RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511807.1

UBE2B-208, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2B, Length 818 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-208ENST00000511807 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa10.07□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 SLC22A20A6NK97 555 aa10.07□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 FTCDNL1E5RQL4 147 aa10.07□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 H0YJX3 145 aa10.07□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 CDC42EP2O14613 210 aa10.07□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 CXCL13O43927 109 aa10.07□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 ASAH2BP0C7U1 165 aa10.07□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 OSMP13725 252 aa10.07□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 ENPP1P22413 925 aa10.07□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 GRPRP30550 384 aa10.07□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 ESRRGP62508 458 aa10.07□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 SIRPAP78324 504 aa10.07□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 LTBQ06643 244 aa10.07□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 FAM27E3Q08E93 113 aa10.07□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 TMEM225Q6GV28 225 aa10.07□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 VWA1Q6PCB0 445 aa10.07□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 PAQR6Q6TCH4 344 aa10.07□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 KLHL17Q6TDP4 642 aa10.07□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa10.07□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 SLC43A2Q8N370 569 aa10.07□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 PARP8Q8N3A8 854 aa10.07□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 CLDN22Q8N7P3 220 aa10.07□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 OR51A7Q8NH64 312 aa10.07□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 OR10D3Q8NH80 312 aa10.07□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 NRG4Q8WWG1 115 aa10.07□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 DNAJA3Q96EY1 480 aa10.07□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 ADGRG7Q96K78 797 aa10.07□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 RDH12Q96NR8 316 aa10.07□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 MOGAT1Q96PD6 335 aa10.07□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 SIGLEC7Q9Y286 467 aa10.07□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 LRRN3E7EW58 273 aa10.06□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa10.06□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 H3BN98 237 aa10.06□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 M0R082 166 aa10.06□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 MSTNO14793 375 aa10.06□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 FZD7O75084 574 aa10.06□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 PTP4A3O75365 173 aa10.06□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 AKR7A3O95154 331 aa10.06□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 NDUFB2O95178 105 aa10.06□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 VAMP5O95183 116 aa10.06□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 INHBBP09529 407 aa10.06□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 ADORA3P0DMS8 318 aa10.06□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 ZP4Q12836 540 aa10.06□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 ANKRD34AQ69YU3 496 aa10.06□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa10.06□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 OR2A2Q6IF42 318 aa10.06□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 SMARCD3Q6STE5 483 aa10.06□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 GALNT5Q7Z7M9 940 aa10.06□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa10.06□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 LRRC17Q8N6Y2 441 aa10.06□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa10.06□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 OR52L1Q8NGH7 329 aa10.06□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 OR13C2Q8NGS9 318 aa10.06□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF417Q8TAU3 575 aa10.06□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 TEX47Q8TBZ9 253 aa10.06□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 STARD4Q96DR4 205 aa10.06□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa10.06□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa10.06□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 GPA33Q99795 319 aa10.06□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 MED18Q9BUE0 208 aa10.06□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 TEX12Q9BXU0 123 aa10.06□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 PRRG4Q9BZD6 226 aa10.06□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF226Q9NYT6 803 aa10.06□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 IL20Q9NYY1 176 aa10.06□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 REV1Q9UBZ9 1251 aa10.06□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 RASD1Q9Y272 281 aa10.06□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 HIF3AQ9Y2N7 669 aa10.06□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 CDH10Q9Y6N8 788 aa10.06□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa10.06□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 AKAP6Q13023 2319 aa10.05□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 TRAV27A0A087WT01 109 aa10.05□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 AQP7P3A6NL99 342 aa10.05□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 H0YC42 278 aa10.05□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 PLPP3O14495 311 aa10.05□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 ARHGEF9O43307 516 aa10.05□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 RNF13O43567 381 aa10.05□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 SMPD2O60906 423 aa10.05□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 MITFO75030 526 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 CRHP06850 196 aa10.05□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 AHCYP23526 432 aa10.05□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 POU1F1P28069 291 aa10.05□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 SLC6A6P31641 620 aa10.05□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 RPL4P36578 427 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 CD79BP40259 229 aa10.05□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 HSPA13P48723 471 aa10.05□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 CRISP1P54107 249 aa10.05□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
UBE2B-208ENST00000511807 H3F3AP84243 136 aa10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.2 ms