RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000458294.5

PBRM1-218, Transcript of polybromo 1, humanhuman

TSL 3

Gene PBRM1, Length 476 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1-218ENST00000458294 CEP85LQ5SZL2 805 aa22.65■■□□□ 1.22
PBRM1-218ENST00000458294 MGARPQ8TDB4 240 aa22.65■■□□□ 1.22
PBRM1-218ENST00000458294 ULBP2Q9BZM5 246 aa22.65■■□□□ 1.22
PBRM1-218ENST00000458294 MED29Q9NX70 200 aa22.65■■□□□ 1.22
PBRM1-218ENST00000458294 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
PBRM1-218ENST00000458294 FAM157AC9JC47 383 aa22.64■■□□□ 1.21
PBRM1-218ENST00000458294 UBDO15205 165 aa22.64■■□□□ 1.21
PBRM1-218ENST00000458294 UBL3O95164 117 aa22.64■■□□□ 1.21
PBRM1-218ENST00000458294 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
PBRM1-218ENST00000458294 ALDH3B1P43353 468 aa22.64■■□□□ 1.21
PBRM1-218ENST00000458294 WDR4P57081 412 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
PBRM1-218ENST00000458294 NCALDP61601 193 aa22.64■■□□□ 1.21
PBRM1-218ENST00000458294 RAB1AP62820 205 aa22.64■■□□□ 1.21
PBRM1-218ENST00000458294 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa22.64■■□□□ 1.21
PBRM1-218ENST00000458294 MIER2Q8N344 545 aa22.64■■□□□ 1.21
PBRM1-218ENST00000458294 OR6N1Q8NGY5 312 aa22.64■■□□□ 1.21
PBRM1-218ENST00000458294 FOXB1Q99853 325 aa22.64■■□□□ 1.21
PBRM1-218ENST00000458294 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa22.64■■□□□ 1.21
PBRM1-218ENST00000458294 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
PBRM1-218ENST00000458294 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa22.64■■□□□ 1.21
PBRM1-218ENST00000458294 ZNF224Q9NZL3 707 aa22.64■■□□□ 1.21
PBRM1-218ENST00000458294 SELENONQ9NZV5 590 aa22.64■■□□□ 1.21
PBRM1-218ENST00000458294 ZNF726A6NNF4 738 aa22.63■■□□□ 1.21
PBRM1-218ENST00000458294 BGLAPP02818 100 aa22.63■■□□□ 1.21
PBRM1-218ENST00000458294 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
PBRM1-218ENST00000458294 SEC24CP53992 1094 aa22.63■■□□□ 1.21
PBRM1-218ENST00000458294 PUDPQ08623 228 aa22.63■■□□□ 1.21
PBRM1-218ENST00000458294 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
PBRM1-218ENST00000458294 SLC2A7Q6PXP3 512 aa22.63■■□□□ 1.21
PBRM1-218ENST00000458294 NHLRC1Q6VVB1 395 aa22.63■■□□□ 1.21
PBRM1-218ENST00000458294 CROCCP2Q86T23 111 aa22.63■■□□□ 1.21
PBRM1-218ENST00000458294 COMTD1Q86VU5 262 aa22.63■■□□□ 1.21
PBRM1-218ENST00000458294 CARM1Q86X55 608 aa22.63■■□□□ 1.21
PBRM1-218ENST00000458294 KRT73Q86Y46 540 aa22.63■■□□□ 1.21
PBRM1-218ENST00000458294 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa22.63■■□□□ 1.21
PBRM1-218ENST00000458294 OR51F2Q8NH61 342 aa22.63■■□□□ 1.21
PBRM1-218ENST00000458294 TXNDC15Q96J42 360 aa22.63■■□□□ 1.21
PBRM1-218ENST00000458294 ZNF416Q9BWM5 594 aa22.63■■□□□ 1.21
PBRM1-218ENST00000458294 ZNF385DQ9H6B1 395 aa22.63■■□□□ 1.21
PBRM1-218ENST00000458294 NARFLQ9H6Q4 476 aa22.63■■□□□ 1.21
PBRM1-218ENST00000458294 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
PBRM1-218ENST00000458294 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
PBRM1-218ENST00000458294 SLC7A8Q9UHI5 535 aa22.63■■□□□ 1.21
PBRM1-218ENST00000458294 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
PBRM1-218ENST00000458294 ARAFP10398 606 aa22.62■■□□□ 1.21
PBRM1-218ENST00000458294 LSP1P33241 339 aa22.62■■□□□ 1.21
PBRM1-218ENST00000458294 GIPRP48546 466 aa22.62■■□□□ 1.21
PBRM1-218ENST00000458294 AQP5P55064 265 aa22.62■■□□□ 1.21
PBRM1-218ENST00000458294 PMS2P3Q13401 168 aa22.62■■□□□ 1.21
PBRM1-218ENST00000458294 CAMK2DQ13557 499 aa22.62■■□□□ 1.21
PBRM1-218ENST00000458294 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
PBRM1-218ENST00000458294 PXKQ7Z7A4 578 aa22.62■■□□□ 1.21
PBRM1-218ENST00000458294 LRP11Q86VZ4 500 aa22.62■■□□□ 1.21
PBRM1-218ENST00000458294 NFKBIDQ8NI38 313 aa22.62■■□□□ 1.21
PBRM1-218ENST00000458294 RNF217Q8TC41 542 aa22.62■■□□□ 1.21
PBRM1-218ENST00000458294 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
PBRM1-218ENST00000458294 LRRC37BQ96QE4 947 aa22.62■■□□□ 1.21
PBRM1-218ENST00000458294 OR52B2Q96RD2 323 aa22.62■■□□□ 1.21
PBRM1-218ENST00000458294 TMEM27Q9HBJ8 222 aa22.62■■□□□ 1.21
PBRM1-218ENST00000458294 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
PBRM1-218ENST00000458294 A0A0B4J2E0 115 aa22.61■■□□□ 1.21
PBRM1-218ENST00000458294 A0A1B0GX12 115 aa22.61■■□□□ 1.21
PBRM1-218ENST00000458294 GAAP10253 952 aa22.61■■□□□ 1.21
PBRM1-218ENST00000458294 GCNT6Q5T4J0 391 aa22.61■■□□□ 1.21
PBRM1-218ENST00000458294 REEP3Q6NUK4 255 aa22.61■■□□□ 1.21
PBRM1-218ENST00000458294 MAVSQ7Z434 540 aa22.61■■□□□ 1.21
PBRM1-218ENST00000458294 YIPF5Q969M3 257 aa22.61■■□□□ 1.21
PBRM1-218ENST00000458294 MOGAT1Q96PD6 335 aa22.61■■□□□ 1.21
PBRM1-218ENST00000458294 LPAR2Q9HBW0 351 aa22.61■■□□□ 1.21
PBRM1-218ENST00000458294 A0A1W2PPW3 197 aa22.6■■□□□ 1.21
PBRM1-218ENST00000458294 TMEM120BA0PK00 339 aa22.6■■□□□ 1.21
PBRM1-218ENST00000458294 PPIHO43447 177 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
PBRM1-218ENST00000458294 COMPP49747 757 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
PBRM1-218ENST00000458294 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
PBRM1-218ENST00000458294 CDK6Q00534 326 aa22.6■■□□□ 1.21
PBRM1-218ENST00000458294 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa22.6■■□□□ 1.21
PBRM1-218ENST00000458294 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
PBRM1-218ENST00000458294 WDFY1Q8IWB7 410 aa22.6■■□□□ 1.21
PBRM1-218ENST00000458294 TEX29Q8N6K0 151 aa22.6■■□□□ 1.21
PBRM1-218ENST00000458294 TMEM43Q9BTV4 400 aa22.6■■□□□ 1.21
PBRM1-218ENST00000458294 TREM2Q9NZC2 230 aa22.6■■□□□ 1.21
PBRM1-218ENST00000458294 DUSP13Q9UII6 198 aa22.6■■□□□ 1.21
PBRM1-218ENST00000458294 FZR1Q9UM11 496 aa22.6■■□□□ 1.21
PBRM1-218ENST00000458294 TENM1Q9UKZ4 2725 aa22.59■■□□□ 1.21
PBRM1-218ENST00000458294 TRAV20A0A0B4J274 112 aa22.59■■□□□ 1.21
PBRM1-218ENST00000458294 PRORSD1PA6NEY8 169 aa22.59■■□□□ 1.21
PBRM1-218ENST00000458294 PLPP3O14495 311 aa22.59■■□□□ 1.21
PBRM1-218ENST00000458294 WNT9BO14905 357 aa22.59■■□□□ 1.21
PBRM1-218ENST00000458294 TPST1O60507 370 aa22.59■■□□□ 1.21
PBRM1-218ENST00000458294 CSNK1A1P48729 337 aa22.59■■□□□ 1.21
PBRM1-218ENST00000458294 ACTG1P63261 375 aa22.59■■□□□ 1.21
PBRM1-218ENST00000458294 RAB39AQ14964 217 aa22.59■■□□□ 1.21
PBRM1-218ENST00000458294 OR1Q1Q15612 314 aa22.59■■□□□ 1.21
PBRM1-218ENST00000458294 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
PBRM1-218ENST00000458294 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
PBRM1-218ENST00000458294 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
PBRM1-218ENST00000458294 EVA1AQ9H8M9 152 aa22.59■■□□□ 1.21
PBRM1-218ENST00000458294 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa22.59■■□□□ 1.21
PBRM1-218ENST00000458294 DYSFO75923 2080 aa22.58■■□□□ 1.21
PBRM1-218ENST00000458294 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46 ms