.49□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 STX3Q13277 289 aa9.49□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 CEACAM16Q2WEN9 425 aa9.49□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 LIN52Q52LA3 116 aa9.49□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 ZNF621Q6ZSS3 439 aa9.49□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 OR52E6Q96RD3 313 aa9.49□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 SLC38A1Q9H2H9 487 aa9.49□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 MEAF6Q9HAF1 191 aa9.49□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 HAO1Q9UJM8 370 aa9.49□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 ZNF232Q9UNY5 417 aa9.49□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 PPIAL4EA0A075B759 164 aa9.48□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa9.48□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 TRPC5OSA6NMA1 111 aa9.48□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 PPIAL4DF5H284 164 aa9.48□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 RFXANKO14593 260 aa9.48□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 ANP32DO95626 131 aa9.48□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 KNG1P01042 644 aa9.48□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 PPIAL4FP0DN26 164 aa9.48□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 RBMXP38159 391 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 CRISP3P54108 245 aa9.48□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 CLDN17P56750 224 aa9.48□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 EPS8Q12929 822 aa9.48□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 MPP2Q14168 576 aa9.48□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 SYPL1Q16563 259 aa9.48□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 WBP2NLQ6ICG8 309 aa9.48□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 ANKFN1Q8N957 763 aa9.48□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 C20orf27Q9GZN8 174 aa9.48□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 RMND5AQ9H871 391 aa9.48□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 KCNK9Q9NPC2 374 aa9.48□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 AIG1Q9NVV5 245 aa9.48□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 ADPRHL2Q9NX46 363 aa9.48□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 TAAR3PQ9P1P4 343 aa9.48□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 DSPPQ9NZW4 1301 aa9.48□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa9.47□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 FAM181BA6NEQ2 426 aa9.47□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 A8MVM7 634 aa9.47□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 M0QZ24 198 aa9.47□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 NPIPB7O75200 414 aa9.47□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 AHSA1O95433 338 aa9.47□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 TSPAN15O95858 294 aa9.47□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 GPANK1O95872 356 aa9.47□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 IL6P05231 212 aa9.47□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 CHRM4P08173 479 aa9.47□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 SELEP16581 610 aa9.47□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 RAD52P43351 418 aa9.47□□□□□ -0.89
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RNF4-218ENST00000513284 BEAN1Q3B7T3 259 aa9.47□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 HHATQ5VTY9 493 aa9.47□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa9.47□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa9.47□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 USP51Q70EK9 711 aa9.47□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 SPATC1Q76KD6 591 aa9.47□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 CCDC36Q8IYA8 594 aa9.47□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 CADM2Q8N3J6 435 aa9.47□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 OR52P1PQ8NH57 321 aa9.47□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 FGFBP3Q8TAT2 258 aa9.47□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 CENPHQ9H3R5 247 aa9.47□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa9.47□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 B3GAT1Q9P2W7 334 aa9.47□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 SEC14L4Q9UDX3 406 aa9.47□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 RASD1Q9Y272 281 aa9.47□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 IFT52Q9Y366 437 aa9.47□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 COL7A1Q02388 2944 aa9.46□□□□□ -0.89
RNF4-218ENST00000513284 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa9.46□□□□□ -0.9
RNF4-218ENST00000513284 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa9.46□□□□□ -0.9
RNF4-218ENST00000513284 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
RNF4-218ENST00000513284 FTCDNL1E5RQL4 147 aa9.46□□□□□ -0.9
RNF4-218ENST00000513284 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
RNF4-218ENST00000513284 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa9.46□□□□□ -0.9
RNF4-218ENST00000513284 VSIG8P0DPA2 414 aa9.46□□□□□ -0.9
RNF4-218ENST00000513284 CD79AP11912 226 aa9.46□□□□□ -0.9
RNF4-218ENST00000513284 IDO1P14902 403 aa9.46□□□□□ -0.9
RNF4-218ENST00000513284 BGNP21810 368 aa9.46□□□□□ -0.9
RNF4-218ENST00000513284 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
RNF4-218ENST00000513284 CRATP43155 626 aa9.46□□□□□ -0.9
RNF4-218ENST00000513284 CAPZA2P47755 286 aa9.46□□□□□ -0.9
RNF4-218ENST00000513284 ATP4BP51164 291 aa9.46□□□□□ -0.9
RNF4-218ENST00000513284 NME5P56597 212 aa9.46□□□□□ -0.9
RNF4-218ENST00000513284 DSTNP60981 165 aa9.46□□□□□ -0.9
RNF4-218ENST00000513284 UFM1P61960 85 aa9.46□□□□□ -0.9
RNF4-218ENST00000513284 GSG1Q2KHT4 349 aa9.46□□□□□ -0.9
RNF4-218ENST00000513284 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
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