RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511955.5

TRAPPC11-208, Transcript of trafficking protein particle complex 11, humanhuman

TSL 2

Gene TRAPPC11, Length 2,342 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC11-208ENST00000511955 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC11-208ENST00000511955 PELI3Q8N2H9 469 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC11-208ENST00000511955 EXD3Q8N9H8 876 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC11-208ENST00000511955 OR4K2Q8NGD2 314 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC11-208ENST00000511955 OR52L2PQ8NGH6 319 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC11-208ENST00000511955 STOML3Q8TAV4 291 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC11-208ENST00000511955 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC11-208ENST00000511955 WFDC5Q8TCV5 224 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC11-208ENST00000511955 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC11-208ENST00000511955 C10orf35Q96D05 121 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC11-208ENST00000511955 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC11-208ENST00000511955 BTN2A3PQ96KV6 586 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC11-208ENST00000511955 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC11-208ENST00000511955 MRI1Q9BV20 369 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC11-208ENST00000511955 SEMA6CQ9H3T2 930 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC11-208ENST00000511955 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC11-208ENST00000511955 SLC25A13Q9UJS0 675 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC11-208ENST00000511955 WASF3Q9UPY6 502 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC11-208ENST00000511955 SIT1Q9Y3P8 196 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC11-208ENST00000511955 SPEGQ15772 3267 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC11-208ENST00000511955 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC11-208ENST00000511955 PRSS46E5RG02 174 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC11-208ENST00000511955 F5H5T6 163 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC11-208ENST00000511955 M0R036 132 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC11-208ENST00000511955 SPAG7O75391 227 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC11-208ENST00000511955 FCN3O75636 299 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC11-208ENST00000511955 CEACAM4O75871 244 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC11-208ENST00000511955 IGHV2-70P01814 119 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC11-208ENST00000511955 CD1EP15812 388 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC11-208ENST00000511955 TSPAN8P19075 237 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC11-208ENST00000511955 MPZP25189 248 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC11-208ENST00000511955 GNPDA1P46926 289 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC11-208ENST00000511955 ARL4DP49703 201 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC11-208ENST00000511955 RAE1P78406 368 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC11-208ENST00000511955 RPL19P84098 196 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC11-208ENST00000511955 TPBGQ13641 420 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC11-208ENST00000511955 CDK10Q15131 360 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC11-208ENST00000511955 FAM182AQ5T1J6 154 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC11-208ENST00000511955 UTF1Q5T230 341 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC11-208ENST00000511955 IDNKQ5T6J7 187 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC11-208ENST00000511955 UBE2UQ5VVX9 321 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC11-208ENST00000511955 TCTN3Q6NUS6 607 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC11-208ENST00000511955 FBXL22Q6P050 247 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC11-208ENST00000511955 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC11-208ENST00000511955 LCTLQ6UWM7 567 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC11-208ENST00000511955 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC11-208ENST00000511955 AHSA2Q719I0 299 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC11-208ENST00000511955 HDDC2Q7Z4H3 204 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC11-208ENST00000511955 TMEM144Q7Z5S9 345 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC11-208ENST00000511955 HAPLN4Q86UW8 402 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC11-208ENST00000511955 Q8N1Y9 231 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC11-208ENST00000511955 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC11-208ENST00000511955 PLA2G15Q8NCC3 412 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC11-208ENST00000511955 PXT1Q8NFP0 134 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC11-208ENST00000511955 OR52I2Q8NH67 350 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC11-208ENST00000511955 MRAPQ8TCY5 172 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC11-208ENST00000511955 SAP25Q8TEE9 199 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC11-208ENST00000511955 IGSF8Q969P0 613 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC11-208ENST00000511955 PTH2Q96A98 100 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC11-208ENST00000511955 TGM7Q96PF1 710 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC11-208ENST00000511955 BTBD10Q9BSF8 475 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC11-208ENST00000511955 NUDT9Q9BW91 350 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC11-208ENST00000511955 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC11-208ENST00000511955 KLHL31Q9H511 634 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC11-208ENST00000511955 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC11-208ENST00000511955 GPR35Q9HC97 309 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC11-208ENST00000511955 C2orf42Q9NWW7 574 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC11-208ENST00000511955 ARL15Q9NXU5 204 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC11-208ENST00000511955 TMEM9Q9P0T7 183 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC11-208ENST00000511955 DEC1Q9P2X7 70 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC11-208ENST00000511955 MYOTQ9UBF9 498 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC11-208ENST00000511955 OR12D3Q9UGF7 316 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC11-208ENST00000511955 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC11-208ENST00000511955 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
TRAPPC11-208ENST00000511955 DENND4CQ5VZ89 1909 aa4.54□□□□□ -1.68
TRAPPC11-208ENST00000511955 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
TRAPPC11-208ENST00000511955 LOC105371242A0A075B767 164 aa4.54□□□□□ -1.68
TRAPPC11-208ENST00000511955 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa4.54□□□□□ -1.68
TRAPPC11-208ENST00000511955 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa4.54□□□□□ -1.68
TRAPPC11-208ENST00000511955 SHISA7A6NL88 538 aa4.54□□□□□ -1.68
TRAPPC11-208ENST00000511955 C9J4A7 227 aa4.54□□□□□ -1.68
TRAPPC11-208ENST00000511955 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
TRAPPC11-208ENST00000511955 RGS11O94810 467 aa4.54□□□□□ -1.68
TRAPPC11-208ENST00000511955 IGLV3-25P01717 112 aa4.54□□□□□ -1.68
TRAPPC11-208ENST00000511955 IGLV3-27P01718 113 aa4.54□□□□□ -1.68
TRAPPC11-208ENST00000511955 T-ENOLP0DO92 83 aa4.54□□□□□ -1.68
TRAPPC11-208ENST00000511955 NELFEP18615 380 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
TRAPPC11-208ENST00000511955 CD33P20138 364 aa4.54□□□□□ -1.68
TRAPPC11-208ENST00000511955 MIPP30301 263 aa4.54□□□□□ -1.68
TRAPPC11-208ENST00000511955 CCR7P32248 378 aa4.54□□□□□ -1.68
TRAPPC11-208ENST00000511955 CD70P32970 193 aa4.54□□□□□ -1.68
TRAPPC11-208ENST00000511955 TIMP3P35625 211 aa4.54□□□□□ -1.68
TRAPPC11-208ENST00000511955 OPRD1P41143 372 aa4.54□□□□□ -1.68
TRAPPC11-208ENST00000511955 RPL35P42766 123 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
TRAPPC11-208ENST00000511955 CYB561P49447 251 aa4.54□□□□□ -1.68
TRAPPC11-208ENST00000511955 ERVK11-1P61568 191 aa4.54□□□□□ -1.68
TRAPPC11-208ENST00000511955 COPZ1P61923 177 aa4.54□□□□□ -1.68
TRAPPC11-208ENST00000511955 RPS7P62081 194 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
TRAPPC11-208ENST00000511955 SEMA3BQ13214 749 aa4.54□□□□□ -1.68
TRAPPC11-208ENST00000511955 FOXE3Q13461 319 aa4.54□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 126.1 ms