RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452612.5

TTC28-AS1-217, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene TTC28-AS1, Length 746 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-217ENST00000452612 NR4A1P22736 598 aa11.19□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-217ENST00000452612 PPIBP23284 216 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-217ENST00000452612 AHCYP23526 432 aa11.19□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-217ENST00000452612 SLC6A2P23975 617 aa11.19□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-217ENST00000452612 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-217ENST00000452612 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-217ENST00000452612 CDH12P55289 794 aa11.19□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-217ENST00000452612 PUDPQ08623 228 aa11.19□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-217ENST00000452612 SQLEQ14534 574 aa11.19□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-217ENST00000452612 LINC01356Q8N9X3 169 aa11.19□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-217ENST00000452612 SMYD1Q8NB12 490 aa11.19□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-217ENST00000452612 OR6N1Q8NGY5 312 aa11.19□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-217ENST00000452612 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-217ENST00000452612 SLC41A3Q96GZ6 507 aa11.19□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-217ENST00000452612 C1orf159Q96HA4 380 aa11.19□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-217ENST00000452612 ZNF75AQ96N20 296 aa11.19□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-217ENST00000452612 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa11.19□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-217ENST00000452612 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa11.19□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-217ENST00000452612 ZNF224Q9NZL3 707 aa11.19□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-217ENST00000452612 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-217ENST00000452612 FZR1Q9UM11 496 aa11.19□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-217ENST00000452612 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa11.18□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-217ENST00000452612 PRORSD1PA6NEY8 169 aa11.18□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-217ENST00000452612 M0R233 179 aa11.18□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-217ENST00000452612 M0R3H8 397 aa11.18□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-217ENST00000452612 PATE4P0C8F1 98 aa11.18□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-217ENST00000452612 ZNF35P13682 527 aa11.18□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-217ENST00000452612 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-217ENST00000452612 SRP14P37108 136 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-217ENST00000452612 ALDH3B1P43353 468 aa11.18□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-217ENST00000452612 GIPRP48546 466 aa11.18□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-217ENST00000452612 IDH3AP50213 366 aa11.18□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-217ENST00000452612 SEC24CP53992 1094 aa11.18□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-217ENST00000452612 RIN1Q13671 783 aa11.18□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-217ENST00000452612 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-217ENST00000452612 AGKQ53H12 422 aa11.18□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-217ENST00000452612 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-217ENST00000452612 RINLQ6ZS11 566 aa11.18□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-217ENST00000452612 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-217ENST00000452612 LRP11Q86VZ4 500 aa11.18□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-217ENST00000452612 ARMC8Q8IUR7 673 aa11.18□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-217ENST00000452612 SCAIQ8N9R8 606 aa11.18□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-217ENST00000452612 OR6S1Q8NH40 331 aa11.18□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-217ENST00000452612 LRR1Q96L50 414 aa11.18□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-217ENST00000452612 C7orf26Q96N11 449 aa11.18□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-217ENST00000452612 ZNF607Q96SK3 696 aa11.18□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-217ENST00000452612 FOXB1Q99853 325 aa11.18□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-217ENST00000452612 TMEM38AQ9H6F2 299 aa11.18□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-217ENST00000452612 NARFLQ9H6Q4 476 aa11.18□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-217ENST00000452612 SLC52A3Q9NQ40 469 aa11.18□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-217ENST00000452612 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-217ENST00000452612 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-217ENST00000452612 REV1Q9UBZ9 1251 aa11.18□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-217ENST00000452612 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-217ENST00000452612 NOX1Q9Y5S8 564 aa11.18□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-217ENST00000452612 ANK2Q01484 3957 aa11.17□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-217ENST00000452612 EVPLLA8MZ36 301 aa11.17□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-217ENST00000452612 PLPP3O14495 311 aa11.17□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-217ENST00000452612 SYNGR3O43761 229 aa11.17□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-217ENST00000452612 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-217ENST00000452612 SERPINB7O75635 380 aa11.17□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-217ENST00000452612 MFN2O95140 757 aa11.17□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-217ENST00000452612 RAB36O95755 333 aa11.17□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-217ENST00000452612 HPXP02790 462 aa11.17□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-217ENST00000452612 OPN1SWP03999 348 aa11.17□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-217ENST00000452612 ADORA3P0DMS8 318 aa11.17□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-217ENST00000452612 GPX2P18283 190 aa11.17□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-217ENST00000452612 CSNK1A1P48729 337 aa11.17□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-217ENST00000452612 CDH15P55291 814 aa11.17□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-217ENST00000452612 BIDP55957 195 aa11.17□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-217ENST00000452612 RAB1AP62820 205 aa11.17□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-217ENST00000452612 GALK2Q01415 458 aa11.17□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-217ENST00000452612 RAB39AQ14964 217 aa11.17□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-217ENST00000452612 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-217ENST00000452612 ELFN2Q5R3F8 820 aa11.17□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-217ENST00000452612 LIPNQ5VXI9 398 aa11.17□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-217ENST00000452612 NHLRC1Q6VVB1 395 aa11.17□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-217ENST00000452612 PXKQ7Z7A4 578 aa11.17□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-217ENST00000452612 CARM1Q86X55 608 aa11.17□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-217ENST00000452612 HIPK4Q8NE63 616 aa11.17□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-217ENST00000452612 OR5J2Q8NH18 312 aa11.17□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-217ENST00000452612 HPS1Q92902 700 aa11.17□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-217ENST00000452612 MCHR1Q99705 422 aa11.17□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-217ENST00000452612 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-217ENST00000452612 ANGPT4Q9Y264 503 aa11.17□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-217ENST00000452612 SPEF1Q9Y4P9 236 aa11.17□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-217ENST00000452612 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-217ENST00000452612 TCF21O43680 179 aa11.16□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-217ENST00000452612 OR6A2O95222 327 aa11.16□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-217ENST00000452612 TGDSO95455 350 aa11.16□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-217ENST00000452612 COL8A2P25067 703 aa11.16□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-217ENST00000452612 GLRXP35754 106 aa11.16□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-217ENST00000452612 EVX1P49640 407 aa11.16□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-217ENST00000452612 MELKQ14680 651 aa11.16□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-217ENST00000452612 ALKBH6Q3KRA9 238 aa11.16□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-217ENST00000452612 ZNF627Q7L945 461 aa11.16□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-217ENST00000452612 SNX32Q86XE0 403 aa11.16□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-217ENST00000452612 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-217ENST00000452612 FGFBP3Q8TAT2 258 aa11.16□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-217ENST00000452612 LRRC8CQ8TDW0 803 aa11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms