RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493923.1

HDAC6-234, Transcript of histone deacetylase 6, humanhuman

TSL 3

Gene HDAC6, Length 404 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6-234ENST00000493923 SSTR2P30874 369 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC6-234ENST00000493923 CHRNB4P30926 498 aa7.39□□□□□ -1.23
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HDAC6-234ENST00000493923 MAN2A2P49641 1150 aa7.39□□□□□ -1.23
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HDAC6-234ENST00000493923 IL1RL1Q01638 556 aa7.39□□□□□ -1.23
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HDAC6-234ENST00000493923 SLC10A1Q14973 349 aa7.39□□□□□ -1.23
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HDAC6-234ENST00000493923 CYP27C1Q4G0S4 372 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC6-234ENST00000493923 KLHL22Q53GT1 634 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC6-234ENST00000493923 UNC50Q53HI1 259 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC6-234ENST00000493923 MEDAGQ5VYS4 303 aa7.39□□□□□ -1.23
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HDAC6-234ENST00000493923 POMZP3Q6PJE2 187 aa7.39□□□□□ -1.23
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HDAC6-234ENST00000493923 SHFQ7M4L6 423 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC6-234ENST00000493923 COMMD6Q7Z4G1 85 aa7.39□□□□□ -1.23
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HDAC6-234ENST00000493923 OR2T11Q8NH01 316 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC6-234ENST00000493923 OR2T29Q8NH02 315 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC6-234ENST00000493923 OR52N1Q8NH53 320 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC6-234ENST00000493923 CLHC1Q8NHS4 586 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC6-234ENST00000493923 RND1Q92730 232 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC6-234ENST00000493923 RIT1Q92963 219 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC6-234ENST00000493923 C14orf79Q96F83 325 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC6-234ENST00000493923 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
HDAC6-234ENST00000493923 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
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HDAC6-234ENST00000493923 PYURFQ96I23 114 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC6-234ENST00000493923 SGCZQ96LD1 299 aa7.39□□□□□ -1.23
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HDAC6-234ENST00000493923 SEC22CQ9BRL7 303 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC6-234ENST00000493923 NTMT1Q9BV86 223 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC6-234ENST00000493923 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
HDAC6-234ENST00000493923 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC6-234ENST00000493923 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
HDAC6-234ENST00000493923 ALKBH4Q9NXW9 302 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC6-234ENST00000493923 SH3BP4Q9P0V3 963 aa7.39□□□□□ -1.23
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HDAC6-234ENST00000493923 V9GYQ6 96 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC6-234ENST00000493923 SPACA6W5XKT8 324 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC6-234ENST00000493923 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP7.39□□□□□ -1.23
HDAC6-234ENST00000493923 ROS1P08922 2347 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC6-234ENST00000493923 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa7.38□□□□□ -1.23
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HDAC6-234ENST00000493923 SLC22A23A1A5C7 686 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC6-234ENST00000493923 ACOT7O00154 380 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC6-234ENST00000493923 SLC28A1O00337 649 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC6-234ENST00000493923 PIP5K1BO14986 540 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC6-234ENST00000493923 CHP2O43745 196 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC6-234ENST00000493923 UGDHO60701 494 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC6-234ENST00000493923 OR4F21O95013 312 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC6-234ENST00000493923 CBX7O95931 251 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC6-234ENST00000493923 TP53P04637 393 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
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HDAC6-234ENST00000493923 CPMP14384 443 aa7.38□□□□□ -1.23
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HDAC6-234ENST00000493923 CALCRP30988 508 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC6-234ENST00000493923 GPC1P35052 558 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC6-234ENST00000493923 FEN1P39748 380 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
HDAC6-234ENST00000493923 PTGDSP41222 190 aa7.38□□□□□ -1.23
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HDAC6-234ENST00000493923 TGM4P49221 684 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC6-234ENST00000493923 XKP51811 444 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC6-234ENST00000493923 RAE1P78406 368 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
HDAC6-234ENST00000493923 NPRL3Q12980 569 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC6-234ENST00000493923 LCP2Q13094 533 aa7.38□□□□□ -1.23
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HDAC6-234ENST00000493923 FGFBP1Q14512 234 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC6-234ENST00000493923 ZNF124Q15973 351 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC6-234ENST00000493923 ETFDHQ16134 617 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC6-234ENST00000493923 EIPR1Q53HC9 387 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC6-234ENST00000493923 C1orf185Q5T7R7 199 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC6-234ENST00000493923 TMEM211Q6ICI0 200 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC6-234ENST00000493923 FAHD1Q6P587 224 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC6-234ENST00000493923 BHLHB9Q6PI77 547 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC6-234ENST00000493923 SCIMPQ6UWF3 145 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC6-234ENST00000493923 JAZF1Q86VZ6 243 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC6-234ENST00000493923 TMEM17Q86X19 198 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC6-234ENST00000493923 NUDT13Q86X67 352 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC6-234ENST00000493923 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
HDAC6-234ENST00000493923 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
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